Pattern formation
Yusuke Hara;..;Takeharu Nagai(2020.6, bioRxiv)[Cellular logics bringing the symmetry breaking in spiral nucleation revealed by trans-scale imaging] 理由 自分が参考文献にしている論文を引用している文献を見つけたので 概要 多様なシグナル伝達系…
Derek Michael Forrester (2015.3, Medical Hypotheses)[Self-assembled multi-ring formations of glutamine and a possible link to erythema gyratum repens] 理由 自分の研究関連 概要 体内には多量のL-グルタミンがあり、細胞の増殖に必要である。実際…
Satoru Okuda;...;Mototsugu Eiraku(2018.2, Scientific Reports )[Combining Turing and 3D vertex models reproduces autonomous multicellular morphogenesis with undulation, tubulation, and branching] 理由 セミナーでちょっと出てきた 概要 本研究…
Christopher B. Kaelin;...;Gregory S. Barsh(2020.11, bioRxiv)[Developmental Genetics of Color Pattern Establishment in Cats] 理由 Twitterで流れてきた 概要 複雑な色パターンは、ネコ科における形態的多様性の定義された側面である。形態学的と1細胞…
Seita Miyazawa(2020.12, Science Advances )[Pattern blending enriches the diversity of animal colorations] 理由 Twitterで流れてきたので 概要 動物は、鮮やかな多様な皮膚のパターンを示すが、この多様性の根底にあるメカニズムは、特に複雑かつ迷彩…
Hironori Fujita;...;Masayoshi Kawaguchi(2018.4 PLOS Comp)[Spatial regularity control of phyllotaxis pattern generated by the mutual interaction between auxin and PIN1] 理由 これもラボSlackかなぁ 概要 葉序は、植物の茎での葉の配列であり、そ…
Karin R. L. van der Burg;...;Robert D. Reed(2020.11, Science)[Genomic architecture of a genetically assimilated seasonal color pattern] 理由 Twitterかなんかで流れてきたんじゃなかろうか 概要 発生的可塑性によって、ゲノムは環境の刺激に応答し…
Eric M. Kramer & Michael H. Borkowski(2004.7, Trees)[Wood grain patterns at branch junctions: modeling and implications] 理由 木目のパターンが気になったので 概要 2つの木の分岐間の接点の木目パターン形成の最近のモデルを用いる。モデルのシミュ…
Jacqueline E. Moustakas-Verho,;...;Scott F. Gilbert(2014 Development)[The origin and loss of periodic patterning in the turtle shell] 理由 ラボSlackに落ちてたやつ 概要 20億年前のカメの甲羅の起源は、羊膜類のボディプランを徐々に修正してきた…
Ali Nematbakhsh;...;Mark Alber (2020.8, PLOS Computational biology)[Epithelial organ shape is generated by patterned actomyosin contractility and maintained by the extracellular matrix] 理由 ラボSlackに落ちてたので 概要 上皮シートは発生中…
Toshiya Ando; Teruyuki Niimi(2019.1, Develop Growth Differ. )[Development and evolution of color patterns in ladybird beetles: A case study in Harmonia axyridis] 理由 ラボセミナーで紹介されてておもしろそうだったので 概要 多くの生物は体に多…
Bas Jacobs;...;Eva E.Deinum(2020.10, Journal of Theoretical Biology)[Robust banded protoxylem pattern formation through microtubule-based directional ROP diffusion restriction] 理由 JTBの最近の記事 概要 植物の維管束組織発生において、異なる…
S. S. Liaw;...; T. Hong(2001.9, PHYSICAL REVIEW E,)[Turing model for the patterns of lady beetles] 理由 ラボにテントウムシの図鑑が置いてあったので 概要 特定の種類のチューリングモデルをテントウムシの硬い羽根のパターン形成のシミュレーション…
Sabri Gokmen(Performative and Interactive Architecture, 2013.9)[A Morphogenetic Approach for Performative Building Envelope Systems Using Leaf Venetian Patterns] 理由 Twitterで流れてきたんだっけか 概要 デザインに基づくパフォーマンスにおけ…
M. A. R. Koehl:...:L. Mahadevan(Integrative and Comparative Biology, 2008.7)[How kelp produce blade shapes suited to different flow regimes: A new wrinkle] 理由 これも雑談の中で出てきたんじゃなかったか 概要 大型藻類の多くは、急な流れの水に…
T. Kinoshita;...; J.B. Gurdon(2006.10, Developmental Cell)[Two‐dimensional morphogen gradient in Xenopus: Boundary formation and real‐time transduction response] 理由 ノーベル賞2012年医学生理学賞 概要 モルフォゲン勾配は、胚でのパターン形成…
Nikos Karaiskos;...;Robert P. Zinzen(2017.10, Science)[The Drosophila embryo at single-cell transcriptome resolution] 理由 数理生物で見つけたやつ 概要 形態形成の開始において、ショウジョウバエ胚は異なる遺伝子の組み合わせを発現する約6000個の…
Koji Noshita;...;TakenoriSasaki(2016.1, Journal of Theoretical Biology)[Geometric analysis and estimation of the growth rate gradient on gastropod shells] 理由 数理生物で話を聞いて面白かったので 概要 腹足類の貝殻の形態によって貝殻の開口部…
Jennifer A Zallen; Eric Wieschaus (2004.3, Developmental cell)[Patterned Gene Expression Directs Bipolar Planar Polarity in Drosophila] 理由 「理論生物学」第4章4-2「多細胞体形態形成のための細胞モデル」の参考文献 概要 ショウジョウバエにおけ…
Hisao Honda(1978.6, Journal of Theoretical Biology)[Description of cellular patterns by Dirichlet domains: The two-dimensional case] 理由 「理論生物学」第4章4-2「多細胞体形態形成のための細胞モデル」の参考文献 概要 ディリクレ領域による細胞…
鱗甲Wen Yang;...;Joanna McKittrick(2015.9, Acta Biomaterialia)[The armored carapace of the boxfish] 理由 サンプリングに行ったときにハコフグを見てその可愛さに気づいた 概要 ハコフグ(Lactoria cornuta)は、真皮の甲羅で構成される装甲を持つ。これ…
Hiroyuki Kitahata and Masanobu Tanaka(2018.9, Biophys Physicobiol.)[Mathematical approach to unpinning of spiral waves anchored to an obstacle with high-frequency pacing] 理由 螺旋波を探しています 概要 螺旋波は多様な反応拡散系で観察される…
Valery Petrov;...;Harry L. Swinney(1997.8, nature)[Resonant pattern formation in achemical system] 理由 螺旋波の勉強をしてるときに見つけた 概要 非線形の振り子に応用される周期的な力は、周期が同調する振り子を生じさせる。これは、適応的な周期…
George von Dassow;...;Garrett M. Odell (2000.7, nature)[The segment polarity network is a robust developmental module] 理由 「理論生物学」第2章2-3 「生体分子制御ネットワークの構造の力学的解明」の参考文献 概要 昆虫はすべて相同な分節を持つが…
R. T. Liu, S. S. Liaw, and P. K. Maini(2006.7, PHYSICAL REVIEW E)[Two-stage Turing model for generating pigment patterns on the leopard and the jaguar] 理由 twitterで見かけた 概要 斑点はネコ科の初期パターンであり、ロゼットと病斑を含む他の…
Krishna Kant Lawania and Priyanka Mathur(2015.11, IOSR Journal of Environmental Science, Toxicology and Food Technology)[Study On The Pattern And Archetecture Of Spider’s Web With Special Reference To Seasonal Abundance In Eastern Region O…
NatsukiHemmi;...;HirokiOda(2018.5, Developmental Biology)[A quantitative study of the diversity of stripe-forming processes in an arthropod cell-based field undergoing axis formation and growth] 理由 セミナーで紹介されてたので 概要 節足動…
Judit Horváth;...;Patrick De Kepper(2009.5, Science)[An Experimental Design Method Leading to Chemical Turing Patterns] 理由 これもストックしてたやつ 概要 化学的な反応拡散パターンはしばしば生物系におけるパターン形成の原型を与える。しかし、…
Baoqing Ding;...;Yao-Wu Yuan(2020.3, Current biology)[Two MYB Proteins in a Self-Organizing Activator-Inhibitor System Produce Spotted Pigmentation Patterns] 理由 どこかで見つけた論文 概要 多くの生物は、視覚的に魅力的な点や縞の色素パターン…
John R. Finnerty(2005.11, Bioessays)[Did Internal Transport, Rather Than Directed Locomotion, Favor the Evolution of Bilateral Symmetry in Animals?] 理由 ラボで紹介されてたので 概要 左右相称動物の標準的な説明は、直接的な移動に対して放射相…
