生化学ネットワークのモデルにおける可塑性の測定としてのロバストネス
MINEO MOROHASHI;...; HIROAKIKITANO(2002.5, Journal of theoretical biology)[Robustness as a Measure of Plausibility in Models of Biochemical Networks]
理由
実験医学数理モデル特集の第2章2. 「細胞内パラメーターを測定するという研究志向」の参考文献
概要
理論と実験、そして観察により、種間で保存されている生化学ネットワークは接続やキネティックパラメーターにおける変動に頑健であることが示唆されている。ここでは、この予測を調べ、構築と選択をモデル化する方法を提案する。パラメーター空間から行動空間へのマッピングとしてモデルを示し、パラメーター変異に対する定常状態のふるまいの各領域の頑健性を調べるために分岐解析を用いる。モデルにおける潜在的な誤差がパラメーター感受性の結果であるという仮説を、カエルの細胞周期の根底にある生化学振動子の2つのモデルの解析によって調べた。我々の解析によって、古いモデルにおける既知の弱点が同定され、より可塑的な最近のモデルにおける広い調査領域が示唆された。さらに、なぜ新しいモデルがより可塑的であるのかにも焦点を当てる。
雑記
でっかいディスプレイ欲しい、というかシンプルにデスクトップ一台欲しい。