アロステリック分子における緩和経路の遷移：酵素動力学的拘束モデル

Tetsuhiro S;...;Kunihiko Kaneko(2020.1, PHYSICAL REVIEW RESEARCH)[Transition in relaxation paths in allosteric molecules: Enzymatic kinetically constrained model]

理由

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概要

タイムスケールの階層性は生物系において偏在しており、ここでは酵素反応が平衡状態への緩和を早めることができるため、酵素反応が重要な役割をもつ。酵素反応も組み込んだ相互作用するスピンの統計力学モデルを導入し、典型的なモデルをアロステリック制御へと拡張した。モンテカルロシミュレーションを通じて、緩和ダイナミクスは素反応より遅く、ガラスで共通して観察されるように、いくつかのプラトーを持つ時間に対して対数的である。この原因は、酵素の競合を介する協調性由来の動力学係数であり、これは異なる構造の分子への異なる結合性を持つ。我々のモデルにより、平衡状態へ対応することなく本質的に力学遷移を引き起こす緩和遷移のおける対称性の破れが示された。この速報では、これらの結果と生物における多様な反応との関係を議論する。

雑記

さよなら2月