Pattern formation
Wenlin Li;...;Nick V. Grishin(2019.3, PNAS)[Genomes of skipper butterflies reveal extensive convergence of wing patterns] 理由 蝶のはねって綺麗だよね 概要 数世紀の間、生物学者は進化を推測するために形態を用いてきた。この数十年の間に、手軽な…
A. Gierer & H. Meinhardt(1972, Kybernetik)[A theory of biological pattern formation] 理由 生物のパタン形成に関する古い論文 概要 形態形成における必須過程の一つは、ほとんど均一な組織から始まる組織構造の空間パターンの形成である。自己触媒また…
Daljit Singh J. Dhillon;...;Matthias Zwicker(2017, Bull Math Biol)[Bifurcation Analysis of Reaction Diffusion Systems on Arbitrary Surfaces] 理由 Milinkovitch先生の論文 概要 この論文では、生物のパターン形成における表面幾何の効果を調べるた…
António F. Martins;...;Michel C. Milinkovitch(2018.10, nature communications)[Locally-curved geometry generates bending cracks in the African elephant skin] 理由 こないだ教えてくれた論文の著者の別のやつ 概要 隙間の複雑なネットワークは、ア…
Luis MiguelDe Oliveira Vilaca;...;RicardoRuiz-Baier(2019.5, Journal of Computational Physics)[Numerical approximation of a 3D mechanochemical interface model for skin patterning] 理由 こないだ紹介された論文の著者の別論文 概要 界面によって…
Liana Manukyan;...;Michel C. Milinkovitch(2017.4, Nature)[A living mesoscopic cellular automaton made of skin scales] 理由 副査の先生に論文の説明に行ったら、関連論文で教えてくれた 概要 脊椎動物において、皮膚の色パターンは細胞間相互作用の非…
Shigeru Kondo & Rihito Asai(1995, Nature)[A reaction–diffusion wave on the skin of the marine angelfish Pomacanthus] 理由 論文書くときに先行研究を調べていたので 概要 1952年に、Turingは反応拡散系と呼ばれる分子メカニズム仮説を提案した。これ…
Stuart C.Burgess;...;Rick Hyde(2006.6, Optics & Laser Technology) [An analysis of optimal structural features in the peacock tail feather] 理由 鳥の羽シリーズ。何回目だっけ 概要 この論文では、クジャクの尾羽における最適な構造的な特徴の解析…
Cheng‐Ming Chuong;...; Randall Widelitz(2012.5, WIREs developmental biology)[Module‐based complexity formation: periodic patterning in feathers and hairs] 理由 鳥の羽について気になったので 概要 パターンは、均質性から生じるオーダーで表現す…
Richard O. Prum; Scott Williamson(2002.3, THE ROYAL SOCIETY)[Reaction–diffusion models of within-feather pigmentation patterning] 理由 羽毛について気になったので 概要 羽毛は複雑な、ケラチン構造の分岐であり、色素パターンの多様性を示す。真皮…
Stuart Burgess(200.8, INTERNATIONAL CONFERENCE ON ENGINEERING DESIGN)[AESTHETICS IN NATURE: CASE STUDY OF THE PEACOCK TAIL FEATHERS] 理由 鳥の羽模様2 概要 自然には、美しい形態や質感の例が多く存在する。加えて、自然はクジャクの誇示羽のように…
José M. Medina;...;Pete Vukusic(2015.3, Optics EXPRESS)[Classification of peacock feather reflectance using principal component analysis similarity factors from multispectral imaging data ] 理由 形態形成について色々話してたら、鳥の羽ってど…
Yoshinobu Nagashima;...;Yoshihisa Oda(2018.8, Scientific reports)[A Rho-based reaction-diffusion system governs cell wall patterning in metaxylem vessels] 理由 セミナーで話を聞いて面白かったので 概要 Rho GTPasesは細胞極性とパターン形成にお…
Mara D. Rueda-Contreras;...;Rafael A. Barrio(2018.8, PLOS ONE)[Curvature-driven spatial patterns in growing 3D domains: A mechanochemical model for phyllotaxis] 理由 セミナーで出てきたので 概要 ここでは、植物の頂端分裂組織(SAM)における葉序…
Lee Ringham;..;Robert Gniadecki(2019.10, iScience)[Skin Patterning in Psoriasis by Spatial Interactions between Pathogenic Cytokines] 理由 自分の研究に近い論文が出ていた 概要 ヒト皮膚疾患の障害は単一の散在パターンから複雑なリングや螺旋まで…
Chandra N Jack;...;Joan E Strassmann(2008.10, BMC)[Segregate or cooperate- a study of the interaction between two species of Dictyostelium] 理由 ラボセミナーで紹介されていたので 概要 背景 進化生物学における主な挑戦は、特に一つのグループや…
Kazuaki Amikura, Hiroshi Ito(2019.10, bioRxiv)[Discovery of the prickle patterning on the stem of rose and the mathematical model of the pattern] 理由 Twitterで見て、面白い研究だなと思ったので 概要 生物の多くの発生パターンが、因子の拡散に…
Rob Castel;...; Ronald Koes(2010.5, Jornal of experimental Botany)[Inflorescence development in petunia: through the maze of botanical terminology] 理由 ラボセミナーで紹介されていたので 概要 花を咲かせる植物は様々な方法で彼らの花を配列する…
西浦廉政(2003.2, 岩波書店)[自己複製と自己崩壊のパターンダイナミクス] 理由 理論の勉強 概要 グレイスコットモデル 数値結果：島状のスポットが次々と分裂し、領域を埋め尽くした後は消滅と分裂を繰り返す。 問題提起：「分裂」や「消滅」さらに解がどの…
A. J. Koch; H. Meinhardt(1994, Rev. Modern Physics)[Biological Pattern Formation : from Basic Mechanisms to Complex Structures] 理由 Pattern formationの論文 概要 高度に複雑な生物の確かな発生は、好奇心をそそる魅力的な問題である。一般に、基…
J.D.Murray; M.R.Myerscough(1991.4, Journal of Theoretical Biology)[Pigmentation pattern formation on snakes] 理由 生物のパターン形成 概要 ヘビの皮膚で見られる共通な、簡単もしくは複雑なパターンのいくつかをs作る細胞走性モデルメカニズムを考え…
Deborah R. Fowler;...;Przemyslaw Prusinkiewicz(1992, )[Modeling seashells] 理由 生物のパターン形成のモデル 概要 この論文では、画像合成過程に適する貝殻のモデリング法のを示す。これは貝殻表面の上皮パターンの活性-抑制モデルがある貝殻の形の地理…
David A.Young(1984.11, Mathematical Biosciences)[A local activator-inhibitor model of vertebrate skin patterns] 理由 生物のパターン形成の勉強 概要 脊椎動物の皮膚パターンのモデルは、活性性と抑制性の異なる2つの拡散性モルフォゲンを産生するも…
F. Borgogno;...;L. Ridolf(2009.3, Reviews of Geophysics)[Mathematical models of vegetation pattern formation in ecohydrology] 理由 植物のパターン形成を調べてたらなんか見つけた 概要 高度に組織化された植物のパターンは世界中の多くの見られる。…
Pau Atela;Christophe Gol´e:Scott Hotton(2002.7, Journal of Nonlinear Science)[A Dynamical System for Plant Pattern Formation: A Rigorous Analysis] 理由 植物のパターン形成を勉強 概要 植物のパターン形成をモデリングする離散動的システムの厳密…
Titikan Somboon;...;On-Uma Kheowan(2015.1, Phys. Chem. Chem. Phys.)[The effect of acetone on the dynamics of temporal oscillations and waves in the ruthenium-catalyzed Belousov–Zhabotinsky reaction] 理由 螺旋とか環状のパターンを勉強するた…
Francesc Sagués; Irving R. Epstein(Dalton Transactions)[Nonlinear chemical dynamics] 理由 BZ反応のパタン形成を勉強する 概要 非線形化学ダイナミクスの学際領域は、過去30年でかなり幅広くそして深くなった。その主題と応用は数学や物理学、生物学と…
M. R. MYERSCOUGH;...;K. J. PAINTER(1998, Bulletin of Mathematical Biology)[Pattern Formation in a Generalized Chemotactic Model] 理由 パタン形成の数理モデルの勉強 概要 多くのモデルが、発生学における空間パターン形成のために提案され、ゼロフ…
G.Catalano;...;A.MonroyE.Parisi(1981.8, Physica D: Nonlinear Phenomena)[A mathematical model for pattern formation in biological systems] 理由 タイトルの通り。 概要 生物学の問題における応用に関する反応拡散方程式の系を理論的かつ数値的に研究…
Philip K. Maini;...; Helene Nguyen Phong Chau(1997, Journal of the Chemical Society, Faraday Transactions)[Spatial pattern formation in chemical and biological systems] 理由 Pattern FormationのMathematical model 概要 発生生物学における中心…
