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Lange, M.;...;Fabian J. T. (2022.1, Nature Methods)[CellRank for directed single-cell fate mapping.] 理由 研究会で紹介されてて面白そうだったので 概要 計算的軌道推定によって1細胞RNAシークエンシング実験由来の細胞状態ダイナミクスの再構成が可…
Teschendorff, A.E., Feinberg, A.P. (2021.4 ,Nat Rev Genet)[Statistical mechanics meets single-cell biology.] 理由 参加した研究会で紹介されてて面白そうだったので 概要 1細胞オミックスは細胞生物学や細胞性疾患の理解を変えたが、システムレベルの…
Joel O. Abraham;..;Brett R. Jesmer(2022.5, Nature Ecology & Evolution)[Evolutionary causes and consequences of ungulate migration] 理由 これもたしかラボSlack 概要 有蹄類の移動は豊富な個体数と機能的な生態系の維持に重要である。しかしながら、…
Sami C. Al-Izzi, Richard G. Morris(2022.4, bioRxiv)[Morphodynamics of Active Nematic Fluid Surfaces] 理由 これもたしかラボSlack 概要 変形する曲面上のアクティブネマティック液面の振る舞いを支配する形態力学方程式は、一般的な大きい変形限界につ…
Agathe Chaigne and Thibaut Brunet(2022.4, Current Biology)[Incomplete abscission and cytoplasmic bridges in the evolution of eukaryotic multicellularity] 理由 ラボSlackに流れてきた・・・気がする 概要 細胞分裂の教科書的な観点は、脱離と呼ば…
Sumio Udagawa;...;Toru Miura(2022.4, Scientific Reports)[Hydrocoel morphogenesis forming the pentaradial body plan in a sea cucumber, Apostichopus japonicus] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 棘皮動物は五放射相称のボディプランが特徴の動物門…
Hanna M. Ciesielski;...;Sa Kan Yoo(2022.4, PLOS Biology)[Erebosis, a new cell death mechanism during homeostatic turnover of gut enterocytes] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 多くの成体組織は分化細胞や幹細胞で構成されており、これらは協調的…
Jason Z. Kim;...;Dani S. Bassett(2022.3, Phys. Rev. X )[Nonlinear Dynamics and Chaos in Conformational Changes of Mechanical Metamaterials] 理由 これも確かラボSlackに流れてきたやつ 概要 酵素結合からロボットの把持まで、多くの力学系の機能は…
Rabindev Bishal,;...;Neelima Gupte(2022.1, Phys. Rev. E)[Multifractal analysis of birdsong and its correlation structure] 理由 たしかラボSlackに流れてきたやつ 概要 鳴き鳥の典型的な歌の時系列録音は、非常に複雑かつ構造的な振る舞いを示す。そ…
D. D. Solnyshkov and G. Malpuech(2022.3, bioRxiv)[Love might be a second-order phase transition] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 臨界点近傍でのヒト脳手術の仮説は、近年の話題である。この臨界点を超える相転移を自然に起こす可能性の証拠はこれま…
Edoardo Morandi;...;Danny Incarnato(2022.3, Nature Communications)[SHAPE-guided RNA structure homology search and motif discovery] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 RNA構造プローブ法が急速に有名になったことで、可能なRNA構造情報の大量に得られ…
Kunkle, B.W. et al, (2019.2, Nature Genetics)[Genetic meta-analysis of diagnosed Alzheimer’s disease identifies new risk loci and implicates Aβ, tau, immunity and lipid processing] 理由 ラボセミナーで出てきた 概要 最も流行している認知症で…
Mika Shirasu, Kazushige Touhara(2011.9, The Journal of Biochemistry)[The scent of disease: volatile organic compounds of the human body related to disease and disorder] 理由 動物の多様性に関するウェビナーで出てきて面白そうだったので 概要 …
Hisaharu Koshitaka;...;Kentaro Arikawa(2008.1, Proceedings of the royal society B)[Tetrachromacy in a butterfly that has eight varieties of spectral receptors] 理由 授業で出てきて面白かったので 概要 本論文では、無脊椎動物の中で初めての四色…
Hannah M Isles;...; Philip M Elks(2021.7, eLife)[Pioneer neutrophils release chromatin within in vivo swarms] 理由 Twitterで流れてきて面白そうだったので 概要 好中球は、炎症領域に急速に集められる。これは、協調的な移動が集団を形成するような…
Jinghui Liu;..;Nikta Fakhri(2021.8, PNAS)[Topological braiding and virtual particles on the cell membrane] 理由 生物物理のセミナーでトポロジー欠損の話を聞いて、なんか面白そうだったから 概要 意義 位相欠陥は、物質や生物質の物理や力学を根本的…
Chia-Yi Cheng;..;Gloria M. Coruzzi(2021.9, Nature Communications)[Evolutionarily informed machine learning enhances the power of predictive gene-to-phenotype relationships] 理由 GWASの勉強してるときに見つけた 概要 ゲノムの特徴から表現型の…
Yonit Maroudas-Sacks;...; Kinneret Keren(2020.11, nature physics)[Topological defects in the nematic order of actin fibres as organization centres of Hydra morphogenesis] 理由 前参加した若手の会で聞いて面白そうだったやつ 概要 動物の形態形…
Alya A Arabi(2021.4, FUTURE DRUG DISCOVERY)[Artificial intelligence in drug design: algorithms, applications, challenges and ethics] 理由 こないだ参加した学会で興味をもったやつ 概要 薬剤の発見パラダイムは、機械学習(ML)や人工知能(AI)の進歩…
Kei Iida;...; Masatoshi Hagiwara(2021.8, bioRxiv)[Switching of OAS1 splicing isoforms mitigates SARS-CoV-2 infection] 理由 こないだ参加した学会で紹介されてた 概要 背景 コロナウイルス感染症(COVID-19)患者ゲノムから集めた急速に蓄積している疾…
José-Alain Sahel;...;Botond Roska(2021.5, Nature Medicine)[Partial recovery of visual function in a blind patient after optogenetic therapy] 理由 参加した学会で出てきて役に立ちそうだったので 概要 光遺伝学は、神経疾患における神経機能の変異…
Shin-Ya Isobe;...;Chikashi Obuse(2021.7, Cell Reports)[Protein phosphatase 1 acts as a RIF1 effector to suppress DSB resection prior to Shieldin action] 理由 今度セミナーに来る人の論文 概要 DNA二本鎖切断(DSBs)は、主に相同組換え修復(HDR)経…
Wang, D.;...;Gao, G.(2019.2, Nat Rev Drug Discov)[Adeno-associated virus vector as a platform for gene therapy delivery.] 理由 今度の仕事の事前学習 概要 アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターは、多様なヒト疾患治療の遺伝子輸送の優れたプラットフォ…
Kai Liu;...;Sheng Ding(2016.8, 11)[Chemical Modulation of Cell Fate in Stem Cell Therapeutics and Regenerative Medicine] 理由 今度の仕事の事前学習で出されたやつ 概要 再生医療の目的は損傷した組織の修復と再生、それらの不完全な機能の回復であ…
Joachim Linssen;...;Andre J van der Ven(eLife, 2020.11)[A novel haemocytometric COVID-19 prognostic score developed and validated in an observational multicentre European hospital-based study] 理由 インターン先で教えてもらった論文 概要 COV…
Teppei Yamaguchi;...;Patrick Matthias(2009.12, GENES & DEVELOPMENT)[Histone deacetylases 1 and 2 act in concert to promote the G1-to-S progression] 理由 色んなことが重なって知り合いになった人の論文 概要 ヒストン脱アセチル化酵素(HDACs)は、…
Zhengjian Zhang;...;Wen-Chen Yeh(2020.8, Scientific Reports)[Tissue-targeted R-spondin mimetics for liver regeneration] 理由 色んなことが重なって知り合いになった人の論文 概要 R-スポディン(RSPO)タンパク質はWntシグナリングを増幅させ、多様な…
Joshua C. Kynaston;...;Christian A. Yates(2021.8, bioRxiv)[An equivalence framework for an age-structured multi-stage representation of the cell cycle] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 年齢で層別化された個々の細胞集団の確率論もしくは決…
Bezia Lemma;..;Zvonimir Dogic(2021.6, biorxiv)[Active microphase separation in mixtures of microtubules and tip-accumulating molecular motors] 理由 ラボSlack? 概要 微小管と分子モーターの混合物は、それらの構成要素の分子特性に基づいて異なる…
Chentao Wen;...; Koutarou D Kimura(2021.5, eLife)[3DeeCellTracker, a deep learning-based pipeline for segmenting and tracking cells in 3D time lapse images] 理由 ラボセミナーの時にちらっと出てきた 概要 顕微鏡技術は最近発展しているにも関わ…
