これはブログではない

生物学(主に理論生物学)の論文を書くために読みます

2021-01-01から1年間の記事一覧

つるばら"Red Queen"の茎のトゲの空間パタンの発見とパタンの数理モデル

Kazuaki Amikura;...;Miho S. Kitazawa (2021.7, Scientific Reports)[Discovery of spatial pattern of prickles on stem of Rosa hybrida ‘Red Queen’ and mathematical model of the pattern] 理由 昔bioRxiv版を論文紹介したやつが査読を通ったようなの…

胚形成における円状パタン形成の収縮-反応-拡散モデル

Tiankai Zhao,;...;Hongyan Yuan(2021.5, bioRxiv)[A contraction-reaction-diffusion model for circular pattern formation in embryogenesis] 理由 ラボSlackだっけ? 概要 反応拡散モデルは、発生生物学におけるパタン形成を理解するのに広く用いられて…

上皮の折りたたみが、カブトムシの角の最終形を決定する

Hiroki Gotoh; ... + Laura CLavine (2021.8, Current Opinion in Genetics & Development)[Epithelial folding determines the final shape of beetle horns] 理由 夏付近のセミナーかなんかで見つけた 概要 コガネムシに見られる無数のツノのような、性淘…

皮膚の再生能力と免疫系

Tsepkolenko A;...; Giri S. (2019.)(2019.7,Clin Cosmet Investig Dermatol.)[The regenerative potential of skin and the immune system. ] 理由 自分の研究関連 概要 皮膚は、治療と複雑な免疫過程のネットワークによって制御される死細胞の置換を行う自…

細菌、戦艦、そしてそれ以上の革新の景観

Terence C. Burnhama and Michael Travisano(2021.6, PNAS)[The landscape of innovation in bacteria, battleships, and beyond] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 細菌実験進化と海戦からの教訓を示し、金融市場での革新の理解を促進する。主な金融革新は…

光シグナルと触覚感知の高度な伸縮性の電界発光皮膚

C. Larson;...;R. Shepherd(2016.3, Science)[Highly stretchable electroluminescent skin for optical signaling and tactile sensing] 理由 こないだ読んだ論文の発展 概要 タコのような頭足類は、伸縮性の皮膚と色調節組織を組み合わせて、視覚意思伝達…

頭足類に触発される、オンデマンドの蛍光パターニングの電子-力学-化学反応性エラストマーの設計

Qiming Wang;...;Xuanhe Zhao(2014.9, Nature Communications)[Cephalopod-inspired design of electro-mechano-chemically responsive elastomers for on-demand fluorescent patterning] 理由 こないだ読んだ関連論文 概要 頭足類は、選択的に筋肉を収縮す…

カメレオンから誘発される伸縮性の電子肌は、触覚感知で制御される双方向の色変化を持つ

Ho-Hsiu Chou;...; Zhenan Bao(2015.8, Nat Commun)[A chameleon-inspired stretchable electronic skin with interactive colour changing controlled by tactile sensing.] 理由 こないだ読んだ論文の関連で見つけた 概要 カメレオンや頭足類のようないく…

テクスチャ合成に対する応用反応拡散モデル

Allen R. Sanderson;...;Lingfa Yang(2006, Journal of Graphics Tools )[Advanced Reaction-Diffusion Models for Texture Synthesis] 理由 反応拡散の復習 概要 1990年代初頭に反応拡散モデルを用いたテクスチャ号合成が導入されてから、それはまだ広く活…

脊椎動物の皮膚パターンの局所的な促進-抑制モデル

David A.Young(1984.11, Mathematical Biosciences)[A local activator-inhibitor model of vertebrate skin patterns] 理由 自分の研究関連 概要 脊椎動物の皮膚パターンのモデルは、2種類の拡散性因子(促進因子と抑制因子)を産生する分化した(色のある)色…

自然から人工へのカモフラージュ:要素とシステム

Yang Li and Nikolaus Correll(2018.9, bioRxiv)[From Natural to Artificial Camouflage: Components and Systems] 理由 色の変化とかパターンについて調べてて見つけた 概要 作動、受容そして分散コンピューティングを含む生物に誘発される人工カモフラー…

マクロファージは後胚期の組織再構成の間に長距離シグナリングを中継する

Dae Seok Eom; David M. Parichy(2017.3, Science)[A macrophage relay for long-distance signaling during postembryonic tissue remodeling] 理由 パタン形成と免疫の関係で面白そうだったので 概要 マクロファージは免疫だけでなく、発生や恒常性におい…

目立つ体と尻尾の色を持つトカゲにおける真皮色素胞の超構造

Takeo Kuriyama;...;Masami Hasegawa(2006.9, Zoolog Sci.)[Ultrastructure of the dermal chromatophores in a lizard (Scincidae: Plestiodon latiscutatus) with conspicuous body and tail coloration] 理由 自分の研究と関連しそうなので 概要 身体に縞…

鰓外胚葉の発生中の弾性不安定性がエリマキトカゲのエリの折りたたみを生じさせる。

Sophie A Montandon;...;Michel C Milinkovitch(2019.6, eLife)[Elastic instability during branchial ectoderm development causes folding of the Chlamydosaurus erectile frill] 理由 ラボセミナー 概要 エリマキトカゲ(Chlamydosaurus kingii)の華々し…

水は、成長する水生植物の葉の形態形成に影響する

Fan Xu;...;Yifan Yang(2020.1, PHYSICAL REVIEW LETTERS)[Water Affects Morphogenesis of Growing Aquatic Plant Leaves] 理由 これもラボセミナーで出てきたはず 概要 水の上に浮かぶハスの葉は、中心に向かって減少するような短波長の端の縮みをいつも受…

共通の発生プログラムが、異なる葉の形態を生み出せる

Adam Runions;...; Przemyslaw Prusinkiewicz (2017.3, New Phytologist)[A common developmental program can produce diverse leaf shapes] 理由 ラボセミナーかなんかで話題になったやつ? 概要 真性双子葉植物の葉は、驚くほど多様な形態を持つ。本論文…

骨の外形を計算する3次元トポロジー最適化モデル

Sakashita M;...Kondo S; (2021.6, PLOS Computational Biology) [Three-dimensional topology optimization model to simulate the external shapes of bone.] 理由 ラボSlackに流れてきました 概要 骨の形が形成されるメカニズムを解明することは、脊椎動…

前翅の斑点が少ないビシクラス・アニナナのチョウの捕食傾向

Ian Z. W. Chan;...;Antónia Monteiro(2021.5, Proc. R. Soc. B.)[Predation favours Bicyclus anynana butterflies with fewer forewing eyespots] 理由 Twitterで流れてきた・・・? 概要 タテハチョウの後翅に比べて前翅の斑点は少ないが、この不均一な分…

とげのある貝殻の形態形成の物理基盤と収斂進化

Régis Chirat;...;Alain Goriely(2013.4, PNAS)[Mechanical basis of morphogenesis and convergent evolution of spiny seashells] 理由 ラボセミナーで流れてきたやつ 概要 収斂進化は、関係が近くない種で独立に同じ特徴が進化する現象である。そして収斂…

ナミビアのフェアリーリングと上皮細胞は幾何学的秩序の創発を共有する

Haozhe Zhang and Robert Sinclair(2015.6, Ecological Complexity)[Namibian fairy circles and epithelial cells share emergent geometric order] 理由 なんかで見つけた・・けど忘れた・・・。 概要 フェアリーリングは、ナミブ砂漠の景観の謎の特徴であ…

幾何学的に無秩序な材料の細胞フーリエ解析

Antoine Fruleux and Arezki Boudaoud(2021.4, Phys. Rev. Research)[Cellular Fourier analysis for geometrically disordered materials] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ? 概要 多くの媒体は、不規則な形と大きさの基本単位に分割されている。例えば、磁…

我々な細菌を変える:皮膚におけるプロバイオティクス

Y Yu;...;A Alikhan (2020.1, Br J Dermatol)[Changing our microbiome: probiotics in dermatology] 理由 自分の研究関係 概要 背景:共生細菌は、ヒトの健康と疾患発症における主な因子である。最近、腸内細菌だけでなく、皮膚細菌とそれが多様な皮膚疾患…

寛解は炎症の終了か?

Karen T. Feehan; Derek W. Gilroy(2019.2, Trends in Molecular Medicine)[Is Resolution the End of Inflammation?] 理由 自分の研究関連 概要 制御できない炎症は、関節リウマチを含む大量の慢性疾患の発症における重要な要因である。研究では、これらの…

寒冷蕁麻疹に伴う抗GT1a抗体およびGQ1b抗体による感染症後の感覚神経障害

Elisabetta Zucchi;...;Jessica Mandriol(2018.10, Journal of Clinical Neuroscience)[Post-infectious sensory neuropathy with anti-GT1a and GQ1b antibodies associated with cold urticaria] 理由 自分の研究関連 概要 64歳女性が、物理的蕁麻疹の稀な…

深刻な全身炎症の新しい寛解調節因子

Gudernatsch V;...;Mirakaj V.(2020.9, Immunotargets Ther) [Novel Resolution Mediators of Severe Systemic Inflammation.] 理由 自分の研究関連 概要 肺血症や急性呼吸器疾患そして多臓器不全のような深刻な炎症過程の根底にある特徴である、寛解しない…

Gray-Scottモデルにおける電場誘導性空間パターン形成の多様な性質を解明する

Amitava Giri and Sandip Kar(2019.3, The Journal of Chemical Physics)[Unraveling the diverse nature of electric field induced spatial pattern formation in Gray-Scott model] 理由 ラボSlackに来た・・っけ? 概要 イオン性反応物と自己触媒で構成…

ニューロン内での時空間的に制御された遺伝情報の編集

Isabel C Vallecillo-Viejo;...;Joshua J C Rosenthal(2020.3, Nucleic Acids Research)[Spatially regulated editing of genetic information within a neuron] 理由 Twitterで流れてきてびっくりしたやつ 概要 真核生物において、ミトコンドリアとプラスチ…

状態依存的な内部駆動がある生物リミットサイクル振動子における一般的な揺らぎ-散逸定理の違反

Janaki Sheth;...Alex J. Levine(2021.5, PHYSICAL REVIEW RESEARCH)[Violation of generalized fluctuation-dissipation theorem in biological limit cycle oscillators with state-dependent internal drives: Applications to hair cell oscillations] …

活発に変形可能な3D液滴の形態

Liam J. Ruske and Julia M. Yeomans(2021.4, PHYSICAL REVIEW X)[Morphology of Active Deformable 3D Droplets] 理由 ラボSlackに流れてきた 概要 3次元での活発なネマティック液滴の形態とディスクリネーション線を数値的に調べる。我々のモデルはアキラ…

安定結婚問題:物理学者の観点からの学際的総説

Enrico MariaFenoaltea;...;Yi-ChengZhang(2021.6, Physics Reports)[The Stable Marriage Problem: An interdisciplinary review from the physicist’s perspective] 理由 ラボSlackに流れてきたやつ 概要 ここでは、複雑系関連分野に携わる物理学者の間で…