Rafaela-MariaKavasi;...;DraganaNikitovic(2017.3, Food and Chemical Toxicology)[HA metabolism in skin homeostasis and inflammatory disease] 理由 皮膚と炎症のことでも調べて見つかったんじゃない？覚えてないけど 概要 ヒアルロン(HA)は、硫酸化さ…

Jeremy D.Scheff;...;Ioannis P.Androulakis(2010.6, Journal of Theoretical Biology)[Modeling the influence of circadian rhythms on the acute inflammatory response] 理由 なんか溜まってたやつ 概要 炎症の理解に向けて多種多様なモデリング技術が適…

Judit Horváth;...;Patrick De Kepper(2009.5, Science)[An Experimental Design Method Leading to Chemical Turing Patterns] 理由 これもストックしてたやつ 概要 化学的な反応拡散パターンはしばしば生物系におけるパターン形成の原型を与える。しかし、…

Baoqing Ding;...;Yao-Wu Yuan(2020.3, Current biology)[Two MYB Proteins in a Self-Organizing Activator-Inhibitor System Produce Spotted Pigmentation Patterns] 理由 どこかで見つけた論文 概要 多くの生物は、視覚的に魅力的な点や縞の色素パターン…

Clifford P. Brangwynne;..;Anthony A. Hyman(2009.1, Science)[Germline P Granules Are Liquid Droplets That Localize by Controlled Dissolution/Condensation] 理由 ストックしててたやつ。最早いつ見つけたか忘れた 概要 性生殖の生物において、胚は生…

Wei Zhao,;...;Lawrence B. Schwartz(2005.8, J Immunol)[Cytokine Production by Skin-Derived Mast Cells: Endogenous Proteases Are Responsible for Degradation of Cytokines] 理由 リファレンス探し 概要 最近の研究によって、FcεRIの交差結合によって…

Erwin Kemna;..;Dorine Swinkels(2005.9, blood)[Time-course analysis of hepcidin, serum iron, and plasma cytokine levels in humans injected with LPS] 理由 サイトカインの分解について知りたかった 概要 肝性ペプチドホルモンへプシジンは鉄代謝の重…

John R. Finnerty(2005.11, Bioessays)[Did Internal Transport, Rather Than Directed Locomotion, Favor the Evolution of Bilateral Symmetry in Animals?] 理由 ラボで紹介されてたので 概要 左右相称動物の標準的な説明は、直接的な移動に対して放射相…

Takuya Ohmura;...;Masatoshi Ichikawa(2018.2, PNAS)[Simple mechanosense and response of cilia motion reveal the intrinsic habits of ciliates] 理由 TAしてる授業でゾウリムシと神経生物学の話になって調べてみたやつ 概要 繊毛の重要な性質、すなわ…

Toshinori Namba,Shuji Ishihara(2020.2, PLOS COMPUTATIOBAL BIOLOGY)[Cytoskeleton polarity is essential in determining orientational order in basal bodies of multi-ciliated cells] 理由 ラボで紹介されてた 概要 多数の繊毛細胞においては、基底小…

Jordan Hoffmann;...;Chris H. Rycroft(2018.6, PNAS)[A simple developmental model recapitulates complex insect wing venation patterns] 理由 ラボのSlackで紹介されてた 概要 昆虫の翅は、通常翅脈と呼ばれる薄い支柱に支えられている。これらの翅脈は…

ToshioSekimura;....;YasuhiroTakeuchi(2014.11, Journal of theoretical biiology)[A model for population dynamics of the mimetic butterfly Papilio polytes in the Sakishima Islands, Japan] 理由 セミナーで紹介されてた論文 概要 日本の先島諸島に…

Evgeny P. Zemskov;...;Werner Horsthemke(2018.6, PHYSICAL REVIEW E )[Oscillatory pulse-front waves in a reaction-diffusion system with cross diffusion] 理由 反応拡散系の勉強 概要 線形なクロス拡散のあるフィッツフュー南雲型の、双安定の区分型…

N. El Khatib;...;V. Volpert(2007, Math. Model. Nat. Phenom)[Atherosclerosis Initiation Modeled as an Inflammatory Process] 理由 Volpertにのってたやつ 概要 本研究では、アテローム性動脈硬化の発生を引き起こす炎症過程を研究する。反応拡散系に基…

Wenjing Zhang;...;Linda J S Allen(2019.9, Math Med Biol.)[Models of cytokine dynamics in the inflammatory response of viral zoonotic infectious diseases] 理由 炎症促進と抑制の相互作用を知りたくて 概要 鳥インフルエンザやハンタウイルス、そし…

Christine A. Tataru ,Maude M. David(2020.5, PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY)[Decoding the language of microbiomes using word-embedding techniques, and applications in inflammatory bowel disease] 理由 ラボで紹介されてた論文 概要 微生物はヒトの疾…

A.R.A. Anderson;...;V. Quaranta(2007, Math. Model. Nat. Phenom)[Modelling of Cancer Growth, Evolution and Invasion: Bridging Scales and Models] 理由 Volpertにのってたやつ 概要 癌は異なる長さや時間スケールで生じる事象が混ざり合った複雑な現…

Sergei V. Petrovskii;...;Ezio Venturino(2005, Biological Invasions)[Patterns of patchy spread in deterministic and stochastic models of biological invasion and biological control] 理由 Volpertに出てきたやつだったかな 概要 集団動態の時空間…

D. J. Headon; K.J. Painter(2009. Math. Model. Nat. Phenom. )[Stippling the Skin: Generation of Anatomical Periodicity by Reaction-Diffusion Mechanisms] 理由 反応拡散の勉強 概要 脊椎動物の発生の間、細胞は胚の中の位置に強く依存して異なる運命…

Sergei Petrovskii;...;Bai-Lian Li(2005, Bulletin of Mathematical Biology)[Regimes of biological invasion in a predator-prey system with the Allee effect] 理由 Volpertの参考文献になってたやつ 概要 強いアリー効果によって被食者の成長が減衰す…

Hans G. Othmer,;...;Chuan Xue(2009.1, Math Model Nat Phenom)[The Intersection of Theory and Application in Elucidating Pattern Formation in Developmental Biology] 理由 反応拡散の勉強 概要 3つの異なる発生系に対する理論と実験の方法について議…

EIRIKUR PALSSON; EDWARD C. Cox(1996.2, Proc. Nati. Acad. Sci. USA)[Origin and evolution of circular waves and spirals in Dictyostelium discoideum territories] 理由 螺旋波の勉強 概要 ランダムに分布している粘菌細胞は、お互いのcAMPでシグナル…

Matthias Vigelius ,Bernd Meyer(2012.8, PLOS ONE)[Stochastic Simulations of Pattern Formation in Excitable Media] 理由 反応拡散のお勉強 概要 興奮系の反応拡散系におけるパターン形成の中視的な動的モンテカルロシミュレーションの方法を示す。2つの…

Cangiani A;...;Sutton OJ(2018.5, Proceedings. Mathematical, Physical, and Engineering Sciences, )[Revealing new dynamical patterns in a reaction-diffusion model with cyclic competition via a novel computational framework.] 理由 反応拡散系…

Louis D. Weise; Alexander V. Panfilov(2011.11, PLOS ONE)[New Mechanism of Spiral Wave Initiation in a Reaction-Diffusion-Mechanics System] 理由 反応拡散系の螺旋波の勉強 概要 心筋における螺旋波の開始は、危険な心不全の開始メカニズムである。…

Hans Dierckx;...;Alexander V Panfilov(2015.4, new journal of physics)[A theory for spiral wave drift in reaction-diffusion-mechanics systems] 理由 反応拡散波の勉強 概要 反応拡散メカニズム(RDM)系は、変形が波や渦のダイナミクスに実質的に影響…

V. Volpert; S. Petrovskii(2009, Physics of Life Reviews)[Reaction-diffusion waves in biology] 理由 反応拡散の勉強 概要 反応拡散波の理論は1930年代にはじまり、人口動態、燃焼理論そして化学反応の分野で研究されている。現在、これは非常に発展した…

Kaier Wang;....;Yoichi Shiraishi(2014.4, BMC Systems Biology)[Simulations of pattern dynamics for reaction-diffusion systems via SIMULINK] 理由 反応拡散系の勉強 概要 背景 反応拡散系の非線形パターン動態の研究は、ほとんどいつも定義する微分方…

Chang C;...;Chuong CM(2009.1, The International Journal of Developmental Biology,)[Reptile scale paradigm: Evo-Devo, pattern formation and regeneration.] 理由 どこで見つけたかのか、もう忘れてしまったけどストックしてたやつ 概要 この展望の目…

Miriam Grace; Marc-Thorsten Hütt(2015.11, PLOS ONE)[Regulation of Spatiotemporal Patterns by Biological Variability: General Principles and Applications to Dictyostelium discoideum] 理由 二成分反応拡散系の勉強 概要 時空間パターンはしばしば…