Oscillation
J. D. Murray(1974.1, J. Chem. Phys.)[On a model for the temporal oscillations in the Belousov‐Zhabotinsky reaction] 理由 博論の参考文献 概要 Field, Körös, Noyesによって提案されたベロウソフ-ジャボチンスキー反応における時間的振動の詳細な化学…
Kwang-Tao Chou;...;Gürol M.Süel(2022.1, Cell)[A segmentation clock patterns cellular differentiation in a bacterial biofilm] 理由 家の修理を頼んでいる間にあまり集中できないので、溜まっていた論文を読む。 概要 発生中に分節化を示す多細胞生物…
Yoshiaki Tsushima;...;Hiroshi Ando(2021.8, frontiers in Neuroscience)[Olfactory Stimulation Modulates Visual Perception Without Training] 理由 Twitterで流れてきておもしろそうだったので 概要 多くの研究から、嗅覚刺激は感情のような高次の認知…
Akihiro Isomura, Ryoichiro Kageyama(2014 Development)[Ultradian oscillations and pulses: coordinating cellular responses and cell fate decisions] 理由 自分の研究関連 概要 生物学時計は、個体発生、恒常性そして機能に重要な役割を果たす。近年、…
Erik Clark(2020.12, bioRxiv)[Time and Space in Segmentation] 理由 ラボSlackに来たやつ 概要 節足動物の体節化と脊椎動物の体節形成は、発生のパターニングの実験と理論の疑問における主要分野である。しかしながら、最近の研究が複雑化してきたにも関わ…
Kaier Wang;....;Yoichi Shiraishi(2014.4, BMC Systems Biology)[Simulations of pattern dynamics for reaction-diffusion systems via SIMULINK] 理由 反応拡散系の勉強 概要 背景 反応拡散系の非線形パターン動態の研究は、ほとんどいつも定義する微分方…
Akihiro Isomura, Ryoichiro Kageyama(2014 Development)[Ultradian oscillations and pulses: coordinating cellular responses and cell fate decisions] 理由 実験医学数理モデル特集の第4章4. 「炎症シグナルにおけるp38活性オシレーションの解析」の参…
Francesco Montefuscoa;...;Morten G. Pedersena(2019.10, JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY)[Heterogeneous alpha-cell population modeling ofglucose-induced inhibition of electrical activity] 理由 JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGYで実習に近い論文が…
CHRISTIAN HEINTZEN;...;DOROTHEE STAIGER(1997, Proc. Natl. Acad. Sci. USA)[AtGRP7, a nuclear RNA-binding protein as a component of a circadian-regulated negative feedback loop in Arabidopsis thaliana] 理由 植物の周期について 概要 概日リズム…
Sabrina E. Sanchez;...;Marcelo J. Yanovsky(2010.11, nature)[A methyl transferase links the circadian clock to the regulation of alternative splicing] 理由 概日時計について調べてた頃の名残 概要 生物は、概日リズムによって生物学的過程を昼夜サ…
Chiraj K. Dalal;...;Michael B. Elowitz(2014.9, Current Biology)[Pulsatile Dynamicsin the Yeast Proteome] 理由 実習で使う論文 概要 環境条件に応答する転写因子の活性は、細胞制御の基本である。最近の研究によって、転写因子のなかには一定の環境下…
Xiaojing J. Gao;...;Michael B. Elowitz(2018.9, Science)[Programmable protein circuits in living cells] 理由 実習関連 概要 合成的なタンパクレベルの回路は、強力かつ新しい細胞のふるまいの制御を可能にする。理論的なタンパク回路設計は、構成可能…
Yihan Lin;...;& Michael B. Elowitz(2015, NATURE)[Combinatorial gene regulation by modulation of relative pulse timing] 理由 実習関連 概要 個々の生細胞の研究によって、同じ細胞の中で多くの転写因子が動的に活性化し、しばしば確率的にパルスを出…
Jin Park;...;Michael B. Elowitz(2018.3, Cell System)[Molecular Time Sharing through Dynamic Pulsing in Single Cells] 理由 実習で使いそう 概要 細胞内では、特異制御因子が限られた主要な酵素資源量をとりあっている。元来、競争によって一定量の制…
Patrice A. Salome;C. Robertson McClung(2005.3, American Society of Plant Biologists)[PSEUDO-RESPONSE REGULATOR 7 and 9 Are Partially Redundant Genes Essential for the Temperature Responsiveness of the Arabidopsis Circadian Clock] 理由 植物…
David Alabadı́;...;Steve A.Kay(2002.4, Current Biology)[Critical Role for CCA1 and LHY in Maintaining Circadian Rhythmicity in Arabidopsis] 理由 植物の振動 概要 概日時計は自己調節的で内在的なメカニズムであり、これによって、バクテリアから人…
Herman Wijnen and Michael W. Young(The Annual Review of Genetics, 2006)[Interplay of Circadian Clocks and Metabolic Rhythms] 理由 植物の周期 概要 この総説では、概日的かつ代謝的なリズム間の連結を調べる。よく調べられた生物の幅広く多様な例を…
CH Johnson;...;A Trewavas(1995.9, Science)[Circadian oscillations of cytosolic and chloroplastic free calcium in plants] 理由 植物の振動について 概要 タバコとシロイヌナズナなどの植物で、カルシウム感受性蛍光タンパク質アポエクオリンの導入遺…
Woe-Yeon Kim;...; David E. Somers(2007.8, nature)[ZEITLUPE is a circadian photoreceptor stabilized by GIGANTEA in blue light] 理由 植物の周期に関して知りたくなったので 概要 概日時計は多くの重要な細胞過程の適切な位相づけるを調節するのに必須…
Antony N. Dodd;...; Andrew J. M(2005.7, Science)[Plant Circadian Clocks Increase Photosynthesis, Growth, Survival, and Competitive Advantage] 理由 こないだ植物にも周期があるという話をきいたので 概要 概日時計は植物に利点を与えると信じられて…
Anna Lisa Stöckl;...;Dan-Eric Nilsson(2011.11, PLOS ONE)[Setting the Pace: New Insights into Central Pattern Generator Interactions in Box Jellyfish Swimming] 理由 ラボセミナーで紹介されていたので 概要 中枢パターン発生器(CPG)は全ての動物界…
Labhart, T;...;Meyer, EP(1999.12)[Detectors for polarized skylight in insects: A survey of ommatidial specializations in the dorsal rim area of the compound eye] 理由 oscillation6。 概要 太陽から離れて、空の局在パターンは昆虫に視覚的なコン…
Huppop, O;...;Huppop, K(2003.2)[North Atlantic Oscillation and timing of spring migration in birds] 理由 oscillation5。 概要 渡り鳥はここ40年変わらない方法とサンプリング効果で1909年から北海の南西のヘルゴランド島で捕まえられてきた。短距離、…
Alvarez-Filip, Lorenzo;...;Watkinson, Andrew R.(2009.8)[Flattening of Caribbean coral reefs: region-wide declines in architectural complexity] 理由 oscillationシリーズ4 概要 サンゴ礁は生物多様性が豊富である。その主な理由はそれらの複雑な構…
Malhi, Y;...;Wright, J(2004.3)[Spatial patterns and recent trends in the climate of tropical rainforest regions] 理由 Oscillationシリーズ3 概要 森林被覆のカラーマップと気候学的なデータベースを用いて、1960-1998の期間の熱帯雨林領域の平均気温…
Geyer, Hartmut;...;Blickhan, Reinhard(2006.11)[Compliant leg behaviour explains basic dynamics of walking and running] 理由 oscillation論文二つ目。 概要 ヒトの運動の基本メカニズムは、歩行における剛直な脚の跳躍と走行における対応性脚の反跳に…
Thomas, AP;...;Putney, JW(1996.11)[Spatial and temporal aspects of cellular calcium signaling] 理由 修論発表を聞いて生物学の"振動現象"が気になってきたので 概要 細胞基質のCa2+シグナルは持続型刺激条件下でさえもしばしば複雑な時空間パターンを…
