Evolution
Daniel H. Chitwood(2014.10, PLOS ONE)[Imitation, Genetic Lineages, and Time Influenced the Morphological Evolution of the Violin] 理由 こないだ参加した勉強会で紹介されてた 概要 バイオリンの設計は16世紀のイタリアで最初の楽器が作られてから変…
Joyce, G. (2002.7, Nature)[The antiquity of RNA-based evolution.] 理由 こないだ参加した学会で出てきた 概要 現在地球に存在することが知られている全ての生物と、地質記録で証拠が存在する生物は、DNAゲノムとタンパク質酵素に基づく同じ形態を示すよ…
Jeff Jones(2010.4, Artificial Life)[Characteristics of Pattern Formation and Evolution in Approximations of Physarum Transport Networks] 理由 アリの輸送ネットワークの論文を紹介したら、後輩が教えてくれた 概要 パターン形成の多くの研究は、複…
Ole Seehausen;...;Alex Widmer(2014.2, Nature Reviews Genetics)[Genomics and the origin of species] 理由 ラボで話してるときに出てきたんだっけ 概要 種分化は基礎的な進化過程であり、その知見は生物多様性の起源を理解するのに重要である。この研究…
Joerg A. Fritz;...;Michael P. Brenner(2014.4, Nature Communications)[Shared developmental programme strongly constrains beak shape diversity in songbirds] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 鳥のくちばしの形の驚くべき多様性は自然選択の結果であ…
Robert S. Sansom:...:Mark A. Purnell(2010.10, Proc. R. Soc. B.)[Decay of vertebrate characters in hagfish and lamprey (Cyclostomata) and the implications for the vertebrate fossil record] 理由 進化のセミナーで出てきて面白そうだったので 概要…
David M. Edwards;...;Iain G. Johnston(2021.4, PLOS BIOLOGY)[Avoiding organelle mutational meltdown across eukaryotes with or without a germline bottleneck] 理由 ラボSlackにて 概要 ミトコンドリアDNA(mtDNA)とプラスチドDNA(ptDNA)は、重要な生…
Paul E. Smaldino and Richard McElreath(2016.9, Royal society open science)[The natural selection of bad science] 理由 ザビーネ・ホッセンフェルダー「数学に魅せられて、科学を見失う」で出てきた論文 概要 悪い研究デザインやデータ解析は誤検出の…
Claudia Igler;...;Roland Regoes(2021.5, eLife)[Multi-step vs. single-step resistance evolution under different drugs, pharmacokinetics and treatment regimens] 理由 あれ、どこで見つけたんだっけ、Twitter? 概要 微生物防止処理の成功は、薬剤抵…
John L. Bowman;...; Tom Dierschke(2016.11, Annual Review of Genetics)[Evolution in the Cycles of Life] 理由 Slackで流れてきた 概要 真核生物の生活環は、半数体と倍数体の段階の間で変化する。これらはそれぞれ、減数分裂と融合によって開始される。…
Xia Wang and Julia A. Clarke(2015.10, Proccedings of the royal society B)[The evolution of avian wing shape and previously unrecognized trends in covert feathering] 理由 論文紹介で読むやつの参考文献になってたやつ 概要 鳥の羽の形は飛行能力…
Douglas B. Booher;...;Evan P. Economo(2021.3, PLOS BIOLOGY)[Functional innovation promotes diversification of form in the evolution of an ultrafast trap-jaw mechanism in ants] 理由 ラボSlack 概要 進化的革新は生命史における2つの長期的な傾向…
András Szilágyi;...;Eörs Szathmáry(2020.11, PLoS Comp. Bio.)[Phenotypes to remember: Evolutionary developmental memory capacity and robustness] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 進化的な学習から生じる発生的な記憶の可能性が発見されている。遺…
ArnaudMartin;...;Nipam H.Patel(2016.1, Current Biology)[CRISPR/Cas9 Mutagenesis Reveals Versatile Roles of Hox Genes in Crustacean Limb Specification and Evolution] 理由 Twitterで流れてきた 概要 甲殻類は特殊化された脚の多様な配列を所有する…
Heather S. Bruce;...;Nipam H. Patel(nature ecology &evolution)[Knockout of crustacean leg patterning genes suggests that insect wings and body walls evolved from ancient leg segments] 理由 Twitterで流れてきた気がする 概要 昆虫の翅の起源は…
Y. Oba;...;T. Shirai(2020.12, Science Advances)[Resurrecting the ancient glow of the fireflies] 理由 Twitterで流れてきた 概要 ホタルの生物発光の色は、ルシフェラーゼの構造によって決定される。ホタルのルシフェラーゼ遺伝子は30種以上で単離され…
R. M. Fisher;..;J. J. Boomsma(2020.7, Proceedings B)[The evolution of multicellularcomplexity: the role of relatedness and environmental constraints] 理由 ラボSlackシリーズ 概要 進化生物学における大きな問題は、粘菌から脊椎動物まで多くの独…
Jennifer T.Pentz;...;William C.Ratcliff(2020.11, Current biology)[Ecological Advantages and Evolutionary Limitations of Aggregative Multicellular Development] 理由 ラボSlackに落ちてた気がする 概要 全ての多細胞生物は1つか2つの基本的な道筋を…
Tomohiko Kuwabara; Kensuke Igarashi(2020.5, Journal of Theoretical Biology)[Thermotogales origin scenario of eukaryogenesis] 理由 自分の専門分野の最近の論文を読むことにした 概要 真核生物がどのように生まれたのか、は進化生物学の一つの謎であ…
Richard Bailleul;..;Jonathan Touboul(2020.7, Cell)[A “Numerical Evo-Devo” Synthesis for the Identification of Pattern-Forming Factors] 理由 ラボSlackに流れてきたよ 概要 動物たちは彼らの衣服を飾るモチーフにおける広い多様性を示すが、これらの…
Tatyana Radoeva;...; DolfWeijers(2019.9, Developmental cell)[Evolution, Initiation, and Diversity in Early Plant Embryogenesis] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 植物における胚発生の間、細胞の同一性は、単細胞のころから始まる最初から特定され…
P.Hogeweg(1994.8, Physica D: Nonlinear Phenomena)[Multilevel evolution: replicators and the evolution of diversity] 理由 金子邦彦「生命とは何か」の参考文献 概要 ここでは、進化の研究における最初の目的を多段階の過程として報告する。これは、異…
T. Alexander Dececchi;...Hans C. E. Larsson(2020.5, PLOS ONE)[The fast and the frugal: Divergent locomotory strategies drive limb lengthening in theropod dinosaurs] 理由 これもラボSlackに落ちてたやつかな 概要 脚の長さと歩行性そしてスピード…
Guanglu Zhang;...;Daniel A. McAdams(2019.6, PLOS ONE)[A case against the trickle-down effect in technology ecosystems] 理由 ラボSlack に流れてきた、はず 概要 技術的な進化は時間と共に技術的性能の変化を記述する。技術的な進歩は、合理的なR&D標…
Chang C;...;Chuong CM(2009.1, The International Journal of Developmental Biology,)[Reptile scale paradigm: Evo-Devo, pattern formation and regeneration.] 理由 どこで見つけたかのか、もう忘れてしまったけどストックしてたやつ 概要 この展望の目…
Matthew D. Herron;...;William C. Ratcliff(2019.2, Scientific reports)[De novo origins of multicellularity in response to predation] 理由 これも確かラボSlack...? 概要 単細胞生物から多細胞生物への転換は、進より複雑な生物系に進化する新たな機…
Yuuki Matsushita; Kunihiko Kaneko(2019.12, arXiv)[Homeorhesis in Waddington's Landscape by Epigenetic Feedback Regulation] 理由 金子先生シリーズ 概要 多細胞生物において、初期発生期に細胞は異なる様々な種類に分化する。それぞれの細胞種の割合…
Chikara Furusawa;Kunihiko Kaneko(2015.2, Journal of The Royal Society Interface)[Global Relationships in Fluctuation and Response in Adaptive Evolution] 理由 金子先生シリーズ。あと残り2回 概要 細胞は自身の内部状態を変えて環境変化に適応し、…
Takuya U. Sato, Kunihiko Kaneko(2019.10, arXiv)[Evolutionary dimension reduction in phenotypic space] 理由 金子先生シリーズ2 概要 一般的に、細胞要素の濃度によって測定されるものである細胞の表現型は自由度が非常に大きい。しかしながら、最近の…
Laura A.Sena; Navdeep S.Chandel(2012.10, Molecular Cell)[Physiological Roles of Mitochondrial Reactive Oxygen Species] 理由 進化の勉強しようと思った時のやつ 概要 歴史的に、ミトコンドリア活性酸素(mROS)は生理学的機能はなく、もっぱら細胞ダメ…
