Pattern formation
Sai Tang;...;Yaohe Zhou(2014.1, Phys. Rev. E)[Phase-field-crystal simulation of nonequilibrium crystal growth] 理由 自分の発表で使いたい資料 概要 フェーズフィールド結晶モデルによって、平衡な結晶形や樹状形、球状の結晶形の結晶成長の形の遷移…
Vogelsberger, M.,... Ewald P (2022.1, Nat Rev Phys )[Cosmological simulations of galaxy formation.] 理由 自分のセミナーで使いたい資料 概要 近年数十年間、銀河形成の宇宙シミュレーションは宇宙における構造と銀河形成の理解を進めるのに役立ってい…
C. C. Lin & G. Bertin (1985, International Astronomical Union)[Formation and Maintenance of Spiral Structure in Galaxies.] 理由 博論の参考文献 概要 銀河における螺旋構造の形成と維持を、準定常的な螺旋構造の仮説と一致する一般認識で螺旋モード…
Keiko U. Torii(2012.8, Trends in Cell Biology)[Two-dimensional spatial patterning in developmental systems] 理由 自分の研究関連 概要 多細胞生物は、特殊化した細胞種をもつ複雑な組織を生み出す。動物の発生中に、膨大な細胞間相互作用が、接触依存…
Jinxi Li;...;Sijia Wang(2022.1, Cell)[Limb development genes underlie variationin human fingerprint patterns] 理由 Twitterで見かけた気がする 概要 指紋は長く実用的かつ文化的に高い関心を集めているが、その多様性の根底にあるメカニズムはほとん…
Chiara A.Airoldi;...;SarahRobinson(2021.9, Cell Reports)[Mechanical buckling can pattern the light-diffracting cuticle of Hibiscus trionum] 理由 これもラボSlack 概要 多くの種は、送粉者誘導から表面の濡れ性まで幅広い役割を果たす上皮の縞を持…
Yipei Guo;...;Michael P. Brenner(2021.11, PLoS Comp. BIol.)[Programming cell growth into different cluster shapes using diffusible signals] 理由 これもたしかラボSlack 概要 遺伝子工学技術における進歩により、人工遺伝子回路の構築が可能になっ…
Harry Klein;..;Madelaine Bartlett(2022.1, PNAS)[Recruitment of an ancient branching program to suppress carpel development in maize flowers] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 トウモロコシの心皮は、穂に付く花の半分と全ての花でプログラム細胞死…
Kwang-Tao Chou;...;Gürol M.Süel(2022.1, Cell)[A segmentation clock patterns cellular differentiation in a bacterial biofilm] 理由 家の修理を頼んでいる間にあまり集中できないので、溜まっていた論文を読む。 概要 発生中に分節化を示す多細胞生物…
Jeff Jones(2010.4, Artificial Life)[Characteristics of Pattern Formation and Evolution in Approximations of Physarum Transport Networks] 理由 アリの輸送ネットワークの論文を紹介したら、後輩が教えてくれた 概要 パターン形成の多くの研究は、複…
Tanya Latty;...;Martin Middendorf(2011.2, J. R. Soc. Interface)[Structure and formation of ant transportation networks] 理由 助教が教えてくれた面白そうな論文 概要 多くの生物システムは物資や情報の輸送に大規模なネットワークを使う。アリも例外…
Yanyan Chen,Javier Buceta(2019.8, PLOS ONE)[A non-linear analysis of Turing pattern formation] 理由 パタン形成の復習 概要 反応拡散案は多様な分野で現象をモデル化し解釈するのに広く用いられている。この文脈で、チューリング不安定性で駆動される…
Kazuaki Amikura;...;Miho S. Kitazawa (2021.7, Scientific Reports)[Discovery of spatial pattern of prickles on stem of Rosa hybrida ‘Red Queen’ and mathematical model of the pattern] 理由 昔bioRxiv版を論文紹介したやつが査読を通ったようなの…
Allen R. Sanderson;...;Lingfa Yang(2006, Journal of Graphics Tools )[Advanced Reaction-Diffusion Models for Texture Synthesis] 理由 反応拡散の復習 概要 1990年代初頭に反応拡散モデルを用いたテクスチャ号合成が導入されてから、それはまだ広く活…
David A.Young(1984.11, Mathematical Biosciences)[A local activator-inhibitor model of vertebrate skin patterns] 理由 自分の研究関連 概要 脊椎動物の皮膚パターンのモデルは、2種類の拡散性因子(促進因子と抑制因子)を産生する分化した(色のある)色…
Yang Li and Nikolaus Correll(2018.9, bioRxiv)[From Natural to Artificial Camouflage: Components and Systems] 理由 色の変化とかパターンについて調べてて見つけた 概要 作動、受容そして分散コンピューティングを含む生物に誘発される人工カモフラー…
Dae Seok Eom; David M. Parichy(2017.3, Science)[A macrophage relay for long-distance signaling during postembryonic tissue remodeling] 理由 パタン形成と免疫の関係で面白そうだったので 概要 マクロファージは免疫だけでなく、発生や恒常性におい…
Takeo Kuriyama;...;Masami Hasegawa(2006.9, Zoolog Sci.)[Ultrastructure of the dermal chromatophores in a lizard (Scincidae: Plestiodon latiscutatus) with conspicuous body and tail coloration] 理由 自分の研究と関連しそうなので 概要 身体に縞…
Amitava Giri and Sandip Kar(2019.3, The Journal of Chemical Physics)[Unraveling the diverse nature of electric field induced spatial pattern formation in Gray-Scott model] 理由 ラボSlackに来た・・っけ？ 概要 イオン性反応物と自己触媒で構成…
Luciano Marcon;..; Patrick Müller()2016.4, eLife)[High-throughput mathematical analysis identifies Turing networks for patterning with equally diffusing signals] 理由 自分の研究関連 概要 チューリング反応拡散モデルから、同一の細胞がどのよう…
Robert M.Beyer;...;HansPretzsch(2021.3, Journal of Theoretical Biology)[Do trees have constant branch divergence angles?] 理由 気になったやつ 概要 多くの草本植物の特徴は中心の軸に沿った側方器官の驚くほど規則的な配置である。これらの葉序パタ…
Christopher P. Arnold;...;Alejandro Sánchez Alvarado(2021.1, bioRxiv)[Hox genes regulate asexual reproductive behavior and tissue segmentation in adult animals] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 Hox遺伝子は、胚の前後(A/P)軸の分節パターニ…
Erik Clark(2020.12, bioRxiv)[Time and Space in Segmentation] 理由 ラボSlackに来たやつ 概要 節足動物の体節化と脊椎動物の体節形成は、発生のパターニングの実験と理論の疑問における主要分野である。しかしながら、最近の研究が複雑化してきたにも関わ…
Valeria V. Isaeva;...;Nickolay V. Kasyanov (2021.1, Symmetry)[Symmetry Transformations in Metazoan Evolution and Development] 理由 ラボSlackに流れ着いたやつ 概要 この総説では、後生動物の進化と発生、遺伝的基盤そして異なる軸のボディプランの…
Lior Strinkovsky;...; Yonatan Savir(2021.1, eLife)[Spatial correlations constrain cellular lifespan and pattern formation in corneal epithelium homeostasis] 理由 Slackで流れてきたんだっけな 概要 成体組織における恒常性は、幹細胞やそれらの前…
Sourav Kumar Sasmal;...;Yasuhiro Takeuchi(2019.5, Mathematical Biosciences and Engineering)[Dynamics and spatio-temporal patterns in a prey–predator system with aposematic prey] 理由 警告色が面白いなって思って探したやつ 概要 被食者の警告時…
Shigeru Kondo; Hideaki Shirota(2008.10, Seminars in Cell & Developmental Biology)[Theoretical analysis of mechanisms that generate the pigmentation pattern of animals] 理由 パターン形成は楽しいね 概要 動物の皮膚色素パターン形成のメカニズム…
Maria Kiskowski;...;Ylenia Chiari(2018.6, bioRxiv)[Isolating and Quantifying the Role ofDevelopmental Noise in Generating Phenotypic Variation] 理由 パターン形成は面白いね 概要 生物における表現形の変化は、典型的にゲノムの変化や環境の変化、…
Adam M. M. Stuckert;...;Kyle Summers (2019.4, BMC Evolutionary Biology)[Variation in pigmentation gene expression is associated with distinct aposematic color morphs in the poison frog Dendrobates auratus] 理由 どこかで見つけた論文 概要 背…
Gabriel Seiden and Sofia Curland(2015.3, New Journa of Physics)[The tongue as an excitable medium] 理由 これもなんかの論文に引用されてた 概要 地図状舌(GT)は人口の約2%に影響を与える病状であり、ゆっくりした炎症の拡大によって舌の上部を覆う乳…
