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Yoshihiro Yamanishi;...;Susumu Goto(2014.7, Nucleic Acids Res)[DINIES: drug–target interaction network inference engine based on supervised analysis] 理由 実験医学数理モデル特集の第4章18. 「データ駆動型の創薬」の参考文献 概要 DINIES(教師つ…
Satoshi Iraha;...;Michiko Mandai(2018.3, Stem Cell Reports)[Establishment of Immunodeficient Retinal Degeneration Model Mice and Functional Maturation of Human ESC-Derived Retinal Sheets afterTransplantation] 理由 実験医学数理モデル特集の…
R N Bergman; … ; C Cobelli(1981, J Clin Invest.)[Physiologic evaluation of factors controlling glucose tolerance in man: measurement of insulin sensitivity and beta-cell glucose sensitivity from the response to intravenous glucose.] 理由 …
Mika Sakurai-Yageta;...;Yoshinori Murakami(2015.3, PLoS ONE)[Dynamic Regulation of a Cell Adhesion Protein Complex Including CADM1 by Combinatorial Analysis of FRAP with Exponential Curve-Fitting] 理由 実験医学数理モデル特集の第4章1. 「細…
Taiki SHIGEMATSU;...; Shigeo WADA(2016.10, Journal of Biomechanical Science and Engineering)[Line tension of the pore edge in phospholipid/cholesterol bilayer from stretch molecular dynamics simulation] 理由 実験医学数理モデル特集の第3章5.…
Nidhi Sahni;..;Vidal M(2015.4, Cell)[Widespread macromolecular interaction perturbations in human genetic disorders.] 理由 実験医学数理モデル特集の第3章2. 「DNAバーコードによる生命科学実験の限界突破」の参考文献 概要 生物学的ネットワークの…
Georg WKreutzberg(1996.8, Trends Neurosci. )[Microglia: a sensor for pathological events in the CNS.] 理由 実験医学数理モデル特集の第2章4. 「ホモロジーの概念を用いた組織画像解析法」の参考文献 概要 ミクログリア細胞の大きな特徴は、CNSにおけ…
Thomas C. Sykes;...;Mark C. T. Wilson(2020.2, PHYSICAL REVIEW FLUIDS)[Surface jets and internal mixing during the coalescence of impacting and sessile droplets] 理由 なんかTwitterで流れてきたやつ 概要 同一もしくは異なる表面張力をもつ液滴の…
Hungtang Ko and David L. Hu(2020.2, Journal of the royal society interface)[The physics of tossing fried rice] 理由 これもTwitterで見かけて面白かったやつ 概要 炒飯は1500年の歴史がある料理であり、中華鍋を用いて調理し、燃やすことなく1200℃で…
Basem Al-Shayeb;...; Jillian F. Banfield(2020.2, nature)[Clades of huge phages from across Earth’s ecosystems] 理由 Twitterで見かけたので 概要 通常バクテリオファージは、小さなゲノムを持ち、複製に宿主を必要とする。ここでは、多様な生態系から…
Natalia Petrovskaya; Wenxin Zhang(2020.3, Journal of Theoretical Biology)[When seeing is not believing: Comparative study of various spatial distributions of invasive species] 理由 JTBのアラートで流れてきたやつ 概要 生物学的侵略者の空間パ…
Masaki Hoso* and Michio Hori(2008.10, The American Naturalist)[Divergent Shell Shape as an Antipredator Adaptation in Tropical Land Snails] 理由 これも面白そうだと思ったやつ 概要 多くの陸上カタツムリは、熱帯においておどろくほど多様な貝殻の…
Masaki Hoso;...;Michio Hori(2007.2, Biology Letters)[Right-handed snakes: convergent evolution of asymmetry for functional specialization] 理由 昔どこかで読んだ論文 概要 多様な動物に見られる外部の非対称性は、環境要件を満たす重要な機能を生…
Takenori Sasaki;...;Masato Hoshino(20188.10, Biomineralization)[3D Visualization of Calcified and Non-calcified Molluscan Tissues Using Computed Tomography] 理由 もうどこで見つけたかも分かんなくなった 概要 生物学と古生物学における形態学的…
Annika Roth;...;Martin Beye(2019.3, PLOS BIOLOGY)[A genetic switch for worker nutrition-mediated traits in honeybees] 理由 ラボのSlackに落ちてた論文 概要 高度に社会的な昆虫は、繁殖可能な女王と不妊の働きバチとの間に生殖器官のサイズが異なる…
Nathaniel N. Goldberg and Oliver M. O'Reilly(2020.1, Phys. Rev. E)[Mechanics-based model for the cooking-induced deformation of spaghetti] 理由 Twitterで見かけて面白いなと思ったので 概要 この論文では、調理誘導的なスパゲッティの変形の最小モ…
Anand U. Oza;...;Michael J. Shelley(2019.11, PHYSICAL REVIEW X)[Lattices of Hydrodynamically Interacting Flapping Swimmers] 理由 Twitterで見つけた 概要 魚の群れや鳥の群れは複雑な集団ダイナミクスを示すが、その自己組織的な原理はほとんど分か…
Cheng-Chia Tsai,;...;Nanfang Yu(2020.1, Nature Communications)[Physical and behavioral adaptations to prevent overheating of the living wings of butterflies] 理由 Twitterで見かけて面白そうだったので 概要 鱗翅目の羽は、機能するために適切な…
Naoko Kaneko;..;Kazunobu Sawamoto(2017.3, J Neurochem. )[Mechanisms of neuronal migration in the adult brain] 理由 ラボセミナーの予習 概要 成人の神経発生は約60年前に最初に観察され、現在も神経化学の研究分野に成長している。多くの最近の研究は…
Takaishi M;...;Tominaga M.(2013.10, J Physiol Sci.)[Inhibitory effects of monoterpenes on human TRPA1 and the structural basis of their activity] 理由 議論の予習 概要 一過性受容体電位チャネルの一つであるTRPA1は、侵害受容と炎症性の痛覚に関…
Takaishi M;...; Tominaga M(2016.5, J Physiol Sci.)[Reciprocal effects of capsaicin and menthol on thermosensation through regulated activities of TRPV1 and TRPM8.] 理由 議論の予習 概要 一過性受容器電位バニロイド1(TPPV1)は気温の上昇によって…
FUMITAKA FUJITA; MASAYUKI TAKAISHI(2015.7, H&PC today)[COLD PERCEPTION ON SKIN SURFACE THROUGH THERMO- RECEPTORS A REVIEW] 理由 議論の予習 概要 冷たさを感じる能力は生存に必須である。薬品や食品、歯磨き粉や化粧品製剤によく含まれるメントール…
Qiran Chen;...;Tohru Suzuki(2018.12, General and Comparative Endocrinology)[Expression profiles of RA synthases and catabolic enzymes in newly hatched and metamorphosing larvae of Japanese flounder, Paralichthys olivaceus] 理由 ヒラメとカ…
Suzuki T:...:Hashimoto H.(2009.10, Dev Growth Differ. )[Metamorphic pitx2 expression in the left habenula correlated with lateralization of eye-sidedness in flounder.] 理由 ラボで雑談してたら、カレイとヒラメの左右はなんで決まってるんだろう…
Peter Schippers;...;Roderick Hunt(2001.11, Nordic Society Oikos)[Herbaceous Plant Strategies in Disturbed Habitats] 理由 ラボセミナーで出てきて面白かったので 概要 体系的な理論評価は、成体の寿命と種子の寿命、そして種子量の3つの重要な植物の…
Tetsuhiro S Hatakeyama;Kunihiko Kaneko(2018.8, )[Symmetry breaking in relaxation paths in allosteric molecules: enzymatic kinetically constrained model] 理由 金子先生シリーズ 概要 時間スケールの階層性は生物系の至る所に存在し、そこでは酵素…
Jumpei F Yamagishi, Nen Saito, Kunihiko Kaneko(2019.4, arXiv)[The advantage of leakage of essential metabolites and resultant symbiosis of diverse species] 理由 金子先生シリーズ 概要 微生物集団はかなりの多様性を示す。単一の栄養源が制限され…
Atsushi Kamimura, Kunihiko Kaneko(2019.6, Life)[Molecular Diversity and Network Complexity in Growing Protocells.] 理由 金子先生シリーズ 概要 細胞の中には、分子要素の素晴らしい多様性が包まれている。細胞複製のためにそれらの要素のそれぞれが…
Yuma Fujimoto, Kunihiko Kaneko(2019.5, Phys.Rev.Research.)[Emergence of Exploitation as Symmetry Breaking in Iterated Prisoner's Dilemma] 理由 金子先生シリーズ 概要 社会には、相互協力、逃亡そして非対称な搾取関係は一般的である。協力と放棄は…
Tomoki Kurikawa;....;Kunihiko Kaneko(2019.6, arXiv)[Repeated sequential learning increases memory capacity via effective decorrelation in a recurrent neural network] 理由 金子先生シリーズ 概要 神経系における記憶は、神経と外部入力下の学習ダ…
