2019-10-01から1ヶ月間の記事一覧
Reyes Benlloch;....;Francisco Madueño(2007.8, ANNALS OF BOTANY)[Floral Initiation and Inflorescence Architecture: A Comparative View] 理由 ラボセミナーで紹介されていたので 概要 背景 自然界で、植物の形態には莫大な多様性が見られる。これは特…
Rob Castel;...; Ronald Koes(2010.5, Jornal of experimental Botany)[Inflorescence development in petunia: through the maze of botanical terminology] 理由 ラボセミナーで紹介されていたので 概要 花を咲かせる植物は様々な方法で彼らの花を配列する…
Mariani FV(2010.5, Regen Med.)[Proximal to distal patterning during limb development and regeneration: a review of converging disciplines.] 理由 ラボセミナーで紹介されていた 概要 失った構造を再生することは一般的に異なるイベントを含んでいる…
Przemyslaw Prusinkiewicz;...; Enrico Coen(2007.6, SCIENCE)[Evolution and Development of Inflorescence Architectures] 理由 ラボのジャーナルで紹介されていた論文 概要 生物学的多様性における制限を理解するために、選択と発生がどのように相互作用…
西浦廉政(2003.2, 岩波書店)[自己複製と自己崩壊のパターンダイナミクス] 理由 理論の勉強 概要 グレイスコットモデル 数値結果：島状のスポットが次々と分裂し、領域を埋め尽くした後は消滅と分裂を繰り返す。 問題提起：「分裂」や「消滅」さらに解がどの…
A. J. Koch; H. Meinhardt(1994, Rev. Modern Physics)[Biological Pattern Formation : from Basic Mechanisms to Complex Structures] 理由 Pattern formationの論文 概要 高度に複雑な生物の確かな発生は、好奇心をそそる魅力的な問題である。一般に、基…
R.A. WAKEEL;...;L MARION I. WHITE(1992.2, British Jornal of Dermatology)[Subcorneal accumulation of Langerhans cells in erythema gyratum repens] 理由 自分の研究に近い論文 概要 葡行性迂回状紅斑(EGR)は腫瘍病の皮膚兆候である。上皮の上側で活性…
J.D.Murray; M.R.Myerscough(1991.4, Journal of Theoretical Biology)[Pigmentation pattern formation on snakes] 理由 生物のパターン形成 概要 ヘビの皮膚で見られる共通な、簡単もしくは複雑なパターンのいくつかをs作る細胞走性モデルメカニズムを考え…
Deborah R. Fowler;...;Przemyslaw Prusinkiewicz(1992, )[Modeling seashells] 理由 生物のパターン形成のモデル 概要 この論文では、画像合成過程に適する貝殻のモデリング法のを示す。これは貝殻表面の上皮パターンの活性-抑制モデルがある貝殻の形の地理…
David A.Young(1984.11, Mathematical Biosciences)[A local activator-inhibitor model of vertebrate skin patterns] 理由 生物のパターン形成の勉強 概要 脊椎動物の皮膚パターンのモデルは、活性性と抑制性の異なる2つの拡散性モルフォゲンを産生するも…
F. Borgogno;...;L. Ridolf(2009.3, Reviews of Geophysics)[Mathematical models of vegetation pattern formation in ecohydrology] 理由 植物のパターン形成を調べてたらなんか見つけた 概要 高度に組織化された植物のパターンは世界中の多くの見られる。…
Pau Atela;Christophe Gol´e:Scott Hotton(2002.7, Journal of Nonlinear Science)[A Dynamical System for Plant Pattern Formation: A Rigorous Analysis] 理由 植物のパターン形成を勉強 概要 植物のパターン形成をモデリングする離散動的システムの厳密…
Titikan Somboon;...;On-Uma Kheowan(2015.1, Phys. Chem. Chem. Phys.)[The effect of acetone on the dynamics of temporal oscillations and waves in the ruthenium-catalyzed Belousov–Zhabotinsky reaction] 理由 螺旋とか環状のパターンを勉強するた…
Francesc Sagués; Irving R. Epstein(Dalton Transactions)[Nonlinear chemical dynamics] 理由 BZ反応のパタン形成を勉強する 概要 非線形化学ダイナミクスの学際領域は、過去30年でかなり幅広くそして深くなった。その主題と応用は数学や物理学、生物学と…
M. R. MYERSCOUGH;...;K. J. PAINTER(1998, Bulletin of Mathematical Biology)[Pattern Formation in a Generalized Chemotactic Model] 理由 パタン形成の数理モデルの勉強 概要 多くのモデルが、発生学における空間パターン形成のために提案され、ゼロフ…
G.Catalano;...;A.MonroyE.Parisi(1981.8, Physica D: Nonlinear Phenomena)[A mathematical model for pattern formation in biological systems] 理由 タイトルの通り。 概要 生物学の問題における応用に関する反応拡散方程式の系を理論的かつ数値的に研究…
Philip K. Maini;...; Helene Nguyen Phong Chau(1997, Journal of the Chemical Society, Faraday Transactions)[Spatial pattern formation in chemical and biological systems] 理由 Pattern FormationのMathematical model 概要 発生生物学における中心…
ScottCamazine;...;J.D.Murray(1990.12, Journal of Theoretical Biology)[A mathematical model of self-organized pattern formation on the combs of honeybee colonies] 理由 BiologyのPattern FormationのMathematical model 概要 ミツバチの群れの巣で…
Alan Garfinkel;...;Linda L. Demer(2004.6, PNAS)[Pattern formation by vascular mesenchymal cells] 理由 Biological Pattern Formation のMathematical modeling 概要 胚形成において、未成熟な間葉系細胞はパターン化された組織への集合と組織化をする…
Anna Vanselow;...;Ulrike Feudel(2019.10, Jornal of Theoritical Biology)[When very slow is too fast - collapse of a predator-prey system] 理由Jornal of Theoritical Biology 概要臨界転移や安定状態の遷移は生態系のある状態において突然かつ予期で…
Kaoru Sugimura;...;Atsushi Mochizuki(2007.11, PLOS)[Self-organizing Mechanism for Development of Space-filling Neuronal Dendrites] 理由 BiologicalなPattern formationのMathematical model 概要 情報を伝え、受け取るためにニューロンは特有の樹状…
Joseph Zinski;..;Mary C Mullins(2017.8, eLIFE)[Systems biology derived source-sink mechanism of BMP gradient formation] 理由 Biological Pattern formation の数理モデル 概要 骨形成タンパク質(BMP)シグナリングのモルフォゲン勾配は脊椎動物と無脊…
Scott Christley;....;Qing Nie(2010.8, BMC Systems Biology)[Integrative multicellular biological modeling: a case study of 3D epidermal development using GPU algorithms] 理由 Biological の"Pattern formation"の"Mathematical model" 概要 背景 …
William R. Holmes;Leah Edelstein-Keshet(2012.12, PLoS C. B.)[A Comparison of Computational Models for Eukaryotic Cell Shape and Motility] 理由 BiologyのPattern FormationのMathematical model 概要 真核細胞の移動性はシグナル分子、細胞骨格、細…
Natasha Saint Savage;...;Nicholas A. M Monk(2008.9, PLoS Biol)[A Mutual Support Mechanism through Intercellular Movement of CAPRICE and GLABRA3 Can Pattern the Arabidopsis Root Epidermis] 理由 Biological のPattern FormationのMathematical m…
R. Tyson;...; J. D. Murray(1999.2, Proc Biol Sci.)[A minimal mechanism for bacterial pattern formation] 理由 Biological のPattern formation のMathematical model 概要 大腸菌やサルモネラ・ティフィムリウムのコロニーは、トリカルボン酸(TCA)サイ…
E. Bonabeau;...;S. Blanco(1998.10, Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci.)[A model for the emergence of pillars, walls and royal chambers in termite nests] 理由 "mathematical model" "pattern formation" 概要 Deneubourgによるシロアリの巣におけ…
View ORCID Nobuto Takeuchi, Kunihiko Kaneko(2019.7, bioRxiv)[The origin of the central dogma through conflicting multilevel selection] 理由 うちのボスの元ボスが興味深いテーマの論文をだしていたので 概要 分子生物学のセントラルドグマにはゲノ…
Nicholas T Ingolia(2004.6, PLoS Biology)[Topology and Robustness in the Drosophila Segment Polarity Network] 理由 "Pattern formation" "Mathematical model"の論文 概要 遺伝的相互作用の複雑な階層制度によって、1つの細胞からなるショウジョウバエ…
Nicola J.Armstrong;...;Jonathan A.Sherrat(2006.11, Journal of Theoretical Biology)[A continuum approach to modelling cell–cell adhesion] 理由 "pattern formation" "mathematical model"で検索して被引用数が多い論文 概要 細胞は、細胞表面で細胞…
