興奮系媒体におけるパターン形成の確率シミュレーション

Matthias Vigelius ,Bernd Meyer(2012.8, PLOS ONE)[Stochastic Simulations of Pattern Formation in Excitable Media]

理由

反応拡散のお勉強

概要

興奮系の反応拡散系におけるパターン形成の中視的な動的モンテカルロシミュレーションの方法を示す。2つのレベルの並列化方法を用いて、このシミュレーションはノイズ優先的な少数の粒子数領域から、準決定論的な大粒子数の限界まで、パラメーター領域の全範囲を網羅する。幅広い興奮系の模範的な3つの質的に異なるケーススタディを行った。グレスコットモデル、細胞内Ca2+振動のモデル、そして初めてオレゴネーターモデルの中視的な確率シミュレーションを示す。最大10の10乗の粒子についてシミュレーションを行うことができる。ソフトウェアとモデルのファイルは公開されており、研究者は結果を再生し、さらなる研究のための応用・精査することができる。

雑記

大学PC使えるようになったらこのソフトいじってみようかな