2020-12-01から1ヶ月間の記事一覧
Nicola Gritti;...; Vikas Trivedi(2020.11, Developmental Biology)[Rethinking embryology in vitro: A synergy between engineering, data science and theory] 理由 ラボセミナーで紹介されてた 概要 近年、人工多能性幹細胞は、生体内の後生動物の胚発…
András Szilágyi;...;Eörs Szathmáry(2020.11, PLoS Comp. Bio.)[Phenotypes to remember: Evolutionary developmental memory capacity and robustness] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 進化的な学習から生じる発生的な記憶の可能性が発見されている。遺…
Yuriy Pichugin; Arne Traulsen(2020.11, PLoS Comp.)[Evolution of multicellular life cycles under costly fragmentation] 理由 ラボSlackに上がってたやつ 概要 生活環の魅力的な富は、単細胞性から多細胞単位の協調的な断片化まで生物で観察される。し…
Satoru Okuda;...;Mototsugu Eiraku(2018.2, Scientific Reports )[Combining Turing and 3D vertex models reproduces autonomous multicellular morphogenesis with undulation, tubulation, and branching] 理由 セミナーでちょっと出てきた 概要 本研究…
Anaïs Bailles;...; Thomas Lecuit(2019.8, nature)[Genetic induction and mechanochemical propagation of a morphogenetic wave] 理由 波の特性を調べてて見つけた 概要 組織の形態形成は、アクトミオシン収縮によって駆動される細胞の形の協調的な変化か…
Bennett Davenport;...;Anne-Laure Perraud(2015.7, Front. Immunol.,)[Signature channels of excitability no more: L-type channels in immune cells] 理由 免疫と興奮系の関係を調べていて見つけた 概要 Ca2+が普遍的なメッセンジャーであるという普遍的…
Krista M. Rodgers;...;Daniel S. Barth(2009.6, Brain.)[The cortical innate immune response increases local neuronal excitability leading to seizures] 理由 免疫と興奮系の関係を調べていて見つけた 概要 脳のグリア細胞は、ニューロンの5倍の数存在…
Steinar Thorvaldsen; OlaHössjer(2020.9, Journal of Theoretical Biology)[Using statistical methods to model the fine-tuning of molecular machines and systems] 理由 JTBで最も引用されてるとかなんとか 概要 Fine-tuningは物理学で高い関心を受けて…
Song, J.,... Webb, G.I.(2018.4, Journal of Theoretical Biology)[PREvaIL, an integrative approach for inferring catalytic residues using sequence, structural, and network features in a machine-learning framework] 理由 JTBの最も引用されてる…
ArnaudMartin;...;Nipam H.Patel(2016.1, Current Biology)[CRISPR/Cas9 Mutagenesis Reveals Versatile Roles of Hox Genes in Crustacean Limb Specification and Evolution] 理由 Twitterで流れてきた 概要 甲殻類は特殊化された脚の多様な配列を所有する…
Yuta Shiino;...;Nobuhiro Yoshikawa(2009.4, Journal of Theoretical Biology)[Computational fluid dynamics simulations on a Devonian spiriferid Paraspirifer bownockeri (Brachiopoda): Generating mechanism of passive feeding flows] 理由 ラボセ…
Hiroki Okauchi;...;Norikazu Ichihashi(2020.9, ACS Synth. Biol.)[Minimization of Elements for Isothermal DNA Replication by an Evolutionary Approach] 理由 ラボセミナーで紹介されてたので 概要 DNA複製は、細胞の中心的な役割のひとつである。現在…
Manabu Bessho-Uehara;...;Steven H.D. Haddock(2020.12, iScience)[Evidence for de novo Biosynthesis of the Luminous Substrate Coelenterazine in Ctenophores] 理由 Twitterで見かけた気がする 概要 セレンテラジンは、海の生物発光に関係する重要な基…
Yongli Cai;...;Weiming Wang(2021.1, Journal of Theoretical Biology)[Modelling the effects of the contaminated environments on tuberculosis in Jiangsu, China] 理由 JTBを読もうね 概要 結核(TB)は中国江蘇州においてまだ重要な健康問題である。本…
Eric M Kramer(2003.5, Phys.Rev.E)[Defect coarsening in a biological system: The vascular cambium of cottonwood trees] 理由 木目っていいよね 概要 綿の木(Populus deltoides)の維管束形成相における位相欠陥のペアの消滅と欠損調節的な粗大化のミク…
ERIC M.KRAMER(2002.5, Journal of Theoretical Biology)[A Mathematical Model of Pattern Formation in the Vascular Cambium of Trees] 理由 木目について調べてたときに見つけたやつ 概要 木目に現れる美しいパターンは、木の維管束形成相における紡錘形…
Kenia L.Juayerk-Herrera;...;Godínez-Fernández(2021.1, Journal of Theoretical Biology)[Deterministic modeling of single-channel and whole-cell currents] 理由 JTBの新しいやつ 概要 実験研究を補完するものとして、数理モデルはイオンチャネルの機…
LauraLema-Perez;...;Hernan Alvarez(2021.1, Journal of Theoretical Biology)[A phenomenological-based semi-physical model of the kidneys and its role in glucose metabolism] 理由 JTBの新しい論文を読もうね 概要 腎臓は3つの方法でグルコース代謝…
Torey R Arnold;...;Ann L Miller(2019.1, eLife)[Anillin regulates epithelial cell mechanics by structuring the medial-apical actomyosin network] 理由 調べものをしていて見つけておもしろそうだったので 概要 細胞の力は発生中の器官を形作る一方で…
Christopher B. Kaelin;...;Gregory S. Barsh(2020.11, bioRxiv)[Developmental Genetics of Color Pattern Establishment in Cats] 理由 Twitterで流れてきた 概要 複雑な色パターンは、ネコ科における形態的多様性の定義された側面である。形態学的と1細胞…
Heather S. Bruce;...;Nipam H. Patel(nature ecology &evolution)[Knockout of crustacean leg patterning genes suggests that insect wings and body walls evolved from ancient leg segments] 理由 Twitterで流れてきた気がする 概要 昆虫の翅の起源は…
Y. Oba;...;T. Shirai(2020.12, Science Advances)[Resurrecting the ancient glow of the fireflies] 理由 Twitterで流れてきた 概要 ホタルの生物発光の色は、ルシフェラーゼの構造によって決定される。ホタルのルシフェラーゼ遺伝子は30種以上で単離され…
Seita Miyazawa(2020.12, Science Advances )[Pattern blending enriches the diversity of animal colorations] 理由 Twitterで流れてきたので 概要 動物は、鮮やかな多様な皮膚のパターンを示すが、この多様性の根底にあるメカニズムは、特に複雑かつ迷彩…
Cody E.Fitz; Geralda James P.Keener(2021.1, Journal of Theoretical Biology)[The PafBC-mediated response sensitizes a bistable DNA damage response in Mycobacteria] 理由 JTBの新しい論文 概要 抗酸菌が住んでいる環境の遺伝毒性に厳しい環境のため…
Takuya Okabe;...;Jin Yoshimura(2021.1, Journal of Theoretical Biology)[Two-step mechanism of spiral phyllotaxis] 理由 JTBのアラートでおもしろそうだったので 概要 5,8,13といったフィボナッチ数は、植物における頂端の側方器官の螺旋配置に生じる。…
Shuhei S. Sugai;...;Hiroki R. Ueda(2017.4, Cell reports)[A Design Principle for an Autonomous Post-translational Pattern Formation] 理由 ラボセミナーで紹介されてたやつ 概要 他の多細胞生物と一緒に、植物は適切な組織成長と形態形成を達成するた…
Sarah Kadelka;...;Stanca M. Ciupe(2018.11, Bulletin of Mathematical Biology)[Modeling the Bistable Dynamics of the Innate Immune System] 理由 参考文献を探して 概要 リポポリサッカライドの初期負荷の大きさは、二度目のポリサッカライド負荷を受…
Abulikemu Abudukelimu;...;Hans V. Westerhoff(2020.2, Front. Immunol.)[Complex Stability and an Irrevertible Transition Reverted by Peptide and Fibroblasts in a Dynamic Model of Innate Immunity] 理由 参考文献を探して 概要 ここでは、調節分析…
Gheorghe Craciun;...;Martin Feinberg(2006.6, PNAS)[Understanding bistability in complex enzyme-driven reaction networks] 理由 参考文献を探して 概要 重要な生化学反応ネットワークに存在するかもしれない双安定的かつスイッチ状のふるまいが最近注…
Voit EO(2008.9, Mathematical Biosciences)[A systems-theoretical framework for health and disease: inflammation and preconditioning from an abstract modeling point of view.] 理由 参考文献シリーズ 概要 分子生物学における現代の進歩により、細…
