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生物学(主に理論生物学)の論文を書くために読みます

2019-02-01から1ヶ月間の記事一覧

NeuroRDF:アルツハイマー病のバイオマーカー候補の優先順位付けのための高度に精選されたデータの意味論的統合

Iyappan, Anandhi;..;Senger, Philipp (2016.7,JOURNAL OF BIOMEDICAL SEMANTICS)[NeuroRDF: semantic integration of highly curated data to prioritize biomarker candidates in Alzheimer's disease] 理由 炎症性サイトカイン4 概要 背景:神経変性疾患…

円形脱毛症の数理モデル

Dobreva, Atanaska...;Cogan, N. G.(2015.9, Journal of Theoritical Biology) [Mathematical model for alopecia areata] 理由 炎症性サイトカイン3 概要 円形脱毛症(AA)は自己免疫疾患で、その臨床表現型は頭皮や体の他の部分での明確な無毛パタン形成が特…

小膠細胞における動的NF-κBの定量的特徴化と解析

Sheppard, Patrick W.;...;Khammash, Mustafa(2011.7)[Quantitative characterization and analysis of the dynamic NF-kappa B response in microglia] 理由 炎症性サイトカイン2 概要 背景:小膠細胞におけるNF-κB転写因子の活性化とその関連遺伝子発現は…

肺での粒子状物質に晒されることに続く炎症と繊維症のエージェント・ベースモデル

Brown, Bryan N.;...;Vodovotz, Yoram(2011.6)[An agent-based model of inflammation and fibrosis following particulate exposure in the lung] 理由 炎症関係を勉強するために今回から炎症性サイトカインの論文です 概要 炎症と気道リモデリングは多様な…

昆虫における局所的な光の検出:複眼の背側縁領域における単眼専門化

Labhart, T;...;Meyer, EP(1999.12)[Detectors for polarized skylight in insects: A survey of ommatidial specializations in the dorsal rim area of the compound eye] 理由 oscillation6。 概要 太陽から離れて、空の局在パターンは昆虫に視覚的なコン…

鳥の春の移住の北大西洋振動とタイミング

Huppop, O;...;Huppop, K(2003.2)[North Atlantic Oscillation and timing of spring migration in birds] 理由 oscillation5。 概要 渡り鳥はここ40年変わらない方法とサンプリング効果で1909年から北海の南西のヘルゴランド島で捕まえられてきた。短距離、…

カリブ海のサンゴ礁の平坦化:広範囲の領域で構造的な複雑さが失われている

Alvarez-Filip, Lorenzo;...;Watkinson, Andrew R.(2009.8)[Flattening of Caribbean coral reefs: region-wide declines in architectural complexity] 理由 oscillationシリーズ4 概要 サンゴ礁は生物多様性が豊富である。その主な理由はそれらの複雑な構…

熱帯雨林領域の気候の空間パタンと最近の傾向

Malhi, Y;...;Wright, J(2004.3)[Spatial patterns and recent trends in the climate of tropical rainforest regions] 理由 Oscillationシリーズ3 概要 森林被覆のカラーマップと気候学的なデータベースを用いて、1960-1998の期間の熱帯雨林領域の平均気温…

適合した足の行動は歩行と走行の基本動態を説明する

Geyer, Hartmut;...;Blickhan, Reinhard(2006.11)[Compliant leg behaviour explains basic dynamics of walking and running] 理由 oscillation論文二つ目。 概要 ヒトの運動の基本メカニズムは、歩行における剛直な脚の跳躍と走行における対応性脚の反跳に…

細胞内カルシウムシグナルの空間的、時間的側面

Thomas, AP;...;Putney, JW(1996.11)[Spatial and temporal aspects of cellular calcium signaling] 理由 修論発表を聞いて生物学の"振動現象"が気になってきたので 概要 細胞基質のCa2+シグナルは持続型刺激条件下でさえもしばしば複雑な時空間パターンを…

カタツムリ、イボニシにおけるエストロゲン受容体の組織優先的発現

Kajiwara, Masaaki;...;Takahashi, Yuji(2006.9)[Tissue preferential expression of estrogen receptor gene in the marine snail, Thais clavigera] 理由 三浦先生シリーズ5 概要 性ステロイドホルモンは軟体動物で幅広く観察され、性決定や、生殖腺の成熟…

大脳新皮質の発生に関与するHedgehogシグナリング

Komaba, Munekazu;...;Ishibashi, Makoto(2008.8)[Hedgehog signalling is involved in development of the neocortex] 理由 三浦先生シリーズ4 概要 Sonic hedgehogの機能は特に、中央神経系の腹側領域においてパターニングと細胞運命決定に必要不可欠であ…

ナフトキノンとその環境的意味のケミカルバイオロジー

Kumagai, Yoshito;...;Cho Arthur K.(2012)[The Chemical Biology of Naphthoquinones and its Environmental Implications] 理由 三浦先生シリーズ3 概要 キノンは炎症や抗炎症、そして抗ガン反応を促進したり、毒性を誘導するための生物システムと相互作用…

生体鉱物とそれらの模倣技術における架橋したナノ結晶

Oaki, Yuya;…;Imai, Hiroaki;(2006.8)[Bridged nanocrystals in biominerals and their biomimetics: Classical yet modern crystal growth on the nanoscale] 理由 三浦先生シリーズ2 概要 最初にナノスケール構造の実際の生体鉱物とそれらの模倣技術を示す…

生物学的なパタン形成を理解する枠組みとしての反応拡散モデル

Kondo, Shigeru;Miura, Takashi(2010.9)[Reaction-Diffusion Model as a Framework for Understanding Biological Pattern Formation] 理由 新シリーズ、三浦先生第一弾です 概要 チューリング、すなわち反応拡散(RD)モデルは発生中の動物胚の自己制御的なパ…

利他主義と処罰の共進化:利己的な処分者の役割

Nakamaru, M;Iwasa, Y(2006.6)[The coevolution of altruism and punishment: Role of the selfish punisher] 理由 磐佐先生シリーズ8。最終回です。 概要 処罰は非親族間の利他主義の進化を促進する重要なメカニズムである。以下の4つの可能な戦略を考慮し…

膨張間隔のある森林空間ダイナミクス:全体間隙領域と間隙面積分布

Kubo, T;...;Furumoto, N(1996.7)[Forest spatial dynamics with gap expansion: Total gap area and gap size distribution] 理由 磐佐先生シリーズ7? 概要 多様な森林生態系における森林ダイナミクスの最近の研究によって、林分は間隙の隣にある時に分布し…

森林の樹木の繁殖同調:カオスから同調し、かつ周期的な繁殖の形成

Satake, A;Iwasa, Y(2000.3)[Pollen coupling of forest trees: Forming synchronized and periodic reproduction out of chaos] 理由 磐佐先生シリーズ6 概要 老齢林における樹の多くは種子の同調を見せる。彼らの繁殖活動は数年間で大きい分散があり、異な…

性選択のランナウェイ過程による複数の性傾向の進化

POMIANKOWSKI, A;IWASA, Y(1993.8)[EVOLUTION OF MULTIPLE SEXUAL PREFERENCES BY FISHER RUNAWAY PROCESS OF SEXUAL SELECTION] 理由 磐佐先生シリーズ5 概要 フィッシャーの過程による複数の女性の好みの進化が調査された。進化的平衡を決定する主な因子は…

不利益の進化の良い親と良い遺伝子

Iwasa, Y;Pomiankowski, A(1999.9)[Good parent and good genes models of handicap evolution] 理由 磐佐先生シリーズ4 概要 以前、男性の質が遺伝性で子孫の生存能力を向上させるような良い遺伝子の不利益モデルを研究した。男性が直接的な利益(例えば、親…

leading eight:間接評価によって協力を維持するような社会基盤

Ohtsuki, H;Iwasa, Y(2006.4)[The leading eight: Social norms that can maintain cooperation by indirect reciprocity] 理由 磐佐先生シリーズ3 概要 間接評判の理論は単発の相互作用に参加するような無関係な人の間の協力の進化を説明する。評判を使って…

"徳"をどのように定義すべきか? 間接的な相互利益における評価ダイナミクス

Ohtsuki, H; Iwasa, Y(2004.11)[How should we define goodness? Reputation dynamics in indirect reciprocity] 理由 磐佐先生シリーズ2 概要 間接的な相互利益の理論はひとの間の協力を説明するのに重要である。社会的相互作用の相手はしばしば変わるので…

格子構造の集団における協力の進化

Nakamaru, M;...;Iwasa, Y(1997.1)[The evolution of cooperation in a lattice-structured population] 理由 「生命の数理」執筆者の巌佐庸先生シリーズ第一弾 概要 個人が局所的に隣人としか相互作用できないような、格子構造の場所における無関係な個人間…

アテローム性動脈硬化の初期段階の常微分方程式モデル:免疫反応のメカニズム

Anna Ougrinovskaia:...;Mary R. Myerscough(2010.8)[An ODE Model of Early Stages of Atherosclerosis: Mechanisms of the Inflammatory Response] 理由 アテローム性動脈硬化症の反応拡散モデルについての論文を読んでから、また別の著者で似たものを見つ…

花は花粉媒介者の音に反応して数分間で蜜の糖濃度を上昇させる

Marine Veits;...;Lilach Hadany(2018.12 pre)[Flowers respond to pollinator sound within minutes by increasing nectar sugar concentration.] 理由 日経サイエンスで見つけた論文が面白かったので 概要 植物は音を聞くことができるのだろうか?つまり、…

自己免疫疾患モデルの動的特性:寛容、発火、静止

Iwami, Shingo;..;Kajiwara, Tsuyoshi(2007.6)[Dynamical properties of autoimmune disease models: Tolerance, flare-up, dormancy] 理由 岩見先生シリーズ7。さいごです 概要 自己免疫疾患のメカニズムは長年難問のままだ。この論文では、個人の免疫反応…

鳥インフルエンザの流行予防:どの方針を選ぶべきか?

Iwami, Shingo;...;Liu, Xianning(2008.6)[Prevention of avian influenza epidemic: What policy should we choose?] 理由 岩見先生シリーズ6 概要 鳥インフルエンザのヒト間伝染は ほとんど報告されておらず、限定的で非効率的、そして非持続的だと考えら…

鳥インフルエンザ流行:我々は流行を防げるか?

Iwami, Shingo;...;Liu, Xianning(2009.3)[Avian flu pandemic: Can we prevent it?] 理由 岩見先生シリーズ5 概要 東南アジア、ヨーロッパ、そしてアフリカでの病原体H5N1鳥インフルエンザの高い発生率によって、家禽が衝撃的な結果を受け、数多くのヒトが…