2020-04-01から1ヶ月間の記事一覧
Taiki SHIGEMATSU;...; Shigeo WADA(2016.10, Journal of Biomechanical Science and Engineering)[Line tension of the pore edge in phospholipid/cholesterol bilayer from stretch molecular dynamics simulation] 理由 実験医学数理モデル特集の第3章5.…
Gleghorn JP;..;Nelson CM.(2013.10, Curr Opin Biotechnol.)[Quantitative approaches to uncover physical mechanisms of tissue morphogenesis.] 理由 実験医学数理モデル特集の第3章4. 「ライブイメージングに基づくシミュレーション解析」の参考文献 概…
Kazuhiro Aoki;..; Michiyuki Matsuda(2013.11, Molecular Cell)[Stochastic ERK Activation Induced by Noise and Cell-to-Cell Propagation Regulates Cell Density-Dependent Proliferation] 理由 実験医学数理モデル特集の第3章3. 「数理モデル解析を用…
Mitsuhiro Matsuda;...;Miki Ebisuya(2015.2, Nature Communications )[Synthetic lateral inhibition governs cell-type bifurcation with robust ratios] 理由 実験医学数理モデル特集の第3章3. 「数理モデル解析を用いたシグナル伝達機構の解明」の参考文…
Nidhi Sahni;..;Vidal M(2015.4, Cell)[Widespread macromolecular interaction perturbations in human genetic disorders.] 理由 実験医学数理モデル特集の第3章2. 「DNAバーコードによる生命科学実験の限界突破」の参考文献 概要 生物学的ネットワークの…
Eiryo Kawakami;...;Hiroaki Kitano(2016.6, Nucleic Acids Res.)[Weighted enrichment method for prediction of transcription regulators from transcriptome and global chromatin immunoprecipitation data] 理由 実験医学数理モデル特集の第3章1. 「公…
Georg WKreutzberg(1996.8, Trends Neurosci. )[Microglia: a sensor for pathological events in the CNS.] 理由 実験医学数理モデル特集の第2章4. 「ホモロジーの概念を用いた組織画像解析法」の参考文献 概要 ミクログリア細胞の大きな特徴は、CNSにおけ…
MINEO MOROHASHI;...; HIROAKIKITANO(2002.5, Journal of theoretical biology)[Robustness as a Measure of Plausibility in Models of Biochemical Networks] 理由 実験医学数理モデル特集の第2章2. 「細胞内パラメーターを測定するという研究志向」の参考…
Seita Miyazawa;...; Shigeru Kondo(2010.9, Nature Communications)[Blending of animal colour patterns by hybridization] 理由 実験医学数理モデル特集の第1章3. 「反応拡散型数理モデル」の参考文献 概要 生物学者は長い間動物の色のパターンの驚くべき…
Satoshi Hiraoka;...;Wataru Iwasaki(2016.7, Microbes Environ.)[Metagenomics and Bioinformatics in Microbial Ecology: Current Status and Beyond] 理由 実験医学数理モデル特集の第1章2.「バイオインフォマティクスの全体像」の参考文献 概要 メタゲノ…
Ma W;...;Tang C(2009.8, Cell)[Defining network topologies that can achieve biochemical adaptation.] 理由 「実験医学 数理モデル特集」第1章1. システム生物学 の参考文献 理由 多くのシグナル伝達系は適応を示す。すなわち、刺激に応答した後それらを…
Takashi Saitou;...;Takashi Suzuki(2012.4, Journal of Theoretical Biology)[Mathematical modeling of invadopodia formation] 理由 昔買った実験医学の数理モデル特集を改めて読もうの企画 概要 浸潤癌細胞は、癌の浸潤において重要な過程を行う、浸潤突…
Ross A. Kelly;...;S. R. Pop & Stewart J. Chidlow(2019.12, BMC Theoretical Biology and Medical Modelling)[Modelling the effects of glucagon during glucose tolerance testing] 理由 BMCを読もうキャンペーン 概要 背景 グルコース負荷試験は、糖尿…
Chengyou Liu;...;Hang Qin, Yong Ding & Hongbing Jiang(2019.12, Theoretical Biology and Medical Modelling)[UGM: a more stable procedure for large-scale multiple testing problems, new solutions to identify oncogene] 理由 TBMM読もうキャンペー…
Xiaodan Sun;...;Yanni Xiao(2020.1, Theoretical Biology and Medical Modelling)[Modeling methods for estimating HIV incidence: a mathematical review] 理由 TBMM読もうキャンペーン 概要 HIVの感染を推定することは、この感染の疫学を観察し、検査と…
Kyungreem Han;...; MooYoung Choi(2020.2, BMC Theoretical Biology and Medical Modelling volume)[Computational modeling of the effects of autophagy on amyloid-β peptide levels] 理由 TBMMを読もうキャンペーン 概要 背景 オートファジーは進化的に…
Yin Wang;..; Xianzheng Sha(2020.3, BMC Theoretical Biology and Medical Modelling)[The self-organization model reveals systematic characteristics of aging] 理由 TBMMを読もうキャンペーン 概要 背景 老化は基本的な生物学的過程であり、重要なバイ…
Jian-Hong Sun;...;Shu-Qun Liu(2020.4, BMC Theoretical Biology and Medical Modelling)[Methylation-driven model for analysis of dinucleotide evolution in genomes] 理由 いつも使ってる論文収集サイトにTBMが載っておらず、読み損ねていたので 概要 …
Lale Asik;...;Angela Peace(2020.4 Journal of Theoretical Biology)[The effects of excess food nutrient content on a tritrophic food chain model in the aquatic ecosystem] 理由 JTBの新着論文 概要 生態学的化学量論は環境相互作用におけるエネルギ…
Robert West; Mauro Mobili(2020.4, Journal of Theoretical Biology)[Fixation properties of rock-paper-scissors games in fluctuating populations] 理由 JTBの新着論文 概要 ジャンケンは生態学また微生物学における周期的な優勢を比喩的にモデル化する…
Koen J.van Benthem;Meike J.Wittmann(2020.4, Journal of Theoretical Biology)[Density dependence on multiple spatial scales maintains spatial variation in both abundance and traits] 理由 JTBの新着論文 概要 集団密度は、配偶者の発見と競争のよ…
Alix M.C.Sauve;...;Frédéric Barraquan(2020.4, Journal of Theoretical Biology)[The effect of seasonal strength and abruptness on predator–prey dynamics] 理由 JTBの新着論文 概要 生態学における協約する動的な系は、季節性のサイクルからカオスに…
NoyCohen(2020.4, Journal of Theoretical Biology)[Force distribution and multi-scale mechanics in smooth muscle tissues] 理由 JTBの新着論文 概要 健康的に機能するうえで、多くの生理学的過程における平滑筋組織の機械的役割は必須である。この研究…
Jie Yin;...;Xi Chen(2008.12, PNAS)[Stress-driven buckling patterns in spheroidal core/shell structures] 理由 教科書に載ってた参考文献 概要 多くの自然界の果実や野菜はおおよそ回転楕円体の形を採用しており、異なる波打ち形トポロジーの特徴を持つ…
Hanh Thi-Kim Vu;...;Jochen Christian Rink(2019.11, Developmental Cell)[Dynamic Polarization of the Multiciliated Planarian Epidermis between Body Plan Landmarks] 理由 教科書に載ってた参考文献 概要 極性とは、全ての組織的なスケールで現れる生…
Hisao Honda; Atsushi Mochizuki(2001.12, DEVELOPMENTAL DYNAMICS)[Formation and maintenance of distinctive cell patterns by coexpression of membrane‐bound ligands and their receptors] 理由 教科書に載ってた参考文献 概要 傾斜的な、もしくはチェ…
Noboru Suzuki;...;Shigeru Kondo(2003.6, PNAS)[Traveling stripes on the skin of a mutant mouse] 理由 教科書に載ってた参考文献 概要 動物発生の中で、一見形の無い卵から自律的に複雑な構造が形成される。細胞がそれぞれの細胞より大きい空間パターン…
K. J. Painter;...;H. G. Othmer(1996.11, PNAS)[Stripe formation in juvenile Pomacanthus explained by a generalized Turing mechanism with chemotaxis] 理由 教科書に載ってた参考文献 概要 パターン形成における最近の興味は、チューリングによる萌芽…
John E. Pearson(1993.7, Science)[Complex Patterns in a Simple System] 理由 教科書に載ってた参考文献 概要 単純な反応拡散モデルの数値計算によって、驚くほど多様な不規則な時空間パターンが明らかになった。これらのパターンは有限振幅の摂動に応答し…
Kyoung J. Lee;...;Harry L. Swinney(1993.7, Science)[Pattern Formation by Interacting Chemical Fronts] 理由 ここしばらくの教科書に載ってた参考文献 概要 連続的な供給のある薄いゲル層における双安定な化学反応での実験によって、時空間パターンの新…
