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生物学(主に理論生物学)の論文を書くために読みます

Others

断食は脂質状態の決定にとって、規定通りに必要ではない:ヨーロッパ動脈硬化学会と臨床科学・実験医学のヨーロッパ連合からの合同声明を含む臨床・実験含意

Nordestgaard BG;...;Mora S, et al. (2016.7, Eur Heart J. )[Fasting is not routinely required for determination of a lipid profile: clinical and laboratory implications including flagging at desirable concentration cut-points-a joint consen…

ノイズのある線形変換がバクテリアにおける細胞サイズと遺伝子発現の振動の根底にある

Yu Tanouchi;...;Lingchong You(2015.7, nature)[A noisy linear map underlies oscillations in cell size and gene expression in bacteria] 理由 昨日読んだ論文と関連して面白そうだったので 概要 細菌は成長の間、分裂前に細胞のサイズは約2倍になり、…

ニューラルネットワークを用いた点過程によるサイズ制御則の表現と推論

Atsushi Kamimura and Tetsuya J. Kobayashi(2021.7, PHYSICAL REVIEW RESEARCH)[Representation and inference of size control laws by neural-network-aided point processes] 理由 Twitterで見かけた 概要 細胞の成長と分裂の制御と調整は、細胞生理学に…

細菌、戦艦、そしてそれ以上の革新の景観

Terence C. Burnhama and Michael Travisano(2021.6, PNAS)[The landscape of innovation in bacteria, battleships, and beyond] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 細菌実験進化と海戦からの教訓を示し、金融市場での革新の理解を促進する。主な金融革新は…

光シグナルと触覚感知の高度な伸縮性の電界発光皮膚

C. Larson;...;R. Shepherd(2016.3, Science)[Highly stretchable electroluminescent skin for optical signaling and tactile sensing] 理由 こないだ読んだ論文の発展 概要 タコのような頭足類は、伸縮性の皮膚と色調節組織を組み合わせて、視覚意思伝達…

前翅の斑点が少ないビシクラス・アニナナのチョウの捕食傾向

Ian Z. W. Chan;...;Antónia Monteiro(2021.5, Proc. R. Soc. B.)[Predation favours Bicyclus anynana butterflies with fewer forewing eyespots] 理由 Twitterで流れてきた・・・? 概要 タテハチョウの後翅に比べて前翅の斑点は少ないが、この不均一な分…

ニューロン内での時空間的に制御された遺伝情報の編集

Isabel C Vallecillo-Viejo;...;Joshua J C Rosenthal(2020.3, Nucleic Acids Research)[Spatially regulated editing of genetic information within a neuron] 理由 Twitterで流れてきてびっくりしたやつ 概要 真核生物において、ミトコンドリアとプラスチ…

安定結婚問題:物理学者の観点からの学際的総説

Enrico MariaFenoaltea;...;Yi-ChengZhang(2021.6, Physics Reports)[The Stable Marriage Problem: An interdisciplinary review from the physicist’s perspective] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 ここでは、複雑系関連分野に携わる物理学者の間で…

物理的位置は髄腔内AAV9注入後の脳の伝達を著しく強化する

Michael J. Castle;...;Mark H. Tuszynski(2018.11, Science Advances)[Physical positioning markedly enhances brain transduction after intrathecal AAV9 infusion] 理由 Twitterで見かけた 概要 いくつかの神経疾患は、遺伝子治療の効果が期待されてい…

嗅覚記憶における機能ネットワークのモジュール構造

DavidMeunier;...;Jean-PierreRoyet(2014.7, NeuroImage)[Modular structure of functional networks in olfactory memory] 理由 最近気になる嗅覚と記憶の話 概要 グラフ理論は、ノードとエッジのセットとして系を記述することで系の研究を可能にする。グラ…

嗅覚受容における記憶の基本的な役割

Donald A.Wilson; Richard J.Stevenson(2003.5, TRENDS in Neuroscience)[The fundamental role of memory in olfactory perception] 理由 最近は嗅覚と記憶の関係に興味がある 概要 現在、嗅覚の基礎として匂いの物理化学的特徴が強調されているが、嗅覚の…

悪い科学の自然選択

Paul E. Smaldino and Richard McElreath(2016.9, Royal society open science)[The natural selection of bad science] 理由 ザビーネ・ホッセンフェルダー「数学に魅せられて、科学を見失う」で出てきた論文 概要 悪い研究デザインやデータ解析は誤検出の…

原始の多細胞性における適応と加齢に関する出芽と二分裂の結果

Hanna Isaksson;...;Eric Libby(2021.4, Genes)[The Consequences of Budding versus Binary Fission on Adaptation and Aging in Primitive Multicellularity] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 初期の多細胞生物は、他の多細胞系統と同様に単細胞祖先に打…

社会的に隔離されたゼブラフィッシュの全脳マッピングから、孤独な魚は孤独が好きなわけではないことが解明された

Hande Tunbak;...;Elena Dreosti(2020.5, eLife)[Whole-brain mapping of socially isolated zebrafish reveals that lonely fish are not loners] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 ゼブラフィッシュを用いて、行動と脳の機能における社会的孤独の影響を評…

パスタの変形とその先

Ye Tao;..;Lining Yao(2021.5, Science Advances)[Morphing pasta and beyond] 理由 Twitterで流れてきた 概要 モーフィング構造(変形する構造)は、構造的な異方性や組成の不均一性を利用して、平らなシートに応力を導入して設計されることが多い。ここでは…

イメージング無しの分子トモグラフィーによる空間組織プロファイル

Halima Hannah Schede;...;Gioele La Manno(2021.4, Nature Biotechnology)[Spatial tissue profiling by imaging-free molecular tomography] 理由 Twitterで流れてきた 概要 空間解像度のオミックスプロファイルのために、いくつかの技術が最近開発されて…

拍動的な収縮によって、上皮組織におけるアポトーシス的な細胞の押し出しが促進される

Youmna Atieh;...;George T. Eisenhoffer(2021.3, Current Biology)[Pulsatile contractions promote apoptotic cell extrusion in epithelial tissues] 理由 ラボSlackに流れててきた 概要 押し出しは、不適当な細胞や過剰な細胞、もしくは死細胞を上皮組織…

代謝解析から、2つの紫葉の茶の木栽培品種(Camellia sinensis L.)における色の変化の異なるメカニズムが解明された。

Jiazhi Shen;...;Xujun Zhu(2018.2, nature Horticulture Research)[Metabolic analyses reveal different mechanisms of leaf color change in two purple-leaf tea plant (Camellia sinensis L.) cultivars] 理由 バナナから発展して、植物の色の変化につ…

バナナの皮の摩擦係数

Kiyoshi Mabuchi;,,,;Rina Sakai(2012.9, Tribology Online)[Frictional Coefficient under Banana skin] 理由 バナナについて調べてるって言ったら、助教が教えてくれた 概要 床材の上のバナナの皮の摩擦係数を計測した。リノリウムの平面の床に自由度6の力…

ハマサンゴ礁の物理特性への環境の影響

Molly A. Moynihan;...; Ali Miserez(2021.3, Coral Reefs)[Environmental impact on the mechanical properties of Porites spp. corals] 理由 ラボSlack 概要 サンゴ礁の骨格構造の経済的かつ生態的重要性と将来の気候変動に対する予測される脆弱性にもか…

コヒーレント X 線回折によって解明された卵白ゲルの不均一なダイナミクスとネットワーク形成の力学

Nafisa Begam;...; Frank Schreiber(2021.3, Phys. Rev. Lett.)[Kinetics of Network Formation and Heterogeneous Dynamics of an Egg White Gel Revealed by Coherent X-Ray Scattering] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 X線光子相関分光法と超小角X線散…

CFTRを発現する塩類細胞を含めた気道上皮階層性の見直し

Daniel T. Montoro;...;Jayaraj Rajagopal(2018.8, nature)[A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 肺の気道は、喘息や嚢胞性線維症での主な疾患部位である。ここでは、単細胞RNAシー…

気道上皮の単細胞解剖からCFTR豊富な肺塩類細胞が解明された

Lindsey W. Plasschaert;...; Aron B. Jaffe(Nature, 2018.8)[A single-cell atlas of the airway epithelium reveals the CFTR-rich pulmonary ionocyte] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 上皮組織の機能は、組織が含んでいる分化細胞の種類、量、分布…

微小管細胞骨格の渦を起こす不安定性

David B. Stein;....;Raymond E. Goldstein(2021.1, PHYSICAL REVIEW LETTERS)[Swirling Instability of the Microtubule Cytoskeleton] 理由 ラボSlackに来てたかな 概要 原形質流動の細胞現象において、微小管ネットワークに沿って貨物を運搬する分子モー…

イソギンチャクDiadumene lineataにおける集団遺伝構造に対するクローン性の寄与

Will H Ryan;...;Stacy A Krueger-Hadfield(2021.1, Journal of Heredity)[The Contribution of Clonality to Population Genetic Structure in the Sea Anemone, Diadumene lineata] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 生態過程や進化過程は、遺伝的多様…

瞬時の原形質のゲル化を介する真菌の創傷治癒

Tu Anh Nguyen;..;Gregory Jedd(2020.11, Current Biology)[Fungal Wound Healing through Instantaneous Protoplasmic Gelation] 理由 ラボSlackシリーズ 概要 多細胞生物は流体輸送ネットワークを活用して、拡散の制限を克服し、必須の長距離輸送を促進す…

後生動物の進化と発生における対称性の変換

Valeria V. Isaeva;...;Nickolay V. Kasyanov (2021.1, Symmetry)[Symmetry Transformations in Metazoan Evolution and Development] 理由 ラボSlackに流れ着いたやつ 概要 この総説では、後生動物の進化と発生、遺伝的基盤そして異なる軸のボディプランの…

集団性細菌は局所的で動的な相転移を受けてストレス誘導性のバイオフィルムを構成する。

Iago Grobas;...;Munehiro Asally(2020.8, bioxiv)[Swarming bacteria undergo localized dynamic phase transition to form stress-induced biofilms] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 自己組織的な多細胞行動によって、細胞は単離された細胞より大きな度…

シクロスポリンAがある条件とない条件の伸長した心筋虚血/再灌流に従う免疫反応の時間ダイナミクス

Vitali Rusinkevich;...;Huang-tian Yang(2019.3, Acta Pharmacologica Sinica)[Temporal dynamics of immune response following prolonged myocardial ischemia/reperfusion with and without aA] 理由 どこかで見つけたけど忘れた 概要 遅い心筋再潅流に…

ナマコゲノムによって、形態の進化や内臓再生の知見が得られる

Xiaojun Zhang;...;Jianhai Xiang(2017.10, PLOS Biology)[The sea cucumber genome provides insights into morphological evolution and visceral regeneration] 理由 ラボセミナーで紹介されてた 概要 脊索動物と共通祖先を共有しているにも関わらず、ナ…