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生物学(主に理論生物学)の論文を書くために読みます

Reaction-Diffusion

生物学的パタン形成のメカニズムの研究のために最新のカーネルベースのチューリングモデル

Kondo, Shigeru;(2017)[An updated kernel-based Turing model for studying the mechanisms of biological pattern formation] 理由 近藤先生シリーズ14 概要 アランチューリングによって示された反応拡散モデルは、最近実験データによって支持され、多くの…

魚の縞パターンの方向性の起源

Shoji, H; ...Kondo, S(2003.4)[Origin of directionality in the fish stripe pattern] 理由 近藤先生シリーズ10 概要 動物皮膚の縞パターンの形成はアランチューリングによって提唱された仮説的な化学反応である反応拡散(RD)系によって説明されてきた。動…

反応拡散系:動物皮膚の自律的なパタン形成のメカニズム

Kondo, S(2002.6)[The reaction-diffusion system: a mechanism for autonomous pattern formation in the animal skin] 理由 近藤先生シリーズ3 概要 動物はどのように皮膚パターンを獲得するのだろうか?この質問は簡単に見えるかもしれないが、実際に答え…

レオパードゼブラフィッシュのスポットパターンはコネキシン41.8遺伝子の変異によって起こる

Watanabe, Masakatsu; ... ;Okada, Norihiro(2006.9)[Spot pattern of leopard Danio is caused by mutation in the zebrafish connexin41.8 gene] 理由 クラカケチョウチョウウオの縞々が気になったので、改めて近藤先生の論文を読もうと思ったシリーズ1 概…

炎症障害の一つであるアテローム性動脈硬化の数理モデル

N. EL KHATIB;...;V. VOLPERT(2009)[Mathematical modelling of atherosclerosisas an inflammatory disease] 理由 前回の論文"Reaction-Diffusion waves in biology"の中の印象的な図の元文献 概要 アテローム性動脈硬化は炎症性の疾患である。アテローム性…

炎症反応の一つであるアテローム性動脈硬化の数理モデル

Ibragimov, AI; ...Walton, JR(2005.12)[A mathematical model of atherogenesis as an inflammatory response] 理由 前回の論文"Reaction-Diffusion waves in biology"の中の印象的な図の元文献 概要 この論文では、慢性炎症反応であるアテローム性動脈硬化…

生物学における反応拡散

Volpert, V.; Petrovskii, S.(2009.12)[Reaction-diffusion waves in biology] 理由 "Traveling wave"のBiology分野の被引用数5位くらいの論文 概要 反応拡散波の理論は集団動態分野や、燃焼理論や化学的な反応速度論研究で1930年に始まった。現在では、スカ…

成長ドメインにおける反応拡散:頑健なパターン形成のシナリオ

Edmund J. Crampin(1999.11)[Reaction and diffusion on growing domains: Scenarios for robust pattern formation] 理由 "Reaction-Diffusion"の検索のなかでBiology関係のもの 概要 成長ドメインにおける、反応拡散系によって生じるパターン配列の調査。…

漸近自律微分方程式の収束結果とポアンカレ・ベンディクソン三分割

THIEME, HR(1992.8) [Convergence results and a Poincare-Bendixson trichotomy for asymptotically autonomous differential equstions] 理由 "Reaction-Diffusion"検索で分野がBiologyのもので被引用数が最大だった 概要 漸近的自律微分方程式の解が関連…

生物を参考にした素材 -動き、適応、そして自主的な分子システム-

Rémi Merindola and Andreas Walther(2017.9)[Materials learning from life: concepts for active, adaptive and autonomous molecular systems ] 理由 "Reaction-Diffusion"の直近での利用回数が高いものから題材が生物のものを探した。 概要 生物を基にし…

平衡・非平衡条件下で自己集合と形態変化をする混成ナノ化合物、ナノ構造

Mann S(2009.10)[Self-assembly and transformation of hybrid nano-objects and nanostructures under equilibrium and non-equilibrium conditions] 理由 Reaction-Diffusion の高被引用回数1位 概要 長い物質の構造化や組織化を化学的に起こるプロセスで…

交通などの自発運動する多粒子系

Dirk Helbing(2001.4)[Traffic and Related Self-Driven Many-Particle Systems] 理由 Reaction-Diffusionで検索したときの被引用数3位 概要 交通動態の課題は物理学者の関心が高く、以下のような疑問がこれまでに明らかにされている。 見かけの交通渋滞、の…

流体のための格子ボルツマン法

Chen,S ;Doolen,GD(1998.1)[Lattice Boltzmann method for fluid flows] 理由 Reaction-Diffusionで検索したときに被引用数1位だったので 概要 格子ボルツマン法 ・単相流や複相流のシミュレーションや他の複雑的な物理要素を組み込むの効果的なアルゴリズム…

平衡からぶっ飛んだパターン形成

CROSS, MC;HOHENBERG, PC(1993. 7)[PATTERN-FORMATION OUTSIDE OF EQUILIBRIUM ] 理由 Reaction-Diffusionで検索したときに被引用数1位だったので 概要 振動系の化学反応や興奮系の生物媒体など、平衡状態ではないときの時空間パターン形成の話。 複数の状態…