2020-11-01から1ヶ月間の記事一覧
So-Young Yeo;...;Seok-Hyung Kim(2018.8, Nature Communications)[A positive feedback loop bi-stably activates fibroblasts] 理由 参考文献になりそうだったので 概要 線維芽細胞は通常の組織では不活化しているが、創傷治癒の際は爆発的な活性化を示し…
Andrew Leber;...;Bassaganya-Riera(2016.7, Journal of Theoretical Biology)[Bistability analyses of CD4+ T follicular helper and regulatory cells during Helicobacter pylori infection] 理由 参考文献になりそうだったので 概要 濾胞性ヘルパーT(Tf…
Aditya Jagarapu;...;Ryan Zurakowski(2019.7, Proc Am Control Conf.)[Positive feedback through inflammation creates bistable behavior in HIV tissue sanctuaries] 理由 参考文献になりそうだったので 概要 抗レトロウイルス併用療法(cART)は、患者の…
Mohammad Jafarnejad;...;James E. Moore Jr.(2017.10, J Immunol)[A Novel Computational Model Predicts Key Regulators of Chemokine Gradient Formation in Lymph Nodes and Site-Specific Roles for CCL19 and ACKR4] 理由 免疫関係の数理モデル研究を…
Neil M. Ferguson;...;Neil M. Ferguson(2001.5, Science)[The Foot-and-Mouth Epidemic in Great Britain: Pattern of Spread and Impact of Interventions] 理由 とあるセミナーで紹介されていた 概要 英国におけるウイルス拡大の最初2ヶ月にわたる最近の…
Hironori Fujita;...;Masayoshi Kawaguchi(2018.4 PLOS Comp)[Spatial regularity control of phyllotaxis pattern generated by the mutual interaction between auxin and PIN1] 理由 これもラボSlackかなぁ 概要 葉序は、植物の茎での葉の配列であり、そ…
Karin R. L. van der Burg;...;Robert D. Reed(2020.11, Science)[Genomic architecture of a genetically assimilated seasonal color pattern] 理由 Twitterかなんかで流れてきたんじゃなかろうか 概要 発生的可塑性によって、ゲノムは環境の刺激に応答し…
Sam Kriegman;...;Josh Bongard(2020.1, PNAS)[A scalable pipeline for designing reconfigurable organisms] 理由 ラボセミナーで出てきておもしろそうだったので 概要 生物はかなり頑健、多様かつ複雑、そして作られたどの技術よりも人命に協力的である。…
Eric M. Kramer & Michael H. Borkowski(2004.7, Trees)[Wood grain patterns at branch junctions: modeling and implications] 理由 木目のパターンが気になったので 概要 2つの木の分岐間の接点の木目パターン形成の最近のモデルを用いる。モデルのシミュ…
Ido Levin;...;Eran Sharon(2020.10, PHYSICAL REVIEW LETTERS)[Self-Oscillating Membranes: Chemomechanical Sheets Show Autonomous Periodic Shape Transformation] 理由 これも確かラボSlack 概要 生物は、形態変化と運動を誘導するために、シート内の…
R. M. Fisher;..;J. J. Boomsma(2020.7, Proceedings B)[The evolution of multicellularcomplexity: the role of relatedness and environmental constraints] 理由 ラボSlackシリーズ 概要 進化生物学における大きな問題は、粘菌から脊椎動物まで多くの独…
Jennifer T.Pentz;...;William C.Ratcliff(2020.11, Current biology)[Ecological Advantages and Evolutionary Limitations of Aggregative Multicellular Development] 理由 ラボSlackに落ちてた気がする 概要 全ての多細胞生物は1つか2つの基本的な道筋を…
Jacqueline E. Moustakas-Verho,;...;Scott F. Gilbert(2014 Development)[The origin and loss of periodic patterning in the turtle shell] 理由 ラボSlackに落ちてたやつ 概要 20億年前のカメの甲羅の起源は、羊膜類のボディプランを徐々に修正してきた…
Ali Nematbakhsh;...;Mark Alber (2020.8, PLOS Computational biology)[Epithelial organ shape is generated by patterned actomyosin contractility and maintained by the extracellular matrix] 理由 ラボSlackに落ちてたので 概要 上皮シートは発生中…
Heike Sander;...;Albrecht Ott(2020.8, bioRxiv)[Symmetry breaking and de-novo axis formation in hydra spheroids: the microtubule cytoskeleton as a pivotal element] 理由 ラボSlackに投げられてたやつ 概要 細胞と組織における極性の確立は、多細胞…
Toshiya Ando; Teruyuki Niimi(2019.1, Develop Growth Differ. )[Development and evolution of color patterns in ladybird beetles: A case study in Harmonia axyridis] 理由 ラボセミナーで紹介されてておもしろそうだったので 概要 多くの生物は体に多…
Thomas Erneuxa; Grégoire Nicolis(1993.8, Physica D: Nonlinear Phenomena)[Propagating waves in discrete bistable reaction-diffusion systems] 理由 自分の研究関連 概要 N共役南雲方程式によってモデル化された離散双安定反応拡散系を考える。 漸近線…
Trevor G Marshall;...;Frances E Marshall (2006.1, BMC Theoretical Biology and Medical Modelling)[Common angiotensin receptor blockers may directly modulate the immune system via VDR, PPAR and CCR2b] 理由 BMCのTheoretical Biology and Medica…
Rotem Ben-Shachar,:..:H Frederik Nijhout(2012.12, Theoretical Biology and Medical Modelling )[The biochemistry of acetaminophen hepatotoxicity and rescue: a mathematical model] 理由 BMCのTheoretical Biology and Medical Modellingの中で、最…
Edward A Rietman;...; Jack A Tuszynski(2011.6, Theoretical Biology and Medical Modelling)[Review and application of group theory to molecular systems biology] 理由 BMCのTheoretical Biology and Medical Modellingの中で、最もアクセスされてる…
Janet Best;...,Michael Reed (2010.8, Theoretical Biology and Medical Modelling)[Serotonin synthesis, release and reuptake in terminals: a mathematical model] 理由 BMCのTheoretical Biology and Medical Modellingの中で、最もアクセスされてる論…
Sheikh Arslan Sehgal;...;Asif Mir(2013.1, BMC Theoretical Biology and Medical Modelling)[Structural, phylogenetic and docking studies of D-amino acid oxidase activator (DAOA), a candidate schizophrenia gene] 理由 BMCのTheoretical Biology a…
József Garay;...;Tamás F.Móri(2020.10, Journal of Theoretical Biology)[When optimal foragers meet in a game theoretical conflict: A model of kleptoparasitism] 理由 JTBを読もう 概要 労働寄生はゲーム理論問題と採餌戦略で同時に考えられているの…
Bas Jacobs;...;Eva E.Deinum(2020.10, Journal of Theoretical Biology)[Robust banded protoxylem pattern formation through microtubule-based directional ROP diffusion restriction] 理由 JTBの最近の記事 概要 植物の維管束組織発生において、異なる…
Lin Liu; Alexander Bockmayr(2020.9, Journal of Theoretical Biology)[Regulatory dynamic enzyme-cost flux balance analysis: A unifying framework for constraint-based modeling] 理由 JTBを読もう 概要 代謝モデリングと遺伝子制御を統合することは…
Steinar Thorvaldsen; OlaHössjer(2020.9, Journal of Theoretical Biology)[Using statistical methods to model the fine-tuning of molecular machines and systems] 理由 JTBの最近のを読もうね 概要 微調整(Fine-tuning)は物理学において注目されており…
Trystan Leng; Matt J.Keeling(2020.9, Journal of Theoretical Biology)[Improving pairwise approximations for network models with susceptible-infected-susceptible dynamics] 理由 自分の専門分野の論文を読もう 概要 感染症拡大のネットワークモデル…
S. S. Liaw;...; T. Hong(2001.9, PHYSICAL REVIEW E,)[Turing model for the patterns of lady beetles] 理由 ラボにテントウムシの図鑑が置いてあったので 概要 特定の種類のチューリングモデルをテントウムシの硬い羽根のパターン形成のシミュレーション…
Sabri Gokmen(Performative and Interactive Architecture, 2013.9)[A Morphogenetic Approach for Performative Building Envelope Systems Using Leaf Venetian Patterns] 理由 Twitterで流れてきたんだっけか 概要 デザインに基づくパフォーマンスにおけ…
M. A. R. Koehl:...:L. Mahadevan(Integrative and Comparative Biology, 2008.7)[How kelp produce blade shapes suited to different flow regimes: A new wrinkle] 理由 これも雑談の中で出てきたんじゃなかったか 概要 大型藻類の多くは、急な流れの水に…
