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生物学(主に理論生物学)の論文を書くために読みます

2021-04-01から1ヶ月間の記事一覧

IL-10は乾癬における重要なサイトカインである。新しい治療方法であるIL-10治療による原理の証明

K Asadullah;...;W D Döcke(1998.2, J Clin Invest.)[IL-10 is a key cytokine in psoriasis. Proof of principle by IL-10 therapy: a new therapeutic approach.] 理由 自分の研究関連 概要 炎症性のタイプ1サイトカインの過剰発現は乾癬で見られ、病態生…

膜の曲面と組み合わせた反応拡散波

Naoki Tamemoto, Hiroshi Noguchi(2021.4, bioRxiv)[Reaction-Diffusion Waves Coupled with Membrane Curvature] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 タンパク質の反応拡散波は、細胞移動や細胞分裂そして小胞輸送のような基本的な細胞機能に関与することが知…

遊走性環状紅斑の新概念:特定の臨床病理実体を反映しない臨床反応パターン

M. Ziemer;...;B. Zelger(2008.12, British Journal of Dermatology)[New concepts on erythema annulare centrifugum: a clinical reaction pattern that does not represent a specific clinicopathological entity] 理由 自分の研究関連 概要 背景遠心性…

血管内皮細胞成長因子で誘導される発癌は、マクロファージの再帰と別の活性化に依存する

Nina Linde;...; Margareta M Mueller(2012.1, Journal of Pathology)[Vascular endothelial growth factor-induced skin carcinogenesis depends on recruitment and alternative activation of macrophage] 理由 自分の研究関連 概要 炎症は、腫瘍の成長や…

イメージング無しの分子トモグラフィーによる空間組織プロファイル

Halima Hannah Schede;...;Gioele La Manno(2021.4, Nature Biotechnology)[Spatial tissue profiling by imaging-free molecular tomography] 理由 Twitterで流れてきた 概要 空間解像度のオミックスプロファイルのために、いくつかの技術が最近開発されて…

自己免疫/炎症性疾患におけるエピジェネティクスの役割

Anna Elisa Andrea Surace and Christian M. Hedrich(2019.7, Front Immunol.)[The Role of Epigenetics in Autoimmune/Inflammatory Disease] 理由 自分の研究関連 概要 歴史的に、全身性の自己炎症状況は自己炎症性かつ自然免疫系によって生じるか、自己免…

大量処理数理解析によって、等しく拡散するシグナルを持つパターニングのチューリングネットワークが見つかった。

Luciano Marcon;..; Patrick Müller()2016.4, eLife)[High-throughput mathematical analysis identifies Turing networks for patterning with equally diffusing signals] 理由 自分の研究関連 概要 チューリング反応拡散モデルから、同一の細胞がどのよう…

鳥の羽の形の進化と隠れた羽における未知の傾向

Xia Wang and Julia A. Clarke(2015.10, Proccedings of the royal society B)[The evolution of avian wing shape and previously unrecognized trends in covert feathering] 理由 論文紹介で読むやつの参考文献になってたやつ 概要 鳥の羽の形は飛行能力…

短距離と長距離のシグナリングの協調が発生パターニングを調節する

Carly Williamson;..;Adriana T.Dawes(2021.5, Journal of Theoretical Biology)[Coordination of local and long range signaling modulates developmental patterning] 理由 JTBの最新論文で気になったやつ 概要 多細胞生物の発生は、成熟した個体で機能的…

拍動的な収縮によって、上皮組織におけるアポトーシス的な細胞の押し出しが促進される

Youmna Atieh;...;George T. Eisenhoffer(2021.3, Current Biology)[Pulsatile contractions promote apoptotic cell extrusion in epithelial tissues] 理由 ラボSlackに流れててきた 概要 押し出しは、不適当な細胞や過剰な細胞、もしくは死細胞を上皮組織…

反応拡散系としての地図状舌

Margaret K. McGuire;...;Niklas Manz(2020.10, Chaos )[Geographic tongue as a reaction–diffusion system] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 地図状舌や良性移動性舌炎 は、舌の表面にわたってゆっくり移動する慢性病変が特徴的な、病因が未知の状態…

合成バクテリア集団における確率的なチューリングパターン

David Karig;...;Ron Weiss(2018.8, PNAS)[Stochastic Turing patterns in a synthetic bacterial population] 理由 自分の研究関連 概要 生物形態と形状の起源は、科学における最も深い問題の一つであり、生物系の発生と機能の理解の根底にある。1952年に、…

代謝解析から、2つの紫葉の茶の木栽培品種(Camellia sinensis L.)における色の変化の異なるメカニズムが解明された。

Jiazhi Shen;...;Xujun Zhu(2018.2, nature Horticulture Research)[Metabolic analyses reveal different mechanisms of leaf color change in two purple-leaf tea plant (Camellia sinensis L.) cultivars] 理由 バナナから発展して、植物の色の変化につ…

反応拡散アクティブマターにおけるプログラム化された物理-化学共役

Anis Senoussi;...; André Estevez-Torres(2021.3, bioRxiv)[Programmed mechano-chemical coupling in reaction-diffusion active matter] 理由 ラボSlackあたりに来たやつかな 概要 胚の形態形成には、パタン形成メカニズムの複雑な組み合わせが関与する。…

バナナの皮の摩擦係数

Kiyoshi Mabuchi;,,,;Rina Sakai(2012.9, Tribology Online)[Frictional Coefficient under Banana skin] 理由 バナナについて調べてるって言ったら、助教が教えてくれた 概要 床材の上のバナナの皮の摩擦係数を計測した。リノリウムの平面の床に自由度6の力…

数理モデルから植物のシグナリングが解明される

Yin Hoon Chew;...;, Karen J. Halliday(2014.1, The Plant Cell)[Mathematical Models Light Up Plant Signaling] 理由 こないだ研究室に落ちてたバナナから植物の色が気になってきた 概要 植物は、異なる組織、器官そして植物全体における分子シグナリング…

熟成バナナの廃棄臨界点決定のための、色と食感の動力学と官能特性の特徴化の数理モデル

Stella Nannyonga;..;Konstantinos Kostas Gkatzionis(2016.6, Journal of Food Engineering)[Mathematical modelling of color, texture kinetics and sensory attributes characterisation of ripening bananas for waste critical point determination] …

ドイツにおける乾癬性関節炎の疫学と臨床パターン:斑状乾癬の患者1511人の学際的疫学研究の見通し

K. Reich;...;M. Augustin(2009, British Journal of Dermatology)[Epidemiology and clinical pattern of psoriatic arthritisin Germany: a prospective interdisciplinary epidemiologicalstudy of 1511 patients with plaque-type psoriasis] 理由 自分…

免疫系と悪性腫瘍の競合の数理モデル

Marzio Pennisi(2012.6, Computational and Mathematical Methods in Medicine)[A Mathematical Model of Immune-System-Melanoma Competition] 理由 自分の研究関連 概要 活性化OT1細胞傷害性Tリンパ球(CTLs)と抗CD137モノクローナル抗体を組み合わせた複合…

免疫細胞流入とマクロファージ二極化の数理モデルの炎症過程における重要なパラメーターの同定

Marcella Torres;....;Angela M. Reynolds(2019.7, PLoS Comput Biol.)[Identifying important parameters in the inflammatory process with a mathematical model of immune cell influx and macrophage polarization] 理由 自分の研究関連 概要 炎症の状…

炎症性皮膚疾患の自動診断の方法に基づく画像の深層学習

Haijing Wu;...;Qianjin Lu(2020.5, Annals of Translational Medicine)[A deep learning, image based approach for automated diagnosis for inflammatory skin diseases] 理由 自分の研究関連 概要 背景 深層学習時代の到来に伴い、特に畳み込みニューラ…

縮日振動とパルス:細胞応答と細胞運命決定の協調

Akihiro Isomura, Ryoichiro Kageyama(2014 Development)[Ultradian oscillations and pulses: coordinating cellular responses and cell fate decisions] 理由 自分の研究関連 概要 生物学時計は、個体発生、恒常性そして機能に重要な役割を果たす。近年、…

ウイルス特異的な記憶性CD8 T細胞の恒常的ターンオーバーは確率的に起こり、CD4 T細胞の援助に依存する

Daniel K. Choo;...;Rafi Ahmed(2010.9, J Immunol.)[Homeostatic Turnover of Virus-Specific Memory CD8 T Cells Occurs Stochastically and Is Independent of CD4 T Cell Help] 理由 自分の研究関連 概要 記憶性CD8 T細胞は、Ag非依存的な恒常性維持増殖…

神経炎症と神経因性疼痛の誘発

A. Ellis;...; D. L. H. Bennett(2013.7, British Journal of Anaesthesia)[Neuroinflammation and the generation of neuropathic pain] 理由 自分の研究関連 概要 炎症は、免疫細胞の補充とメディエーター放出の両方に関与する組織障害に応答する器官によ…

T細胞の活性化は、炎症に関連する癌における腫瘍形成

Dan Rauch;...; Lee Ratner(2009.12, BMC Retrovirology)[T-cell activation promotes tumorigenesis in inflammation-associated cancer] 理由 自分の研究関連 概要 慢性炎症は、幅広い悪性腫瘍に長く関連しており、今は癌の発生のリスク因子として広く受け…

Tリンパ球は炎症、新生血管形成そして細胞外マトリックス再構成を制御することで皮膚の瘢痕を弱める

Xinyi Wang;...;Sundeep G. Keswani(2019.10, Advances in Wound Care)[T Lymphocytes Attenuate Dermal Scarring by Regulating Inflammation, Neovascularization, and Extracellular Matrix Remodeling] 理由 自分の研究関連 概要 目的 組織損傷と治癒に…

ヒト記憶性T細胞:誘発とすみわけ、恒常性

Donna L. Farber;...; Nicholas P. Restifo(2013.3, Nat Rev Immunol.)[Human memory T cells: generation, compartmentalization and homeostasis] 理由 自分の研究関連 概要 記憶性T細胞は、各自の生涯の大半で体内に最も豊富にあるリンパ球集団で構成され…

中間層熱傷モデルにおける細胞集団と損傷治癒関連遺伝子発現の時間変化

Hui-fang Guo;...;Huzwah Khaza’ai(2020.3, Biomedical Dermatology)[Temporal changes in the cell population and wound healing-related gene expression in deep partial-thickness burnwound model] 理由 自分の研究関連 概要 背景 火傷は、熱や電気、…

皮膚外傷に対する免疫応答は、炎症と切除のマウスモデルにおける損傷の病因に依存する

Samantha M.Valvis;...;Vanessa S.Fear(2015.8, Journal of Investigative Dermatology)[The Immune Response to Skin Trauma Is Dependent on the Etiology of Injury in a Mouse Model of Burn and Excision] 理由 自分の研究関連 概要 皮膚外傷には、切り…

ナイーブT細胞恒常性の決定論モデル・確率モデル

Grant Lythe;...;Carmen Molina‐París(2018.8, Immunological Reviews)[Some deterministic and stochastic mathematical models of naïve T‐cell homeostasis] 理由 自分の研究関連 概要 ヒトは数十年生きる一方で、マウスは数ヶ月しか生きない。これらの長…