2020-07-01から1ヶ月間の記事一覧
Réka Albert; Hans GOthmer (2003.7, Journal of Theoretical Biology)[The topology of the regulatory interactions predicts the expression pattern of the segment polarity genes in Drosophila melanogaster] 理由 「理論生物学」第2章2-3 「生体分子…
George von Dassow;...;Garrett M. Odell (2000.7, nature)[The segment polarity network is a robust developmental module] 理由 「理論生物学」第2章2-3 「生体分子制御ネットワークの構造の力学的解明」の参考文献 概要 昆虫はすべて相同な分節を持つが…
Theodore J Perkins and Peter S Swain(2009, Mol Syst Biol.)[Strategies for cellular decision-making] 理由 「理論生物学」第2章2-2 「不確定環境下における細胞の運命決定理論」の参考文献 概要 確率性は細胞レベルの生物に普遍的である。細胞は確率的…
Tomáš Helikar;...;Jim A. Rogers(2008.2, PNAS)[Emergent decision-making in biological signal transduction networks] 理由 「理論生物学」第2章2-2 「不確定環境下における細胞の運命決定理論」の参考文献 概要 生化学的な細胞内シグナル伝達ネットワー…
Richard Losick and Claude Desplan(2008.4, Science.)[Stochasticity and Cell Fate] 理由 「理論生物学」第2章2-2 「不確定環境下における細胞の運命決定理論」の参考文献 概要 生きている細胞の基本は、特別な属性のあるサブタイプに分化する収容能力であ…
John JTyson;,,,;BelaNovak(2003.4, Current Opinion in Cell Biology)[Sniffers, buzzers, toggles and blinkers: dynamics of regulatory and signaling pathways in the cell] 理由 「理論生物学」第2章2-2 「不確定環境下における細胞の運命決定理論」の…
N. Barkai & S. Leibler(1997.6, nature)[Robustness in simple biochemical networks] 理由 「理論生物学」第1章1-3 「バクテリア走化性のシステム論実験と理論の展開」の参考文献 概要 細胞は、情報を輸送し処理するために相互作用する分子要素の複雑なネ…
Victor Sourjik and Howard C. Berg(2002.1, PNAS)[Receptor sensitivity in bacterial chemotaxis] 理由 「理論生物学」第1章1-3 「バクテリア走化性のシステム論実験と理論の展開」の参考文献 概要 大腸菌における化学受容体は、不安定なリン酸化中間体Che…
Damon A. Clark and Lars C. Grant(2005.6, PNAS)[The bacterial chemotactic response reflects a compromise between transient and steady-state behavior] 理由 「理論生物学」第1章1-3 「バクテリア走化性のシステム論実験と理論の展開」の参考文献 概要…
Joseph R. Pomerening;...;James E. Ferrell Jr(2003.3, Nature Cell Biology )[Building a cell cycle oscillator: hysteresis and bistability in the activation of Cdc2] 理由 「理論生物学」第1章1-2 「理論生物学の眺め方」の参考文献 概要 初期胚の細…
Katherine C. Chen;...; John J. Tyson(2004.8, Mol Biol Cell.)[Integrative Analysis of Cell Cycle Control in Budding Yeast] 理由 「理論生物学」第1章1-2 「理論生物学の眺め方」の参考文献 概要 内部シグナルと外部シグナルに対する生細胞の適応的反…
John J. Tyson;...;Bela Novak(2002. BioEssays)[The dynamics of cell cycleregulation] 理由 「理論生物学」第1章1-2 「理論生物学の眺め方」の参考文献 概要 DNA合成、有糸分裂そして細胞分裂のような細胞周期の主な事象は、サイクリン依存的なキナーゼの…
Hisao Honda;...;Takashi Hiiragi(2008, Development)[Computer simulation of emerging asymmetry in the mouse blastocyst] 理由 「理論生物学」第1章1-2 「理論生物学の眺め方」の参考文献 概要 哺乳類において確立した胚極性のメカニズムの論争が長く続…
Markus J Herrgård,;..;Bernhard Ø Palsson(2006.7, PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY)[Identification of Genome-Scale Metabolic Network Models Using Experimentally Measured Flux Profiles] 理由 「理論生物学」第1章1-2 「理論生物学の眺め方」の参考文献 …
David Fange,Johan Elf (2006.6, PLOS ONE)[Noise-Induced Min Phenotypes in E. coli] 理由 「理論生物学」第1章1-2 「理論生物学の眺め方」の参考文献 概要 大腸菌タンパク質MinDとMinEの時空間的振動は直接細胞分裂と染色体間領域を指揮する。Min系のいく…
Kerwyn Casey Huang,;...;Ned S. Wingreen(2003.10, PNAS)[Dynamic structures in Escherichia coli: Spontaneous formation of MinE rings and MinD polar zones] 理由 「理論生物学」第1章1-2 「理論生物学の眺め方」の参考文献 概要 大腸菌において、分裂…
Karsten Kruse;...;William Margolin(2007.1, molecular microbiology)[An experimentalist's guide to computational modelling of the Min system] 理由 「理論生物学」第1章1-2 「理論生物学の眺め方」の参考文献 概要 Minタンパク質の時空間振動は、大腸…
Eran Segal;...;Ulrike Gaul(2008.1, Nature)[Predicting expression patterns from regulatory sequence in Drosophila segmentation] 理由 「理論生物学」第1章1-2 「理論生物学の眺め方」の参考文献 概要 正確な時間と位置における複雑な発現パターンの設…
David Oriola;...;Jan Brugués(2020.5, PNAS)[Active forces shape the metaphase spindle through a mechanical instability] 理由 ラボSlackに流れてきたはず 概要 中期の紡錘体は細胞分裂の間の染色体分離を組織化する動的な構造である。最近、ソフトマタ…
T. Alexander Dececchi;...Hans C. E. Larsson(2020.5, PLOS ONE)[The fast and the frugal: Divergent locomotory strategies drive limb lengthening in theropod dinosaurs] 理由 これもラボSlackに落ちてたやつかな 概要 脚の長さと歩行性そしてスピード…
Kaare H. Jensen,;...;Keunhwan Park(2020.6, Nature Physics )[Universal elastic mechanism for stinger design] 理由 ラボSlackで紹介されてた 概要 生物は針を使う。この針は幅広い生物分類群に亘る10ナノメートルから数センチメートルまでの8のオーダー…
Guanglu Zhang;...;Daniel A. McAdams(2019.6, PLOS ONE)[A case against the trickle-down effect in technology ecosystems] 理由 ラボSlack に流れてきた、はず 概要 技術的な進化は時間と共に技術的性能の変化を記述する。技術的な進歩は、合理的なR&D標…
Thibaut Brunet1;..;Nicole King(bioarXiv, 2020.6)[A flagellate-to-amoeboid switch in the closest living relatives of animals] 理由 ラボSlackで流れてきた 概要 異なる細胞種の進化は初期動物進化の重要な過程である。上皮細胞とアメーバ細胞の2つの…
L. A. Abdulkhaleq;...;M. N. M. Hezmee(2018.5, Vet World.)[The crucial roles of inflammatory mediators in inflammation: A review] 理由 サイトカイン同士の関係の勉強 概要 炎症反応は有害な炎症原因に対する組織の応答の重要な側面である。この複雑…
Jessica L. Clarke;...;Nick Aldred(2020.6, BMC Zoology)[Sea anemones (Exaiptasia pallida) use a secreted adhesive and complex pedal disc morphology for surface attachment] 理由 なんか流れてきた 概要 背景 イソギンチャクが水面下で表面に接着し…
R. T. Liu, S. S. Liaw, and P. K. Maini(2006.7, PHYSICAL REVIEW E)[Two-stage Turing model for generating pigment patterns on the leopard and the jaguar] 理由 twitterで見かけた 概要 斑点はネコ科の初期パターンであり、ロゼットと病斑を含む他の…
Benjamin ERich; Thomas SKupper(2001.7, Current Biology)[Cytokines: IL-20 — a new effector in skin inflammation] 理由 サイトカインの相互作用を調べてたので 概要 新しく発見されたサイトカインであるインターロイキン20(IL-20)はIL-10に構造的に関係…
Congcong Hu and P. Alex Greaney(2014.8, JOURNAL OF APPLIED PHYSICS)[Role of seta angle and flexibility in the gecko adhesion mechanism] 理由 twitterかなんかで見たやつ 概要 トカゲの観察接着の可逆的な性質を記述するためにモデルを作成する。こ…
Ekaterina D. Gribkova;...;Rhanor Gillette(2020.6, Scientifis reports)[Simple Aesthetic Sense and Addiction Emerge in Neural Relations of Cost-Benefit Decision in Foraging] 理由 twitterかなんかで見つけたやつかな 概要 初歩的な美的感覚は、初…
Krishna Kant Lawania and Priyanka Mathur(2015.11, IOSR Journal of Environmental Science, Toxicology and Food Technology)[Study On The Pattern And Archetecture Of Spider’s Web With Special Reference To Seasonal Abundance In Eastern Region O…
