これはブログではない

生物学(主に理論生物学)の論文を書くために読みます

地球の生態系に亘る巨大なファージの系統群

Basem Al-Shayeb;...; Jillian F. Banfield(2020.2, nature)[Clades of huge phages from across Earth’s ecosystems]

 

理由

Twitterで見かけたので

 

概要

通常バクテリオファージは、小さなゲノムを持ち、複製に宿主を必要とする。ここでは、多様な生態系からDNAをシークエンスし、200キロベース(kb)以上の長さのファージゲノムを発見した。これは知る限り最大のファージゲノムである。35ゲノムは(環状かつギャップがない)成熟した完全なゲノムであった。拡張された遺伝子レパートリーには、多様かつ以前に記述されていないCRISPR-Cas系とトランスファーRNAs(tRNAs)とtRNA合成酵素、tRNA調節性酵素、翻訳開始因子と翻訳伸長因子とリボソームタンパク質が含まれる。ファージのCRISPR-Cas系は宿主の転写因子と翻訳遺伝子を不活化する能力を持ち、翻訳をファージを指定する機能に変更する横取りの巨大なネットワークの一部である。加えて、ファージの中には競合するファージを取り除くバクテリアCRISPR-Cas系を用いるものもいる。海や湖、堆積物や土壌、構築環境などと同様に人や他の動物の微生物叢から巨大なファージの主な系統群を系統学的に定義した。巨大なファージの巨大な遺伝子の目録が保存されている生物学的戦略を反映し、ファージが多様な細菌宿主と地球の生態系に亘って分布することを結論付ける。

 

印象的な図

Fig4. ファージと最近のCRISPR相互ダイナミクス

 

雑記

この記事をチラ見した見出しは[生物的なウイルスとウイルス的な生物が見つかった]っていう文言に惹かれてたんだけど、アブストだけではあまりその意味は伝わらなかったな