Chia-Yi Cheng;..;Gloria M. Coruzzi(2021.9, Nature Communications)[Evolutionarily informed machine learning enhances the power of predictive gene-to-phenotype relationships] 理由 GWASの勉強してるときに見つけた 概要 ゲノムの特徴から表現型の…

James Cotterell & James Sharpe(2010.11, Molecular Systems Biology)[An atlas of gene regulatory networks reveals multiple three-gene mechanisms for interpreting morphogen gradients] 理由 こちらも実習で使う論文 概要 モルフォゲン勾配の解釈は…

Shuji Ishihara;...; Tatsuo Shibata(2005.9, Genes Cells.)[Cross talking of network motifs in gene regulation that generates temporal pulses and spatial stripes] 理由 演習で使う論文。冬休みで時間に余裕が出てきたので 概要 遺伝子制御ネットワー…

Yonit Maroudas-Sacks;...; Kinneret Keren(2020.11, nature physics)[Topological defects in the nematic order of actin fibres as organization centres of Hydra morphogenesis] 理由 前参加した若手の会で聞いて面白そうだったやつ 概要 動物の形態形…

Masayo Inoue and Kunihiko Kaneko (2021.8 Phys. Rev. Research)[Entangled gene regulatory networks with cooperative expression endow robust adaptive responses to unforeseen environmental changes] 理由 Slackに流れ着いていたので 概要 生物は環…

Masatomo Iwasa; Dan Tanaka(2017.9, Physics Letters A)[Mechanism underlying the diverse collective behavior in the swarm oscillator model] 理由 こないだ参加した学会で見た 概要 泳ぐ振動子モデルは相互作用する化学走性粒子の長期的な振舞いを記述…

Alya A Arabi(2021.4, FUTURE DRUG DISCOVERY)[Artificial intelligence in drug design: algorithms, applications, challenges and ethics] 理由 こないだ参加した学会で興味をもったやつ 概要 薬剤の発見パラダイムは、機械学習(ML)や人工知能(AI)の進歩…

Kei Iida;...; Masatoshi Hagiwara(2021.8, bioRxiv)[Switching of OAS1 splicing isoforms mitigates SARS-CoV-2 infection] 理由 こないだ参加した学会で紹介されてた 概要 背景 コロナウイルス感染症(COVID-19)患者ゲノムから集めた急速に蓄積している疾…

José-Alain Sahel;...;Botond Roska(2021.5, Nature Medicine)[Partial recovery of visual function in a blind patient after optogenetic therapy] 理由 参加した学会で出てきて役に立ちそうだったので 概要 光遺伝学は、神経疾患における神経機能の変異…

Joyce, G. (2002.7, Nature)[The antiquity of RNA-based evolution.] 理由 こないだ参加した学会で出てきた 概要 現在地球に存在することが知られている全ての生物と、地質記録で証拠が存在する生物は、DNAゲノムとタンパク質酵素に基づく同じ形態を示すよ…

Daisuke Kurihara;...;Tetsuya Higashiyama(2015.11, Deveopment)[ClearSee: a rapid optical clearing reagent for whole-plant fluorescence imaging] 理由 こないだ参加したニコンセミナーの後貰った冊子に乗ってた(NIKON JOICO AWARD) 概要 正確な形態と…

Aiko Sada;...;Tudorita Tumbar(2016.5, Nature Cell Biology)[Defining the cellular lineage hierarchy in the interfollicular epidermis of adult skin] 理由 こないだ参加したニコンセミナーの後貰った冊子に乗ってた(NIKON JOICO AWARD) 概要 濾胞間表…

Shin-Ya Isobe;...;Chikashi Obuse(2021.7, Cell Reports)[Protein phosphatase 1 acts as a RIF1 effector to suppress DSB resection prior to Shieldin action] 理由 今度セミナーに来る人の論文 概要 DNA二本鎖切断(DSBs)は、主に相同組換え修復(HDR)経…

Shin-Ya Isobe;...;Chikashi Obuse(2017.7, Cell reports)[Inhibition of RIF1 by SCAI Allows BRCA1-Mediated Repair] 理由 学内セミナーに来る人の論文 概要 DNA二本鎖切断(DSBs)は、相同組換え修復(HDR)経路か非相同末端再結合(NHEJ)経路のどちらかで修復…

Jeff Jones(2010.4, Artificial Life)[Characteristics of Pattern Formation and Evolution in Approximations of Physarum Transport Networks] 理由 アリの輸送ネットワークの論文を紹介したら、後輩が教えてくれた 概要 パターン形成の多くの研究は、複…

Siavash Monfared;...;Amin Doostmohammadi(bioRxiv, 2021.8)[Mechanics of Live Cell Elimination] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 細胞層は押し出し過程を通じて不要な細胞を除去する。この過程は健康な組織と欠陥のある組織のふるまいが重要である…

Wang, D.;...;Gao, G.(2019.2, Nat Rev Drug Discov)[Adeno-associated virus vector as a platform for gene therapy delivery.] 理由 今度の仕事の事前学習 概要 アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターは、多様なヒト疾患治療の遺伝子輸送の優れたプラットフォ…

Kai Liu;...;Sheng Ding(2016.8, 11)[Chemical Modulation of Cell Fate in Stem Cell Therapeutics and Regenerative Medicine] 理由 今度の仕事の事前学習で出されたやつ 概要 再生医療の目的は損傷した組織の修復と再生、それらの不完全な機能の回復であ…

Yoshiaki Tsushima;...;Hiroshi Ando(2021.8, frontiers in Neuroscience)[Olfactory Stimulation Modulates Visual Perception Without Training] 理由 Twitterで流れてきておもしろそうだったので 概要 多くの研究から、嗅覚刺激は感情のような高次の認知…

Joachim Linssen;...;Andre J van der Ven(eLife, 2020.11)[A novel haemocytometric COVID-19 prognostic score developed and validated in an observational multicentre European hospital-based study] 理由 インターン先で教えてもらった論文 概要 COV…

Ole Seehausen;...;Alex Widmer(2014.2, Nature Reviews Genetics)[Genomics and the origin of species] 理由 ラボで話してるときに出てきたんだっけ 概要 種分化は基礎的な進化過程であり、その知見は生物多様性の起源を理解するのに重要である。この研究…

Guénaël Cabanes;...;Tanya Latty(2015.1, Behavioral Ecology)[Ants build transportation networks that optimize cost and efficiency at the expense of robustness] 理由 ラボの助教が教えてくれたやつ 概要 現代の人間社会のように、多くの生物システ…

Tanya Latty;...;Martin Middendorf(2011.2, J. R. Soc. Interface)[Structure and formation of ant transportation networks] 理由 助教が教えてくれた面白そうな論文 概要 多くの生物システムは物資や情報の輸送に大規模なネットワークを使う。アリも例外…

Teppei Yamaguchi;...;Patrick Matthias(2009.12, GENES & DEVELOPMENT)[Histone deacetylases 1 and 2 act in concert to promote the G1-to-S progression] 理由 色んなことが重なって知り合いになった人の論文 概要 ヒストン脱アセチル化酵素(HDACs)は、…

Zhengjian Zhang;...;Wen-Chen Yeh(2020.8, Scientific Reports)[Tissue-targeted R-spondin mimetics for liver regeneration] 理由 色んなことが重なって知り合いになった人の論文 概要 R-スポディン(RSPO)タンパク質はWntシグナリングを増幅させ、多様な…

Kota Ohno;...; Masaharu Nagayama(2021.6, scientific reports)[A computational model of the epidermis with the deformable dermis and its application to skin diseases] 理由 自分の研究関連 概要 皮膚バリアは表皮細胞の組織化された多層構造で与え…

Feliciani C;...;Hertl M.(2009.8, Br J Dermatol.)[IgG autoantibody reactivity against bullous pemphigoid (BP) 180 and BP230 in elderly patients with pruritic dermatoses.] 理由 自分の研究関連 概要 背景 掻痒性皮膚疾患の高齢患者はしばしば診断…

Al-Herz W, Nanda A.(2011.9, Pediatr Dermatol.)[Skin manifestations in primary immunodeficient children.] 理由 自分の研究関連 概要 原発性免疫不全症（PID）では、皮膚症状がよく見られます。患者の多くの場合では、兆候を示し、PIDの初期診断の重要…

Trayes KP, Savage K, Studdiford JS. (2018.9,Am Fam Physician. )[Annular Lesions: Diagnosis and Treatment.] 理由 自分の研究関連 概要 環状皮疹は多様な疾患で見られる。これらの皮膚所見の見た目と病歴の知見は、診断を補助しうる。遠心的に成長する…

Joshua C. Kynaston;...;Christian A. Yates(2021.8, bioRxiv)[An equivalence framework for an age-structured multi-stage representation of the cell cycle] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 年齢で層別化された個々の細胞集団の確率論もしくは決…