これはブログではない

生物学(主に理論生物学)の論文を書くために読みます

2020-02-01から1ヶ月間の記事一覧

骨形成の良いモデルである金魚の再生スケールにおける造骨細胞活性とエストロゲン応答

HiroakiYoshikubo;...;AtsuhikoHattori(2005.4, Life Sciences)[Osteoblastic activity and estrogenic response in the regenerating scale of goldfish, a good model of osteogenesis] 理由 細先生の論文が面白そうだったので 概要 硬骨魚における骨形成…

コンピュータ断層撮影を用いた石灰化と非石灰化の軟体動物組織の3D可視化

Takenori Sasaki;...;Masato Hoshino(20188.10, Biomineralization)[3D Visualization of Calcified and Non-calcified Molluscan Tissues Using Computed Tomography] 理由 もうどこで見つけたかも分かんなくなった 概要 生物学と古生物学における形態学的…

捕食に応答する多細胞性の新たな起源

Matthew D. Herron;...;William C. Ratcliff(2019.2, Scientific reports)[De novo origins of multicellularity in response to predation] 理由 これも確かラボSlack...? 概要 単細胞生物から多細胞生物への転換は、進より複雑な生物系に進化する新たな機…

二相性の生物学組織における機械化学的なパターニング理論

Pierre Rechoa;...;Edouard Hannezoe(2019, PNAS)[Theory of mechanochemical patterning in biphasic biological tissues] 理由 これもたしかラボSlackで流れてきたやつ 概要 自己組織的なパターンの形成は多細胞生物の形態形成の鍵であるが、生物学的なパ…

初期ヒト発生の三次元視覚化と解析

Morgane Belle;..;Alain Chédotal(2017.3, Cell)[Tridimensional Visualization and Analysis of Early Human Development] 理由 ラボSlack 概要 ヒトの胚の正確な細胞または分子的な地図を作成することは、健康な状態もしくは病的な状態における器官形成の…

ミツバチの栄養調節的な働きバチの特徴の遺伝的スイッチ

Annika Roth;...;Martin Beye(2019.3, PLOS BIOLOGY)[A genetic switch for worker nutrition-mediated traits in honeybees] 理由 ラボのSlackに落ちてた論文 概要 高度に社会的な昆虫は、繁殖可能な女王と不妊の働きバチとの間に生殖器官のサイズが異なる…

飛ぶための湾曲:統合的な適応によって、ぐるぐる回る果実の最適な飛行パフォーマンスが解明された

Jean Rabault;..;Andreas Carlson(2019.1, PHYSICAL REVIEW LETTERS)[Curving to Fly: Synthetic Adaptation Unveils Optimal Flight Performance of Whirling Fruits] 理由 ラボのSlackに落ちてた 概要 種子や果実、その他飛散物(分散物)の付属物は風による…

皮膚癌のパターン形成:癌の増殖と流体力学的相互作用

Takuma Hoshino;...;Shigeyuki Komura(2019.3, PHYSICAL REVIEW E)[Pattern formation of skin cancers: Effects of cancer proliferation and hydrodynamic interactions] 理由 ラボで紹介されてたやつ 概要 癌と健康な細胞を含む2進システムの数値計算の方…

花粉の細胞壁パターンは変調期から生じる

Asja Radja;...;Alison M. Sweeney(2019.2, Cell)[Pollen Cell Wall Patterns Form from Modulated Phases] 理由 だいぶ前に野外実習やってるときに花粉の形って面白いねって話をしてたので 概要 花粉粒の華やかな幾何的な細胞壁は数十年間科学者を触発して…

セセリチョウのゲノムによる羽パターンの広範囲の収斂の解明

Wenlin Li;...;Nick V. Grishin(2019.3, PNAS)[Genomes of skipper butterflies reveal extensive convergence of wing patterns] 理由 蝶のはねって綺麗だよね 概要 数世紀の間、生物学者は進化を推測するために形態を用いてきた。この数十年の間に、手軽な…

コクサギ型葉序に主な焦点を当てた植物における主要もしくは少数の葉序パターンの包括的な生成に関する数理モデル研究

Takaaki Yonekura;...;Munetaka Sugiyama(2019.6, PLOS Como)[Mathematical model studies of the comprehensive generation of major and minor phyllotactic patterns in plants with a predominant focus on orixate phyllotaxis] 理由 うちの研究室に近…

皮膚免疫と炎症を制御するメカニズム

Manolis Pasparakis;...;Frank O. Nestle (2014.4, Nature Reviews Immunology)[Mechanisms regulating skin immunity and inflammation] 理由 皮膚免疫と常在細菌叢の関係の勉強 概要 皮膚の免疫反応は、病原微生物に対する宿主防御に重要である。しかしな…

総説:皮膚と免疫系

Elizabeth R. Mann;...; Ailsa L. Hart(2012, J Clin Exp Dermatol Res)[Review: Skin and the Immune System] 理由 免疫系と常在細菌の関係 概要 皮膚免疫系は、侵入してくる病原体に対する免疫と免疫恒常性をうまく維持するための免疫寛容メカニズムの両方…

常在細菌叢が免疫細胞サブセットと炎症反応に与える影響

Takatoshi Chinen; Alexander Y Rudensky(2011.12, Immunological reviews)[The effects of commensal microbiota on immune cell subsets and inflammatory responses] 理由 免疫と常在細菌叢の関係の勉強 概要 数十億の共生の結果、後生動物と共生常在細菌…

常在細菌叢による自然免疫と獲得免疫の制御

IreneJarchum;Eric G Pamer (2011.6, Current Opinion in Immunology)[Regulation of innate and adaptive immunity by the commensal microbiota] 理由 皮膚の常在細菌と免疫の影響を調べていたので 概要 腸管の微生物叢は哺乳類の健康に必須である。微生物…

皮膚炎における治療標的としてのサイトカイン

MiriamWittmann;...;ThomasWerfel(2014.8, Cytokine & Growth Factor Reviews)[Cytokines as therapeutic targets in skin inflammation] 理由 皮膚状態がサイトカインに与える影響を調べてたので 概要 この総説では、最も一般的な炎症性皮膚疾患である湿疹…

不均一性が高い集団における単純な伝染病ネットワーク

María del ValleRafo; Juan PabloAparicio(2020.2, Journal of Theoretical Biology)[Simple epidemic network model for highly heterogeneous populations] 理由 JTBの新着論文 概要 病気の伝染やダイナミクスのネットワークモデルは最も単純なエージェン…

差分移動の進化を説明する仮説が存在する、一夫一妻の岸辺の鳥の問題の移動パターン

LinusHedh; AndersHedenström(2020.2, Journal of Theoretical Biology)[The migration pattern of a monogamous shorebird challenges existing hypotheses explaining the evolution of differential migration] 理由 JTBの新着論文で面白そうだったので …

複数のアクチンネットワークによって、免疫学的シナプスにおける機械刺激伝達が調節される。

Daniel Blumenthal; Janis K. Burkhardt(2020, Jornal of Cell Biology)[Multiple actin networks coordinate mechanotransduction at the immunological synapse] 理由 Facebookかなんかで流れてきた論文 概要 抗原提示細胞(APCs)によるナイーブT細胞の活性…

スパゲッティの調理誘導的な変形の力学ベースモデル

Nathaniel N. Goldberg and Oliver M. O'Reilly(2020.1, Phys. Rev. E)[Mechanics-based model for the cooking-induced deformation of spaghetti] 理由 Twitterで見かけて面白いなと思ったので 概要 この論文では、調理誘導的なスパゲッティの変形の最小モ…

ヒレをぱたぱたさせて泳ぐ魚の、流体力学的に相互作用する格子

Anand U. Oza;...;Michael J. Shelley(2019.11, PHYSICAL REVIEW X)[Lattices of Hydrodynamically Interacting Flapping Swimmers] 理由 Twitterで見つけた 概要 魚の群れや鳥の群れは複雑な集団ダイナミクスを示すが、その自己組織的な原理はほとんど分か…

蝶の生きている羽の過熱を防ぐ物理的また行動的適応

Cheng-Chia Tsai,;...;Nanfang Yu(2020.1, Nature Communications)[Physical and behavioral adaptations to prevent overheating of the living wings of butterflies] 理由 Twitterで見かけて面白そうだったので 概要 鱗翅目の羽は、機能するために適切な…

生物のパターン形成の理論

A. Gierer & H. Meinhardt(1972, Kybernetik)[A theory of biological pattern formation] 理由 生物のパタン形成に関する古い論文 概要 形態形成における必須過程の一つは、ほとんど均一な組織から始まる組織構造の空間パターンの形成である。自己触媒また…

2016国際皮膚科学会連盟による皮膚病変部位の記述の用語集の改訂

A. Nast;...;J.L. Bolognia(2016.1, British Journal of Dermatology)[The 2016 International League of Dermatological Societies' revised glossary for the description of cutaneous lesions] 理由 皮膚炎における形の情報集め 概要 背景 皮膚科学にお…

遺伝子発現の時間遅延の影響

S. Seirin Lee;...; N.A. M. Monk(2010.3, Bulletin of Mathematical Biology)[The Influence of Gene Expression Time Delays on Gierer–Meinhardt Pattern Formation Systems] 理由 李先生の論文 概要 発生や細胞系において長距離のシグナリングを制御する…

ゲノムの人工的な再組織化における動的な核変形の役割

Sungrim Seirin-Lee;...;Hiroshi Ochiai(2019.9, PLOS computational biology)[Role of dynamic nuclear deformation on genomic architecture reorganization] 理由 李先生の他の論文 概要 高次ゲノム構造は、細胞種に応じて異なり分化中に劇的に変化する。…

2種の被食者1種の捕食者モデルにおける死体の効果

Sungrim Seirin Lee; Tsuyoshi Kajiwara(2008.3, Discrete and continuous dynamical systems series B)[The effect of the remains of the carcass in a two-prey, one-predator model] 理由 こないだの李先生の他の論文 概要 死体効果を含む2種の被食者と1…

任意の表面上の反応拡散の分岐解析

Daljit Singh J. Dhillon;...;Matthias Zwicker(2017, Bull Math Biol)[Bifurcation Analysis of Reaction Diffusion Systems on Arbitrary Surfaces] 理由 Milinkovitch先生の論文 概要 この論文では、生物のパターン形成における表面幾何の効果を調べるた…

局所的に曲がった幾何によってアフリカゾウ皮膚における曲げ亀裂が生まれる

António F. Martins;...;Michel C. Milinkovitch(2018.10, nature communications)[Locally-curved geometry generates bending cracks in the African elephant skin] 理由 こないだ教えてくれた論文の著者の別のやつ 概要 隙間の複雑なネットワークは、ア…