これはブログではない

生物学(主に理論生物学)の論文を書くために読みます

Mathematical model in Immunity

HIV感染推定の数理的方法:数学的総説

Xiaodan Sun;...;Yanni Xiao(2020.1, Theoretical Biology and Medical Modelling)[Modeling methods for estimating HIV incidence: a mathematical review] 理由 TBMM読もうキャンペーン 概要 HIVの感染を推定することは、この感染の疫学を観察し、検査と…

自己組織化モデルが老化のシステム的特徴を解明する

Yin Wang;..; Xianzheng Sha(2020.3, BMC Theoretical Biology and Medical Modelling)[The self-organization model reveals systematic characteristics of aging] 理由 TBMMを読もうキャンペーン 概要 背景 老化は基本的な生物学的過程であり、重要なバイ…

不均一性が高い集団における単純な伝染病ネットワーク

María del ValleRafo; Juan PabloAparicio(2020.2, Journal of Theoretical Biology)[Simple epidemic network model for highly heterogeneous populations] 理由 JTBの新着論文 概要 病気の伝染やダイナミクスのネットワークモデルは最も単純なエージェン…

蕁麻疹の多様な発疹の単純な反応拡散方程式

Sungrim Seirin-Lee;...;,Michihiro Hide(2020.1, PLOS)[A single reaction-diffusion equation for the multifarious eruptions of urticaria] 理由 自分の研究に(めちゃ)近いので 概要 蕁麻疹は一般的な皮膚疾患であり、局所的に皮膚の浮腫が急に現れて消…

病因となるサイトカイン間の空間的相互作用による乾癬の皮膚パターニング

Lee Ringham;..;Robert Gniadecki(2019.10, iScience)[Skin Patterning in Psoriasis by Spatial Interactions between Pathogenic Cytokines] 理由 自分の研究に近い論文が出ていた 概要 ヒト皮膚疾患の障害は単一の散在パターンから複雑なリングや螺旋まで…

宿主-ウイルス競合の時空間ダイナミクス:インフルエンザAのモデル研究

John Whitman;....;Ciriyam Jayaprakash(2020.1, Journal of Theoretical Biology)[Spatio-temporal dynamics of Host-Virus competition: A model study of influenza A] 理由 JTBの新しい論文に免疫の時空間ダイナミクスの内容があったので 概要 ここでは…

残留分割法とその応用に基づく伝統的な中国医学と臨床の生化学的指標における症状の要素間の関係の再解析の数理モデル

Jin R;...;Zhao Q.Zhong(2011.8, Xi Yi Jie He Xue Bao.)[A mathematical model for re-analysis of the relationship between essence of syndromes in traditional Chinese medicine and clinical biochemical indicators based on the residual-split met…

鍼治療の数理モデルの開発に向けて

Friedman MJ, Birch S, Tiller WA. (1989, Acupunct Electrother Res. )[Towards the development of a mathematical model for acupuncture meridians.] 理由 漢方の話2 概要 古来の鍼治療と中国医学の伝統的な概念は、西洋とは全く異なる文化から来ており…

中国のブラックボックス-伝統的な漢方の科学モデル

Matthias Theodorou; Johannes Fleckenstein(2019.2, Journal of Acupuncture Research)[The Chinese Black Box – A Scientific Model of Traditional Chinese Medicine] 理由 こないだ気になった漢方の数理モデルの論文 概要 伝統的な漢方(TCM)のモデルは、…

免疫細胞の相互作用のシステムモデルによって、ヒトの皮膚組織における炎症メカニズムを解明する

Najl V. Valeyev;...;Frank O. Nestle(2012, 12)[A Systems Model for Immune Cell Interactions Unravels the Mechanism of Inflammation in Human Skin] 理由 研究内容が近いので。 概要 炎症の特徴は、高度に相互依存的な方法で細胞集団から産生されるサ…

サルコイドーシスの数理モデル

Hao, Wenrui;...;Friedman, Avner(2014.11, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA)[Mathematical model of sarcoidosis] 理由 Th17/Tregについて調べたので 概要 サルコイドーシスは肉芽腫と呼ばれる結節する炎…

炎症性腸疾患:TNF-α抑制はどのくらい効果的か?

Wing-Cheong Lo;...;Avner Friedman(2016.11, PLOS ONE)[Inflammatory Bowel Disease: How Effective Is TNF-α Suppression?] 理由 T細胞の分化や種類について調べる機会があったので 概要 クローン病(CD)は腸内細菌に対する不適切な反応の結果である。初期…

貯まったバイオマーカー評価に基づいた診断正確性の共変量調節性測定の評価

McMahan, Christopher S.;...;Schisterman, Enrique F.(2016.7,BIOMETRICAL JOURNAL)[Estimating covariate-adjusted measures of diagnostic accuracy based on pooled biomarker assessments] 理由 炎症性サイトカイン5 概要 症状検出のために被ばくレベル…

NeuroRDF:アルツハイマー病のバイオマーカー候補の優先順位付けのための高度に精選されたデータの意味論的統合

Iyappan, Anandhi;..;Senger, Philipp (2016.7,JOURNAL OF BIOMEDICAL SEMANTICS)[NeuroRDF: semantic integration of highly curated data to prioritize biomarker candidates in Alzheimer's disease] 理由 炎症性サイトカイン4 概要 背景:神経変性疾患…

円形脱毛症の数理モデル

Dobreva, Atanaska...;Cogan, N. G.(2015.9, Journal of Theoritical Biology) [Mathematical model for alopecia areata] 理由 炎症性サイトカイン3 概要 円形脱毛症(AA)は自己免疫疾患で、その臨床表現型は頭皮や体の他の部分での明確な無毛パタン形成が特…

小膠細胞における動的NF-κBの定量的特徴化と解析

Sheppard, Patrick W.;...;Khammash, Mustafa(2011.7)[Quantitative characterization and analysis of the dynamic NF-kappa B response in microglia] 理由 炎症性サイトカイン2 概要 背景:小膠細胞におけるNF-κB転写因子の活性化とその関連遺伝子発現は…

肺での粒子状物質に晒されることに続く炎症と繊維症のエージェント・ベースモデル

Brown, Bryan N.;...;Vodovotz, Yoram(2011.6)[An agent-based model of inflammation and fibrosis following particulate exposure in the lung] 理由 炎症関係を勉強するために今回から炎症性サイトカインの論文です 概要 炎症と気道リモデリングは多様な…

アテローム性動脈硬化の初期段階の常微分方程式モデル:免疫反応のメカニズム

Anna Ougrinovskaia:...;Mary R. Myerscough(2010.8)[An ODE Model of Early Stages of Atherosclerosis: Mechanisms of the Inflammatory Response] 理由 アテローム性動脈硬化症の反応拡散モデルについての論文を読んでから、また別の著者で似たものを見つ…

自己免疫疾患モデルの動的特性:寛容、発火、静止

Iwami, Shingo;..;Kajiwara, Tsuyoshi(2007.6)[Dynamical properties of autoimmune disease models: Tolerance, flare-up, dormancy] 理由 岩見先生シリーズ7。さいごです 概要 自己免疫疾患のメカニズムは長年難問のままだ。この論文では、個人の免疫反応…

鳥インフルエンザの流行予防:どの方針を選ぶべきか?

Iwami, Shingo;...;Liu, Xianning(2008.6)[Prevention of avian influenza epidemic: What policy should we choose?] 理由 岩見先生シリーズ6 概要 鳥インフルエンザのヒト間伝染は ほとんど報告されておらず、限定的で非効率的、そして非持続的だと考えら…

鳥インフルエンザ流行:我々は流行を防げるか?

Iwami, Shingo;...;Liu, Xianning(2009.3)[Avian flu pandemic: Can we prevent it?] 理由 岩見先生シリーズ5 概要 東南アジア、ヨーロッパ、そしてアフリカでの病原体H5N1鳥インフルエンザの高い発生率によって、家禽が衝撃的な結果を受け、数多くのヒトが…

HIVによる細胞間感染はウイルス感染の半数以上の原因となる

Iwami, Shingo;...;Koyanagi, Yoshio(2015.10)[Cell-to-cell infection by HIV contributes over half of virus infection] 理由 岩見先生シリーズ4 概要 感染した細胞が周囲の非感染細胞に接触することで起こる細胞間感染はウイルス感染の重要な方法として…

鳥インフルエンザの大流行の予防のための最適制御戦略

Jung, Eunok;...;Jo, Tae-Chang(2009.9)[Optimal control strategy for prevention of avian influenza pandemic] 理由 岩見先生シリーズ3 概要 ヨーロッパへのH5N1ウイルスの拡大と東南アジアでのヒトへの感染の継続が流行の危機を高めている。幸運なことに…

ワクチン接種戦略のあるSVIR流行モデル

Liu, Xianning;..;Iwami, Shingo(2008.7)[SVIR epidemic models with vaccination strategies] 理由 岩見先生シリーズ2 概要 感染症の根絶にはワクチン接種が重要である。ワクチン接種過程を終えるには、大抵、服用量は数回に分けて考えられ、二回の服用の間…

鳥-ヒトインフルエンザの流行モデル

Iwami, Shingo; ...;Liu, Xianning(2007.5)[Avian-human influenza epidemic model] 理由 数理生物の主催をしていた岩見先生シリーズ1 概要 鳥界から人間界への鳥インフルエンザの拡大を解釈するための数理モデルを提案する。この数理モデルによって、ヒトが…

C型肝炎ウイルスの遺伝型1と2のウイルス動態における違い

Neumann, AU;...;Layden, TJ(2000.7)[Differences in viral dynamics between genotypes 1 and 2 of hepatitis C virus] 理由 免疫分野の数理モデルの論文 概要 多くの研究によって、遺伝型2のC型肝炎ウイルスに感染した患者は遺伝型1の患者よりもIFNα治療に…

クラミジア・トラコマチス感染の再感染しやすさにおける制御プログラムの予期せぬ影響

Brunham, RC;...;Rekart, ML(2005.11)[The unexpected impact of a Chlamydia trachomatis infection control program on susceptibility to reinfection] 理由 免疫分野の数理モデルの被引用数6位 概要 背景:イギリス、コロンビア、カナダにクラミジア・ト…

周期的な症状のクリオピリン関連の患者のインターロイキン1βの生体内制御

Lachmann, Helen J.;...;Bosset, Sophie(2009.5)[In vivo regulation of interleukin 1 beta in patients with cryopyrin-associated periodic syndromes] 理由 免疫分野の数理モデルの論文の被引用数の第5位 概要 ヒトの炎症性障害のインターロイキン1βの調…

誰が誰に感染するのか?南アフリカの移民と非移民カップル間のHIV-1の一致と不一致

Lurie, MN;....;Karim, SSA(2003)[Who infects whom? HIV-1 concordance and discordance among migrant and non-migrant couples in South Africa] 理由 免疫分野の数理モデルの被引用数4位の論文 概要 目的:移民と非移民の男性と彼の田舎のパートナー間の…

帯状疱疹に対する水痘追加免疫の摘発:水痘に対する集団予防接種の包含

Brisson, M;...;Andrews, NJ(2002.6)[Exposure to varicella boosts immunity to herpes-zoster: implications for mass vaccination against chickenpox] 理由 免疫学の数理モデルの論文 概要 帯状疱疹に対する水痘追加免疫の摘発を確かめるかめにデータを…