Reaction-Diffusion
Jake Cornwall Scoones;...;Shiladitya Banerjee(2020.7, Cells)[Size-Regulated Symmetry Breaking in Reaction-Diffusion Models of Developmental Transitions] 理由 反応拡散の再勉強 概要 多細胞生物の発生は、一連の形態形成や細胞状態の遷移を通じて…
Tom W. Hiscock and Sean G. Megason(2015.2, Development)[Mathematically guided approaches to distinguish models of periodic patterning] 理由 反応拡散の復習 概要 周期的なパターンがどのように生成されるか、は未解決の問題である。チューリングの…
Jennifer P Owen;...;Christian A Yates (2020.7, elife)[A quantitative modelling approach to zebrafish pigment pattern formation] 理由 自分の研究関連 概要 パターン形成は発生の重要な面である。成体のゼブラフィッシュは3つの異なる色素胞の自己組…
Nen Saito & Satoshi Sawai(2021.10, iScience)[Three-dimensional morphodynamic simulations of macropinocytic cups] 理由 昨日の論文について調べてたら見つけた 概要 マクロピノサイトーシスとは細胞外の液体の非特異的な取り込みを差し、細胞成長や免…
Gen Honda;...;Satoshi Sawai(2021.12, PNAS)[Microtopographical guidance of macropinocytic signaling patches] 理由 Twitterで見つけたような気がする 概要 意義 粘菌や免疫細胞の形態は変形可能かつダイナミックである。この形態は細胞外溶質や粒子の取…
Yanyan Chen,Javier Buceta(2019.8, PLOS ONE)[A non-linear analysis of Turing pattern formation] 理由 パタン形成の復習 概要 反応拡散案は多様な分野で現象をモデル化し解釈するのに広く用いられている。この文脈で、チューリング不安定性で駆動される…
Tiankai Zhao,;...;Hongyan Yuan(2021.5, bioRxiv)[A contraction-reaction-diffusion model for circular pattern formation in embryogenesis] 理由 ラボSlackだっけ？ 概要 反応拡散モデルは、発生生物学におけるパタン形成を理解するのに広く用いられて…
Allen R. Sanderson;...;Lingfa Yang(2006, Journal of Graphics Tools )[Advanced Reaction-Diffusion Models for Texture Synthesis] 理由 反応拡散の復習 概要 1990年代初頭に反応拡散モデルを用いたテクスチャ号合成が導入されてから、それはまだ広く活…
Amitava Giri and Sandip Kar(2019.3, The Journal of Chemical Physics)[Unraveling the diverse nature of electric field induced spatial pattern formation in Gray-Scott model] 理由 ラボSlackに来た・・っけ？ 概要 イオン性反応物と自己触媒で構成…
Naoki Tamemoto, Hiroshi Noguchi(2021.4, bioRxiv)[Reaction-Diffusion Waves Coupled with Membrane Curvature] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 タンパク質の反応拡散波は、細胞移動や細胞分裂そして小胞輸送のような基本的な細胞機能に関与することが知…
Margaret K. McGuire;...;Niklas Manz(2020.10, Chaos )[Geographic tongue as a reaction–diffusion system] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 地図状舌や良性移動性舌炎 は、舌の表面にわたってゆっくり移動する慢性病変が特徴的な、病因が未知の状態…
Shigeru Kondo; Hideaki Shirota(2008.10, Seminars in Cell & Developmental Biology)[Theoretical analysis of mechanisms that generate the pigmentation pattern of animals] 理由 パターン形成は楽しいね 概要 動物の皮膚色素パターン形成のメカニズム…
Satoru Okuda;...;Mototsugu Eiraku(2018.2, Scientific Reports )[Combining Turing and 3D vertex models reproduces autonomous multicellular morphogenesis with undulation, tubulation, and branching] 理由 セミナーでちょっと出てきた 概要 本研究…
Christopher B. Kaelin;...;Gregory S. Barsh(2020.11, bioRxiv)[Developmental Genetics of Color Pattern Establishment in Cats] 理由 Twitterで流れてきた 概要 複雑な色パターンは、ネコ科における形態的多様性の定義された側面である。形態学的と1細胞…
Seita Miyazawa(2020.12, Science Advances )[Pattern blending enriches the diversity of animal colorations] 理由 Twitterで流れてきたので 概要 動物は、鮮やかな多様な皮膚のパターンを示すが、この多様性の根底にあるメカニズムは、特に複雑かつ迷彩…
Ido Levin;...;Eran Sharon(2020.10, PHYSICAL REVIEW LETTERS)[Self-Oscillating Membranes: Chemomechanical Sheets Show Autonomous Periodic Shape Transformation] 理由 これも確かラボSlack 概要 生物は、形態変化と運動を誘導するために、シート内の…
Jacqueline E. Moustakas-Verho,;...;Scott F. Gilbert(2014 Development)[The origin and loss of periodic patterning in the turtle shell] 理由 ラボSlackに落ちてたやつ 概要 20億年前のカメの甲羅の起源は、羊膜類のボディプランを徐々に修正してきた…
Bas Jacobs;...;Eva E.Deinum(2020.10, Journal of Theoretical Biology)[Robust banded protoxylem pattern formation through microtubule-based directional ROP diffusion restriction] 理由 JTBの最近の記事 概要 植物の維管束組織発生において、異なる…
R. T. Liu, S. S. Liaw, and P. K. Maini(2006.7, PHYSICAL REVIEW E)[Two-stage Turing model for generating pigment patterns on the leopard and the jaguar] 理由 twitterで見かけた 概要 斑点はネコ科の初期パターンであり、ロゼットと病斑を含む他の…
Judit Horváth;...;Patrick De Kepper(2009.5, Science)[An Experimental Design Method Leading to Chemical Turing Patterns] 理由 これもストックしてたやつ 概要 化学的な反応拡散パターンはしばしば生物系におけるパターン形成の原型を与える。しかし、…
Evgeny P. Zemskov;...;Werner Horsthemke(2018.6, PHYSICAL REVIEW E )[Oscillatory pulse-front waves in a reaction-diffusion system with cross diffusion] 理由 反応拡散系の勉強 概要 線形なクロス拡散のあるフィッツフュー南雲型の、双安定の区分型…
D. J. Headon; K.J. Painter(2009. Math. Model. Nat. Phenom. )[Stippling the Skin: Generation of Anatomical Periodicity by Reaction-Diffusion Mechanisms] 理由 反応拡散の勉強 概要 脊椎動物の発生の間、細胞は胚の中の位置に強く依存して異なる運命…
Hans G. Othmer,;...;Chuan Xue(2009.1, Math Model Nat Phenom)[The Intersection of Theory and Application in Elucidating Pattern Formation in Developmental Biology] 理由 反応拡散の勉強 概要 3つの異なる発生系に対する理論と実験の方法について議…
Matthias Vigelius ,Bernd Meyer(2012.8, PLOS ONE)[Stochastic Simulations of Pattern Formation in Excitable Media] 理由 反応拡散のお勉強 概要 興奮系の反応拡散系におけるパターン形成の中視的な動的モンテカルロシミュレーションの方法を示す。2つの…
Cangiani A;...;Sutton OJ(2018.5, Proceedings. Mathematical, Physical, and Engineering Sciences, )[Revealing new dynamical patterns in a reaction-diffusion model with cyclic competition via a novel computational framework.] 理由 反応拡散系…
Louis D. Weise; Alexander V. Panfilov(2011.11, PLOS ONE)[New Mechanism of Spiral Wave Initiation in a Reaction-Diffusion-Mechanics System] 理由 反応拡散系の螺旋波の勉強 概要 心筋における螺旋波の開始は、危険な心不全の開始メカニズムである。…
Hans Dierckx;...;Alexander V Panfilov(2015.4, new journal of physics)[A theory for spiral wave drift in reaction-diffusion-mechanics systems] 理由 反応拡散波の勉強 概要 反応拡散メカニズム(RDM)系は、変形が波や渦のダイナミクスに実質的に影響…
V. Volpert; S. Petrovskii(2009, Physics of Life Reviews)[Reaction-diffusion waves in biology] 理由 反応拡散の勉強 概要 反応拡散波の理論は1930年代にはじまり、人口動態、燃焼理論そして化学反応の分野で研究されている。現在、これは非常に発展した…
Kaier Wang;....;Yoichi Shiraishi(2014.4, BMC Systems Biology)[Simulations of pattern dynamics for reaction-diffusion systems via SIMULINK] 理由 反応拡散系の勉強 概要 背景 反応拡散系の非線形パターン動態の研究は、ほとんどいつも定義する微分方…
Miriam Grace; Marc-Thorsten Hütt(2015.11, PLOS ONE)[Regulation of Spatiotemporal Patterns by Biological Variability: General Principles and Applications to Dictyostelium discoideum] 理由 二成分反応拡散系の勉強 概要 時空間パターンはしばしば…
