時間パルスと空間縞を生成する遺伝子制御におけるネットワークモチーフの相互作用

Shuji Ishihara;...; Tatsuo Shibata(2005.9, Genes Cells.)[Cross talking of network motifs in gene regulation that generates temporal pulses and spatial stripes]

理由

演習で使う論文。冬休みで時間に余裕が出てきたので

概要

遺伝子制御ネットワークは、ネットワークモチーフと呼ばれるいくつかの基本構造を含んでいる。ネットワークモチーフは、しばしばネットワーク全体に存在する。大腸菌や線虫、ショウジョウバエで見られるこのようなモチーフの一つは、フィードフォワードループである。フィードフォワードループは、作用遺伝子が直接的な制御相互作用と、他の遺伝子産物によって調整される間接的な相互作用によって標的遺伝子を制御する。ここでは、互いに相互作用するフィードフォワードループの挙動を理論的に解析した。作用遺伝子のレベルに応じて、このようなネットワークは、複数の上がって下がる時間発現特徴と、空間の縞を生成することができた。これらは発生過程で典型的に観察される。これらの応答を生み出すメカニズムは、実験結果由来の制御経路を推論する方法を解明した。遺伝子制御ネットワークのデータベース研究から、ほとんどのフィードフォワードループが実際に相互作用することが示唆された。このフィードフォワードループとその相互作用がどのように形態形成に重要な役割を果たしているかを議論する。

雑記

久々に心穏やかに論文を読むことができた気がする。