2020-09-01から1ヶ月間の記事一覧
Daniel Koch(2020.8, Journal of Theoretical Biology)[Homo-Oligomerisation in Signal Transduction: Dynamics, Homeostasis, Ultrasensitivity, Bistability] 理由 JTB読もうキャンペーン 概要 タンパク質のホモ二量体形成は遍在する現象であり、その正確…
Tokuharu Sekiya;...;Yoh Iwasa(2020.8, Journal of Theoretical Biology)[Bovine mastitis and optimal disease management: Dynamic programming analysis] 理由 JTBを読もう 概要 感染症に対処する賢い意思決定は、公衆衛生と同様に畜産、農業の成功にも…
Ricardo Martinez-Garcia;...; Justin M.Calabrese(2020.8, Journal of Theoretical Biology)[How range residency and long-range perception change encounter rates] 理由 JTBを読もうね 概要 遭遇率は、種内と種間特異的な相互作用の移動戦略を結び付け…
Akane Hara; Yoh Iwasa(2020.8、Journal of Theoretical Biology)[Autoimmune diseases initiated by pathogen infection: Mathematical modeling] 理由 JTBを読もう 概要 人における多くの不治の病は自己免疫と関係があり、書記にはウイルス感染によって誘…
Melinda Choua;...;Juan A.Bonachela(2020.8, Journal of Theoretical Biology)[The effect of viral plasticity on the persistence of host-virus systems] 理由 JTBを読もう 概要 表現型の可塑性は個人の生存において重要な役割を果たす。微生物の宿主-ウ…
Rose-MarieCarlsson;..;GergelyRöst(2020.7, Journal of Theoretical Biology)[Modeling the waning and boosting of immunity from infection or vaccination] 理由 JTBを読もう 概要 自然感染や免疫性獲得に従う免疫は、感染やワクチン接種からの時間とと…
Alex Best;...;Helen Marriott(Journal of Theoretical Biology 2020.7)[A mathematical model shows macrophages delay Staphylococcus aureus replication, but limitations in microbicidal capacity restrict bacterial clearance] 理由 JTBを読もうキャ…
Irene Balelli;...; Rodolphe Thiébaut(2020.6, Journal of Theoretical Biology)[A model for establishment, maintenance and reactivation of the immune response after vaccination against Ebola virus] 理由 JTBを読もうキャンペーン 概要 東アフリカ…
A.W.Omta;...;M.J.Follows(2020.6, Journal of Theoretical Biology)[Quantifying nutrient throughput and DOM production by algae in continuous culture] 理由 JTBを読もう 概要 淡水と海水の藻類は、吸収と蓄積と滲出を制御することで栄養の要求と入手…
Lee Worden(2020.5, Journal of Theoretical Biology)[Conservation of community functional structure across changes in composition in consumer-resource models] 理由 JTBを読もう 概要 メタゲノムやメタトランスクリプトーム技術のような大量処理の配…
Anna Konstorum;...;Suzy V.Torti(2020.5, Journal of Theoretical Biology)[Systems biology of ferroptosis: A modeling approach] 理由 JTBを読もうキャンペーン 概要 フェロトーシスは、最近発見された鉄依存的制御の細胞死(RCD)の形態であり、多価不飽…
Victor Garcia;..; FengFu(2020.5, Journal of Theoretical Biology)[Cancer-induced immunosuppression can enable effectiveness of immunotherapy through bistability generation: A mathematical and computational examination] 理由 JTBを読もうキャ…
Tomohiko Kuwabara; Kensuke Igarashi(2020.5, Journal of Theoretical Biology)[Thermotogales origin scenario of eukaryogenesis] 理由 自分の専門分野の最近の論文を読むことにした 概要 真核生物がどのように生まれたのか、は進化生物学の一つの謎であ…
Peter A. Spiro,;...;Hans G. Othmer(1997.7, PNAS)[A model of excitation and adaptation in bacterial chemotaxis] 理由 マレー数理生物学入門 第11章「反応拡散、走化性、非局所メカニズム」の参考文献 概要 手に入れやすく、シグナル伝達や興奮、適応、…
Akira Okubo(1986. Advances in Biophysics)[Dynamical aspects of animal grouping: Swarms, schools, flocks, and herds] 理由 マレー数理生物学入門 第11章「反応拡散、走化性、非局所メカニズム」の参考文献 概要 動物の群れの形成は、群れの形成時に大…
Alexey Kazarnikovac and Heikki Haario(2020.9, Journal of Theoretical Biology)[Statistical approach for parameter identification by Turing patterns] 理由 専門分野の雑誌で気になったやつ 概要 形態形成や多細胞構造の発生などの、生物のパターン形…
Marco Albrecht;,,,;Thomas Sauter(BMC Theoretical Biology and Medical Modelling)[Computational models of melanoma] 理由 よく読む論文雑誌の最近のやつ 概要 遺伝子やタンパク質、細胞は相互に影響しあい、結果的にパターンを作る。このパターンは実験…
Arun Sampathkumar(2020.8, Development)[Mechanical feedback-loop regulation of morphogenesis in plants] 理由 ラボSlackとりあえずラスト 概要 形態形成は、高度に制御された生物過程であり、生物が特定の形の細胞や器官を発達させるために重要である。…
Sosuke Fujita;...; Yu-ichiro Nakajima(2019.8, ZOOLOGICAL SCIENCE)[Cell proliferation controls body size growth, tentacle morphogenesis, and regeneration in hydrozoan jellyfish Cladonema pacificum] 理由 ラボSlack 概要 クラゲは約60億年前から…
Richard Bailleul;..;Jonathan Touboul(2020.7, Cell)[A “Numerical Evo-Devo” Synthesis for the Identification of Pattern-Forming Factors] 理由 ラボSlackに流れてきたよ 概要 動物たちは彼らの衣服を飾るモチーフにおける広い多様性を示すが、これらの…
Tatyana Radoeva;...; DolfWeijers(2019.9, Developmental cell)[Evolution, Initiation, and Diversity in Early Plant Embryogenesis] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 植物における胚発生の間、細胞の同一性は、単細胞のころから始まる最初から特定され…
O. Hamant and T.E. Saunders(2020.7, Annual Review of Cell and Developmental Biology)[Shaping Organs: Shared Structural Principles Across Kingdoms] 理由 ラボSlackで流れてきた 概要 発生は、一つの受精細胞から機能のある成体へ個体の形態形成を内…
Mitsuhiro Matsuda;...; Cantas Alev(2020.4, nature)[Recapitulating the human segmentation clock with pluripotent stem cells] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 多能性幹細胞は胚発生や器官形成の異なる側面をモデル化するためにますます使われて…
P.Hogeweg(1994.8, Physica D: Nonlinear Phenomena)[Multilevel evolution: replicators and the evolution of diversity] 理由 金子邦彦「生命とは何か」の参考文献 概要 ここでは、進化の研究における最初の目的を多段階の過程として報告する。これは、異…
Kunihiko Kaneko(1990.3, Physica D: Nonlinear Phenomena)[Clustering, coding, switching, hierarchical ordering, and control in a network of chaotic elements] 理由 金子邦彦「生命とは何か」の参考文献 概要 カオスな要素のネットワークを大域結合写…
Yoshihiro Morishita; Yoh Iwasa(2008. Bulletin of Mathematical Biology)[Growth Based Morphogenesis of Vertebrate] 理由 「理論生物学」第4章4-3「器官形成ダイナミクスの数理」の参考文献 概要 発生現象には、多くの遺伝子やそれらの制御関係が関与す…
Hisao Honda;...;TatsuzoNagai(Journal of Theoretical Biology}[A three-dimensional vertex dynamics cell model of space-filling polyhedra simulating cell behavior in a cell aggregate] 理由 「理論生物学」第4章4-3「器官形成ダイナミクスの数理」…
STUART A. NEWMAN and WAYNE D. COMPER(1990, Development)['Generic' physical mechanisms of morphogenesis and pattern formation] 理由 「理論生物学」第4章4-2「多細胞体形態形成のための細胞モデル」の参考文献 概要 形態形成とパターン形成における’…
Jennifer A Zallen; Eric Wieschaus (2004.3, Developmental cell)[Patterned Gene Expression Directs Bipolar Planar Polarity in Drosophila] 理由 「理論生物学」第4章4-2「多細胞体形態形成のための細胞モデル」の参考文献 概要 ショウジョウバエにおけ…
Hisao Honda;...;Masaharu Tanemura(2008.6, Developmental Dynamics)[Two different mechanisms of planar cell intercalation leading to tissue elongation] 理由 「理論生物学」第4章4-2「多細胞体形態形成のための細胞モデル」の参考文献 概要 ウニの腸…
