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生物学(主に理論生物学)の論文を書くために読みます

2019-09-01から1ヶ月間の記事一覧

解剖学的なコンピューターシミュレーション研究はヒトの心臓における螺旋波の流れを誘導する。

Sanjay R. Kharche;...;Vadim N. Biktashev(2015.10, Biomed Res Int.)[A Computer Simulation Study of Anatomy Induced Drift of Spiral Waves in the Human Atrium] 理由 Biological pattern formationの論文 概要 心臓の解剖学と、興奮の螺旋波の相互作…

酵母バイオフィルムにおける花パターン形成のメカニズムとしての非線形な細胞拡散として栄養制限のある成長

Alexander Tam;...;Benjamin J.Binder(2018.7, Journal of Theoretical Biology)[Nutrient-limited growth with non-linear cell diffusion as a mechanism for floral pattern formation in yeast biofilms] 理由Biological Traveling wavesの論文 概要先行…

社会的かつ移動性の粘液細菌は、成長、移動性そして菌体外多糖によってコロニーを拡大する

Pintu Patra;...;Oleg A. Igoshin(2016.6, PLoS Competational Biology)[Colony Expansion of Socially Motile Myxococcus xanthus Cells Is Driven by Growth, Motility, and Exopolysaccharide Production] 理由 Biological traveling waveの論文 概要 粘…

輸送方程式を共役させた波数選択

Arnd Scheel; Angela Stevens(2017.11, Journal of Mathematical Biology)[Wavenumber selection in coupled transport equations] 理由 traveling wavesの論文 概要 バクテリアのrun-and-tumbleダイナミクスの最小モデルにおける波数選択のメカニズムを調べ…

反応拡散と畳み込みとしての進化的分布と競争

Yosef Cohen;Gonzalo Galiano(2013.10, Bulletin of Mathematical Biology)[Evolutionary Distributions and Competition by Way of Reaction-Diffusion and by Way of Convolution] 理由 traveling wavesの論文 概要 自然選択による進化はかなり至る所に偏…

化学走性と集団圧力に応用する反応拡散系における位相速度

Sanjeeva Balasuriya;Georg A. Gottwald(2009.11, Journal of Mathematical Biology)[Wavespeed in reaction–diffusion systems, with applications to chemotaxis and population pressure] 理由 Biological traveling waveの論文 概要 摂動のある反応拡散…

粘液細菌の群れの拡大の2連続体モデル

Angela Gallegos;...;;Alex Mogilner(2006.5, Bulletin of Mathematical Biology)[Two continuum models for the spreading of myxobacteria swarms] 理由 Biological traveling waveの論文 概要 栄養培地上の粘液細菌バクテリアコロニーの拡大を解析する。…

実験と数値的方法を介した生物に学ぶロボット波打ち鰭の鰭筋軌道の追跡の評価

Xiaojia Xiang;...;Han Zhou(2014.1, International Journal of Advanced Robotic Systems)[Evaluating the Fin-Ray Trajectory Tracking of Bio-Inspired Robotic Undulating Fins via an Experimental-Numerical Approach] 理由 Biological waveの論文 概要…

リズム的なシグナルを作り出す二重連鎖構造のある神経振動子の理論的かつ進化的パラメーターチューニング

Yuya Hattori;...;Toshio Tsuji(2012.2, Neural computation)[Theoretical and Evolutionary Parameter Tuning of Neural Oscillators with a Double-Chain Structure for Generating Rhythmic Signals] 理由 Biological waveを扱う論文 概要 二重連鎖を持つ…

適応型数値スキームのある拡張非線形Kierstead–Slobodkin反応輸送モデルの空間地形効果

Owolabi, Kolade M.;...;Patidar, Kailash C.(SPRINGERPLUS, 2016.3,)[Effect of spatial configuration of an extended nonlinear Kierstead–Slobodkin reaction‑transport model with adaptive numerical scheme] 理由 "biological wave"の論文 概要 この…

アラスカクック湾におけるゴマフアザラシの移動場所の空間モデル

R. A. Montgomery;...;P. L. Boveng(2007.7, MARINE ECOLOGY PROGRESS SERIES)[Spatial modeling of haul-out site use by harbor seals in Cook Inlet, Alaska] 理由 "Biological wave"の論文のうち被引用数が1位のもの 概要 ゴマフアザラシPhoca vitulina…

心筋細胞におけるフィードバック制御誘導性のパタン形成:数理モデル研究

Gaeta, Stephen A.;...;Christini, David J.(2010.10, JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY)[Feedback-control induced pattern formation in cardiac myocytes: A mathematical modeling study] 理由 生物の”波"について知りたくなったので 概要 心臓の不整脈は…

位相固定の稀な遺伝子型を示す宿主と寄生者の赤の女王ダイナミクス

Jomar F. Rabajante;...; Dieter Ebert(2016.3, Science Advances)[Host-parasite Red Queen dynamics with phase-locked rare genotypes] 理由 ラボに回ってきたシンポジウム案内で面白そうな研究してる人を見つけたので 概要 宿主と寄生者間の相互作用は、…

生物学史から見た死 

小川 眞里子(1993, 生命倫理)[生物学史から見た死 The Idea of Death in the History of Biology] 理由 「生物学最大の問題のひとつは、なぜ死ぬのかだろう」という話をしたので 概要 なぜ生物が死ぬのか、という問題には2つの側面がある。一つは老化と死の…

簡単に服を着替えること:コネキシン41.8は皮膚のパターン多様性を制御する

Watanabe M1, Kondo S.(2012.2, Pigment Cell Melanoma Res. )[Changing clothes easily: connexin41.8 regulates skin pattern variation.] 理由 今度の発表のIntroに使おうとおもったので 概要 動物の皮膚パターンは彼らの生存にとても重要であるが、皮膚…

多形紅斑:50人の患者の臨床的特徴と自然史

Francina Lozada, D.; Sol Silverman, Jr.,(1978.11, oral medicine)[Erythema multiforme Clinical characteristics and natural history in fifty patients] 概要 「自然史」という言葉を使ってみたくなったので、病気の自然史とやらを調べてみた。 概要 …

残留分割法とその応用に基づく伝統的な中国医学と臨床の生化学的指標における症状の要素間の関係の再解析の数理モデル

Jin R;...;Zhao Q.Zhong(2011.8, Xi Yi Jie He Xue Bao.)[A mathematical model for re-analysis of the relationship between essence of syndromes in traditional Chinese medicine and clinical biochemical indicators based on the residual-split met…

鍼治療の数理モデルの開発に向けて

Friedman MJ, Birch S, Tiller WA. (1989, Acupunct Electrother Res. )[Towards the development of a mathematical model for acupuncture meridians.] 理由 漢方の話2 概要 古来の鍼治療と中国医学の伝統的な概念は、西洋とは全く異なる文化から来ており…

中国のブラックボックス-伝統的な漢方の科学モデル

Matthias Theodorou; Johannes Fleckenstein(2019.2, Journal of Acupuncture Research)[The Chinese Black Box – A Scientific Model of Traditional Chinese Medicine] 理由 こないだ気になった漢方の数理モデルの論文 概要 伝統的な漢方(TCM)のモデルは、…

動的ネットワークバイオマーカーによって、複合病が突然悪化する初期警告シグナルを検出する

Luonan Chen, Rui Liu, Zhi-Ping Liu, Meiyi Li & Kazuyuki Aihara(2012.3, Scientific Reports volume)[Detecting early-warning signals for sudden deterioration of complex diseases by dynamical network biomarkers] 理由 カレー屋に行ったときに、「…

形態形成の化学的基盤

A. M. Turing(1952.8, Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences)[The Chemical Basis of Morphogenesis] 理由 そういえばTuring先生の論文読んでなかったので 概要 モルフォゲンと呼ばれる化学物質は、反…

量子生物学の起源

Johnjoe McFadden and Jim Al-Khalili(2018.10, Proc Math Phys Eng Sci.)[The origins of quantum biology.] 理由 Youtubeで「量子生物学」なる分野の人のTED Talkを見つけたので 量子生物学は生命の最大の謎を解明するか? - YouTube 概要 量子生物学は新…

フィードバックループのある生化学シグナル伝達におけるマクスウェルの悪魔

Sosuke Ito; Takahiro Sagawa(2015.4, Nature Communications)[Maxwell’s demon in biochemical signal transduction with feedback loop] 理由 youtubeで生物物理の紹介してる動画を見つけたので。この先生の論文を探してみた 物理で生物を考えるwith情報理…

オスジロアゲハの蝶の翅における色のパタン形成のモデル

Toshio Sekimura;...;Philip Maini(2000.6, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences )[A model for colour pattern formation in the butterfly wing of Papilio dardanus] 理由 昨日読んだ蝶の翅模様の著者の別論文 概要 蝶のオスジロア…

蝶の翅のパタン形成:実験とモデル

Toshio Sekimura(2006.7, Math Everywhere)[Pattern Formation in Butterfly Wings: Experiments and Models] 理由 ラボに行ったら先輩が蛾を捕まえてきてたのを見て、蝶とかの翅の模様が気になったので 概要 蝶の翅は大量の、色のついた鱗粉細胞に覆われてい…

変動性紅斑角皮症の臨床的かつ遺伝的異質性

John E.A.Common;...;David P.Kelsell(2005.11, Journal of Investigative Dermatology)[Clinical and Genetic Heterogeneity of Erythrokeratoderma Variabilis] 理由 授業で聞いた症状 概要 皮膚障害の変動性紅斑角皮症(EKV)はコネキシン(Cx)31とCx30.3を…

進行性の変異性紅斑角皮症

Ishida-Yamamoto A (2016.3, J Dermatol.)[Erythrokeratodermia variabilis et progressiva.] 理由 授業で紅斑が移動する症状をきいたので。 概要 進行性の変異性紅斑角皮症(EKVP)は、固定された過角化した斑と一過的な紅斑が特徴の稀な遺伝性皮膚疾患である…

皮膚ガンのパタン形成:ガンの増殖と流体力学的相互作用の効果

Takuma Hoshino;...; Shigeyuki Komura(2019.3, Phys. Rev. E)[Pattern formation of skin cancers: Effects of cancer proliferation and hydrodynamic interactions] 理由 ラボの先生が教えてくれたので 概要 ガンと健康な細胞で構成される2進システムの数…

炎症の反応拡散方程式における化学走性効果

Cordula Reisch;Dirk Langemann(2019.9, Journal of Biological Physics)[Chemotactic effects in reaction-diffusion equations for inflammation] 理由 ラボの先生が教えてくれたので 概要 捕食者-被食者系は肝感染の間のウイルス数とリンパ球数の時間変化…

結節性硬化症の日本人患者における体細胞変異のtsc1とtsc2遺伝子の全てのエキソンの解析:10変異の報告

Yokihiko Yamashita;...;Mari Wataya‐Kaneda Kunihiko;....;Okio Hino(2000.3, American Journal of Medical Genetics)[Analysis of all exons of tsc1 and tsc2 genes for germline mutations in Japanese patients with tuberous sclerosis: Report of 10 …