これはブログではない

生物学(主に理論生物学)の論文を書くために読みます

2021-06-01から1ヶ月間の記事一覧

目立つ体と尻尾の色を持つトカゲにおける真皮色素胞の超構造

Takeo Kuriyama;...;Masami Hasegawa(2006.9, Zoolog Sci.)[Ultrastructure of the dermal chromatophores in a lizard (Scincidae: Plestiodon latiscutatus) with conspicuous body and tail coloration] 理由 自分の研究と関連しそうなので 概要 身体に縞…

鰓外胚葉の発生中の弾性不安定性がエリマキトカゲのエリの折りたたみを生じさせる。

Sophie A Montandon;...;Michel C Milinkovitch(2019.6, eLife)[Elastic instability during branchial ectoderm development causes folding of the Chlamydosaurus erectile frill] 理由 ラボセミナー 概要 エリマキトカゲ(Chlamydosaurus kingii)の華々し…

水は、成長する水生植物の葉の形態形成に影響する

Fan Xu;...;Yifan Yang(2020.1, PHYSICAL REVIEW LETTERS)[Water Affects Morphogenesis of Growing Aquatic Plant Leaves] 理由 これもラボセミナーで出てきたはず 概要 水の上に浮かぶハスの葉は、中心に向かって減少するような短波長の端の縮みをいつも受…

共通の発生プログラムが、異なる葉の形態を生み出せる

Adam Runions;...; Przemyslaw Prusinkiewicz (2017.3, New Phytologist)[A common developmental program can produce diverse leaf shapes] 理由 ラボセミナーかなんかで話題になったやつ? 概要 真性双子葉植物の葉は、驚くほど多様な形態を持つ。本論文…

骨の外形を計算する3次元トポロジー最適化モデル

Sakashita M;...Kondo S; (2021.6, PLOS Computational Biology) [Three-dimensional topology optimization model to simulate the external shapes of bone.] 理由 ラボSlackに流れてきました 概要 骨の形が形成されるメカニズムを解明することは、脊椎動…

前翅の斑点が少ないビシクラス・アニナナのチョウの捕食傾向

Ian Z. W. Chan;...;Antónia Monteiro(2021.5, Proc. R. Soc. B.)[Predation favours Bicyclus anynana butterflies with fewer forewing eyespots] 理由 Twitterで流れてきた・・・? 概要 タテハチョウの後翅に比べて前翅の斑点は少ないが、この不均一な分…

とげのある貝殻の形態形成の物理基盤と収斂進化

Régis Chirat;...;Alain Goriely(2013.4, PNAS)[Mechanical basis of morphogenesis and convergent evolution of spiny seashells] 理由 ラボセミナーで流れてきたやつ 概要 収斂進化は、関係が近くない種で独立に同じ特徴が進化する現象である。そして収斂…

ナミビアのフェアリーリングと上皮細胞は幾何学的秩序の創発を共有する

Haozhe Zhang and Robert Sinclair(2015.6, Ecological Complexity)[Namibian fairy circles and epithelial cells share emergent geometric order] 理由 なんかで見つけた・・けど忘れた・・・。 概要 フェアリーリングは、ナミブ砂漠の景観の謎の特徴であ…

幾何学的に無秩序な材料の細胞フーリエ解析

Antoine Fruleux and Arezki Boudaoud(2021.4, Phys. Rev. Research)[Cellular Fourier analysis for geometrically disordered materials] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ? 概要 多くの媒体は、不規則な形と大きさの基本単位に分割されている。例えば、磁…

我々な細菌を変える:皮膚におけるプロバイオティクス

Y Yu;...;A Alikhan (2020.1, Br J Dermatol)[Changing our microbiome: probiotics in dermatology] 理由 自分の研究関係 概要 背景:共生細菌は、ヒトの健康と疾患発症における主な因子である。最近、腸内細菌だけでなく、皮膚細菌とそれが多様な皮膚疾患…

寛解は炎症の終了か?

Karen T. Feehan; Derek W. Gilroy(2019.2, Trends in Molecular Medicine)[Is Resolution the End of Inflammation?] 理由 自分の研究関連 概要 制御できない炎症は、関節リウマチを含む大量の慢性疾患の発症における重要な要因である。研究では、これらの…

寒冷蕁麻疹に伴う抗GT1a抗体およびGQ1b抗体による感染症後の感覚神経障害

Elisabetta Zucchi;...;Jessica Mandriol(2018.10, Journal of Clinical Neuroscience)[Post-infectious sensory neuropathy with anti-GT1a and GQ1b antibodies associated with cold urticaria] 理由 自分の研究関連 概要 64歳女性が、物理的蕁麻疹の稀な…

深刻な全身炎症の新しい寛解調節因子

Gudernatsch V;...;Mirakaj V.(2020.9, Immunotargets Ther) [Novel Resolution Mediators of Severe Systemic Inflammation.] 理由 自分の研究関連 概要 肺血症や急性呼吸器疾患そして多臓器不全のような深刻な炎症過程の根底にある特徴である、寛解しない…

Gray-Scottモデルにおける電場誘導性空間パターン形成の多様な性質を解明する

Amitava Giri and Sandip Kar(2019.3, The Journal of Chemical Physics)[Unraveling the diverse nature of electric field induced spatial pattern formation in Gray-Scott model] 理由 ラボSlackに来た・・っけ? 概要 イオン性反応物と自己触媒で構成…

ニューロン内での時空間的に制御された遺伝情報の編集

Isabel C Vallecillo-Viejo;...;Joshua J C Rosenthal(2020.3, Nucleic Acids Research)[Spatially regulated editing of genetic information within a neuron] 理由 Twitterで流れてきてびっくりしたやつ 概要 真核生物において、ミトコンドリアとプラスチ…

状態依存的な内部駆動がある生物リミットサイクル振動子における一般的な揺らぎ-散逸定理の違反

Janaki Sheth;...Alex J. Levine(2021.5, PHYSICAL REVIEW RESEARCH)[Violation of generalized fluctuation-dissipation theorem in biological limit cycle oscillators with state-dependent internal drives: Applications to hair cell oscillations] …

活発に変形可能な3D液滴の形態

Liam J. Ruske and Julia M. Yeomans(2021.4, PHYSICAL REVIEW X)[Morphology of Active Deformable 3D Droplets] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 3次元での活発なネマティック液滴の形態とディスクリネーション線を数値的に調べる。我々のモデルはアキラ…

安定結婚問題:物理学者の観点からの学際的総説

Enrico MariaFenoaltea;...;Yi-ChengZhang(2021.6, Physics Reports)[The Stable Marriage Problem: An interdisciplinary review from the physicist’s perspective] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 ここでは、複雑系関連分野に携わる物理学者の間で…

自己組織的な臨界を介した最適な細胞成長の適応

Chikara Furusawa and Kunihiko Kaneko(2012.5, Phys. Rev. Lett.)[Adaptation to Optimal Cell Growth through Self-Organized Criticality] 理由 なんかで気になった論文 概要 触媒反応ネットワークで構成される単純な細胞モデル研究の目的は、細胞状態が…

物理的位置は髄腔内AAV9注入後の脳の伝達を著しく強化する

Michael J. Castle;...;Mark H. Tuszynski(2018.11, Science Advances)[Physical positioning markedly enhances brain transduction after intrathecal AAV9 infusion] 理由 Twitterで見かけた 概要 いくつかの神経疾患は、遺伝子治療の効果が期待されてい…

嗅覚記憶における機能ネットワークのモジュール構造

DavidMeunier;...;Jean-PierreRoyet(2014.7, NeuroImage)[Modular structure of functional networks in olfactory memory] 理由 最近気になる嗅覚と記憶の話 概要 グラフ理論は、ノードとエッジのセットとして系を記述することで系の研究を可能にする。グラ…

蕁麻疹の組織病理の再確認:臨床病理研究

Barzilai, Aviv;...; Solomon, Michal (2017.10, The American Journal of Dermatopathology)[The Histopathology of Urticaria Revisited—Clinical Pathological Study] 理由 自分の研究関連 概要 背景: 蕁麻疹の従来の組織学的知見は、真皮浮腫と、好中球…

嗅覚受容における記憶の基本的な役割

Donald A.Wilson; Richard J.Stevenson(2003.5, TRENDS in Neuroscience)[The fundamental role of memory in olfactory perception] 理由 最近は嗅覚と記憶の関係に興味がある 概要 現在、嗅覚の基礎として匂いの物理化学的特徴が強調されているが、嗅覚の…

配偶子形成過程におけるボトルネック効果の有無に関わらず、真核生物間で細胞小器官の突然変異による暴落を回避する

David M. Edwards;...;Iain G. Johnston(2021.4, PLOS BIOLOGY)[Avoiding organelle mutational meltdown across eukaryotes with or without a germline bottleneck] 理由 ラボSlackにて 概要 ミトコンドリアDNA(mtDNA)とプラスチドDNA(ptDNA)は、重要な生…

悪い科学の自然選択

Paul E. Smaldino and Richard McElreath(2016.9, Royal society open science)[The natural selection of bad science] 理由 ザビーネ・ホッセンフェルダー「数学に魅せられて、科学を見失う」で出てきた論文 概要 悪い研究デザインやデータ解析は誤検出の…

根絶しにくい好酸球性環状紅斑へのダプソン:症例報告と文献の総説

Luke Wallis;...; Robert T. Gilson(2018.3, Dermatol Ther (Heidelb). )[Dapsone for Recalcitrant Eosinophilic Annular Erythema: A Case Report and Literature Review] 理由 自分の研究関連 概要 好酸球性環状紅斑(EAE)は、過敏症反応に関連する可能性…

異なる薬剤、 薬動態学、そして治療戦略下での多段階抵抗と一段階抵抗の進化

Claudia Igler;...;Roland Regoes(2021.5, eLife)[Multi-step vs. single-step resistance evolution under different drugs, pharmacokinetics and treatment regimens] 理由 あれ、どこで見つけたんだっけ、Twitter? 概要 微生物防止処理の成功は、薬剤抵…

熱傷誘導性急性炎症の定量モデル

QianYang;..;Ioannis P.Androulakis(2021.2, Mathematical Biosciences)[A quantitative model of thermal injury-induced acute inflammation] 理由 自分の研究関連 概要 重度熱傷は不慮の自己による死亡の原因の中で最も多いものである。熱誘導性の全身炎…

非感染性炎症皮膚疾患における免疫反応パターン

K. Eyerich and S. Eyerich(2018.5, J Eur Acad Dermatol Venereol. )[Immune response patterns in non‐communicable inflammatory skin diseases] 理由 自分の研究関連 概要 乾癬やアトピー性湿疹のような非感染性炎症皮膚疾患(ncISD)は世界的な疾患負荷の…

炎症の拡大の制御におけるメカニズムとポイント:数理モデル的調査

A. Bayani;...; M. R. Nelson(2020.3, Bulletin of Mathematical Biology)[Mechanisms and Points of Control in the Spread of Inflammation: A Mathematical Investigation] 理由 自分の研究関連 概要 炎症に対する体の応答を制御するメカニズムを理解する…